Следующий участок стены был построен в период с 1366 – 1644 гг. Он проходит по 40-й параллели от Аньдуна (40°), чуть севернее Пекина (40°), через Иньчуан (39°) до Дуньхуан и Аньси (40°) на западе. Этот участок стены – последний, самый южный и самый глубоко проникающий в территорию Китая.
В Китае в это время правила династия Мин (1368 – 1644 гг.). В начале 15 века эта династия проводила не защитную политику, а внешнюю экспансию. Так, например, в 1407 г. китайского войска захватили Вьетнам, то есть территории, располагающиеся за пределами восточного участка «Китайской» стены, построенного в 1368 – 1644 годы. В 1618 г. России удалось договориться с Китаем о границе (миссия И. Петлина).
Во время постройки этого участка стены к российским территориям относилось всё Приамурье. К середине 17-го века на обоих берегах Амура уже существовали русские крепости-остроги (Албазинский, Кумарский и др.), крестьянские слободы и пашни. В 1656 было образовано Даурское (позднее – Албазинское) воеводство, в которое входила долина Верхнего и Среднего Амура по обоим берегам.
С китайской стороны – с 1644 года в Китае стала править династия Цин. В 17-м веке граница империи Цин проходила чуть севернее Ляодунского полуострова, то есть точно по этому участку «Китайской» стены (1366 – 1644 гг.).
В 1650-е годы и позднее Цинская империя попыталась военной силой захватить русские владения в бассейне Амура. На стороне Китая выступали также и христиане. Китай требовал не только всё Приамурье, но все земли к востоку от Лены. В результате, по Нерчинскому договору (1689 г.) Россия была вынуждена уступить Цинской империи свои владения по правому берегу р. Аргунь и на части левого и правого берегов Амура.
Таким образом, в период строительства последнего участка «Китайской» стены (1368 – 1644 гг.) именно китайская сторона (Мин и Цин) вела захватнические войны по отношению к российским землям. Поэтому Россия была вынуждена вести оборонительные пограничные войны с Китаем (см. С.М. Соловьев, «История России с древнейших времен», том 12, глава 5).
Построенная русскими к 1644 году «Китайская» стена проходила точно по границе России с Цинским Китаем. В 1650-е годы Цинский Китай вторгся на русские земли на глубину до 1500 км, что было закреплено Айгуньским (1858 г.) и Пекинским (1860 г.) договорами.