В 2011 году Килиан перебрался в футбольный центр «Клерфонтен», где находится одна из самых известных во всём мире футбольных академий, выпускниками которой являются, например, Тьерри Анри, Николя Анелька, Вильям Галлас и многие другие знаменитые футболисты. Чтобы сын мог успевать на тренировки, Вилфрид Мбаппе тратил по нескольку часов в день на дорогу туда и обратно. Пять дней в неделю Килиан тренировался в «Клерфонтене», а по выходным уезжал домой в Бонди играть против парней на несколько лет старше. Юный нападающий провёл в «Клерфонтене» два года, а после окончания обучения попал в сферу интересов сразу нескольких европейских топ-клубов. В частности, талантливым подростком заинтересовались «Ливерпуль», «Бавария» и мадридский «Реал». В декабре 2012-го, за полгода до выпуска Килиана из «Клерфонтена», «сливочные» пригласили 14-летнего юношу вместе с отцом на базу клуба, чтобы убедить семью Мбаппе выбрать «Реал». Активно уговаривал молодого футболиста сам Зинедин Зидан, который на то время был советником президента клуба Флорентина Переса. На базе клуба состоялась первая встреча Килиана Мбаппе и Криштиану Роналду.
Молодой парень наконец увидел вживую своего героя, за чьей игрой пристально наблюдал в детстве. Руководство мадридского клуба сделало всё возможное, чтобы заполучить Мбаппе, но родители Килиана не без оснований опасались, что в статусной команде юный футболист будет попросту ограничен в игровой практике. Это могло сыграть решающую роль в развитии Килиана, поэтому свой выбор семья Мбаппе остановила на футбольном клубе «Монако», который только вернулся в высший французский дивизион и планировал создать прочную основу для будущих успехов не без помощи талантливых и одарённых французских игроков.
«У нас зафиксированы убытки. Нужно сбалансировать систему расходов и доходов “Монако”. Также у нас есть проблемы с Лигой 1. Президенту клуба пришлось даже выплачивать 50 миллионов евро из своего кармана», – рассказывал российский бизнесмен и вице-президент «Монако» Вадим Васильев осенью 2015 года. Французский клуб выбрал новый вектор развития: отказался от дорогостоящих игроков, продал несколько звёздных футболистов и намеревался серьёзно урезать бюджет.
И вот в июле 2013-го Килиан Мбаппе оказался в «молодёжке» футбольного клуба «Монако», планировавшего остаться в сильнейшем французском дивизионе на долгие годы. Подписавший трёхлетний молодёжный контракт 14-летний парень моментально заявил о себе в рядах академии «монегасков», впечатляя тренеров и партнёров по команде. Дебют Килиана за молодёжную команду «Монако» состоялся в декабре 2014 года. Соперником «монегасков» стал санкт-петербургский «Зенит».
«Монако» играл с «сине-бело-голубыми» в рамках турнира Юношеской лиги УЕФА. Юные «зенитовцы» обыграли французскую команду со счётом 3:1, Мбаппе отыграл полчаса, появившись на поле со скамейки запасных. При этом Килиан успел отметиться результативным действием – нападающий сделал голевую передачу.
Молниеносный прогресс молодого игрока был отмечен главным тренером первой команды «Монако» Леонардо Жардимом. Уже в октябре 2015-го португальский специалист привлёк Килиана к тренировкам с резервной командой. Никого не удивил тот факт, что спустя всего три недели Мбаппе занимался уже непосредственно под руководством Жардима вместе с основными футболистами «Монако». Задержаться в резерве у Килиана возможности не было – уровень его мастерства и футбольной зрелости требовал перевода нападающего на следующий, более высокий уровень.