По данным ряда учёных, около 85% растений выделяют в окружающую среду фитонциды — вещества, тормозящие развитие или губящие микроорганизмы (аналогичные вещества, выделяемые низшими растениями, называются антибиотиками). Часто фитонцидные растения одновременно являются и инсектицидными, поэтому часть рекомендаций по их использованию можно найти в предыдущем разделе.
Кроме того, сведения по борьбе с болезнями, отпугиванию вредителей, улучшению хранения собранного урожая приводятся в приложениях.
Возможно также, что благодаря фитонцидам некоторые растения привлекают врагов ряда вредителей. Так, пастернак привлекает паразитов гусениц капустной совки, следовательно, его вредителя. Если кусты караганника (так называемой жёлтой акации — Caragana arborescens) опрыснуть соком из побегов чёрной смородины, побеговая галлица смородины отложит на них яйца и личинки потом погибнут от бескормицы.
Влияют фитонциды и на высшие растения, что служит предпосылкой для создания агрофитоценозов, подавляющих развитие сорняков. Так, гликозид абсентин, выделяемый листьями горькой полыни (Artemisia absinthium), попадая в почву, тормозит прорастание семян ряда видов растений, а у других (шалфей, тмин, любисток) — угнетает рост. Так, любисток (Levisticum officinale, сём. Сельдерейные — Apiaceae) даже погибал, если рос на расстоянии меньше 1 м от полыни.
Фитонциды могут оказывать и положительное влияние. Например, рост и развитие яблони и груши, их морозостойкость усиливаются под действием фитонцидов тополя чёрного и клёна ясенелистного. Обработка фитонцидами клёна уменьшает повреждение плодов плодожоркой.