Далёкое тысячелетие назад, когда планета, ранее не носившая названия Мира Шиноби, была населена обычными людьми, она подверглась вторжению двух иномирян, звавшими себя членами клана Ооцуцуки. Планета, которую они настигли в очередной раз, должна была стать местом посадки саженца Божественного Древа.
Но Кагуя Ооцуцуки, молодая женщина, что должна была стать жертвой принесения для роста Божественного Древа, привязалась к этой планете. И вместо её уничтожения она предала соклановца, прибывшего с ней. Оставив того умирать, Кагуя решила изучить народ, населявший здешние земли. Ею руководило желание принести мир, чтобы люди более не знали боли и печали.
Но как только в мире началась война между двумя странами, и Кагуя застигла смерть собственной служанки, она потеряла веру в человечество. Боль, ненависть и гнев смешались в ней. И Ооцуцуки решила съесть священный плод Божественного Древа, пойдя наперекор запрету собственного клана, чтобы восстановить порядок на планете.
Обретя богоподобную силу, Кагуя использовала технику Бесконечного Цукиёми, взяв народы под свой контроль. Но дабы предотвратить вымирание рода людского, богиня освободила часть людей из бесконечного гендзюцу, стёрла им память, а остальную часть позже превратила в собственную армию, больше не походившую на людей. Она боялась, что её соклановцы в скором времени придут за ней, чтобы забрать чакру.
Много воды утекло с тех пор. У богини родились близнецы-сыновья, которым была уготована судьба запечатать собственную мать. После заключения Десятихвостого в ядро Чибаку Тенсей, Хамура, младший брат, отправился на Луну вместе с немногочисленными остатками своего клана, а Хагоромо, старший, остался на планете и позже создал «Кредо Ниндзя», учение, которое, по задумке Ооцуцуки, должно было привести людей к эпохе мира.
Однако Хагоромо всё же был в смятении. Их с братом мать была запечатана, но тревожные мысли о том, что кто-то в будущем сможет освободить Кагую, всё больше и больше наполняли его голову. И тогда будущий Мудрец Шести Путей принял решение создать союзников на другой планете, чтобы в случае угрозы Миру Шиноби те помогли своим братьям и сёстрам из другого мира.
Ооцуцуки, временно оставив данный мир под присмотром своих последователей, отправился на другую планету, именуемую Землёй. Много лет Рикудо Сеннин проповедовал своё учение, и вскоре оно быстро разрослось по территории Древней Японии. С каждым годом всё больше и больше землян вдавалось в учение Ниншуу. И когда Хагоромо понял, что ещё одни люди, унаследовавшие его волю, готовы к самостоятельному пути, он покинул Землю...