В 1480-х Боттичелли достиг вершины славы. Его мастерскую буквально заваливали заказами, справиться с которыми самостоятельно у мастера не было никакой возможности. Большую часть работы выполняли его ученики, которые неплохо имитировали манеру своего патрона.
В это же время живописец получил заказ от своего благодетеля Лоренцо ди Пьерфранческо Медичи на исполнение картины «Паллада и Кентавр» (1482, Галерея Уффици, Флоренция). Он поставил перед художником задачу — показать могущество, силу и мудрость представителя династии Медичи. По его желанию, картина была выполнена как аллегория «золотого века» медичейской Флоренции. Боттичелли же еще больше расширил рамки сюжета, введя в него так же идею борьбы добра и зла. Поэтому образ богини, исполненный красоты, живописец противопоставляет Кентавру. Платье Паллады украшено эмблемами дома Медичи. За ее спиной изображен прекрасный пейзаж с глубоким и бездонным небом, в то время как Кентавр стоит на фоне полуразрушенной античной постройки, что было призвано символизировать его невежество.
Многие исследователи творчества Боттичелли полагают, что в основе его произведения — идеи философа Марсилио Фичино: «Зверь в нас — это инстинкт, человек в нас разум». Поэтому можно иначе прочитать изображенное мастером, который как бы зримо разделяет человека на два начала: животное связано исключительно с потребностями тела, а божественное — со сферой духа, разумом и высокими устремлениями.
В этой трактовке сюжета жест Паллады можно рассматривать как то, что она своими руками держит в подчинении все природные инстинкты. Лицу Кентавра живописец придал выражение глубокого страдания, свойственное святым на его картинах.
Еще одним многоплановым произведением является полотно «Венера и Марс» (1482–1483, Национальная галерея, Лондон). Видимо, работа была выполнена по заказу одного из представителей дома Веспуччи и, возможно, написана к свадьбе кого-то из членов семьи. Об этом говорит тот факт, что в правом верхнем углу композиции изображен геральдический символ рода осиное гнездо с кружащими насекомыми.
Произведение имеет удлиненный по горизонтали формат. Весь его первый план занимают фигуры возлежащей в задумчивости Венеры и расслабленного, спящего Марса. Позади них маленькие сатиры играют с оружием грозного бога войны. Во второй половине XV века во Флоренции широкое распространение получила астрология, поэтому представленных на полотне героев можно трактовать не только как олимпийских богов, но и как аллегорическое изображение планет. Колорит произведения отличается величественной сдержанностью. Центральная сцена построена на равновесии фигур отдыхающих героев и шалящих малышей — путти.
Помимо аллегорических полотен, наполненных философским смыслом, мастер много работал и над картинами других жанров. Так, например, по заказу семьи Пуччи он создал тондо «Поклонение волхвов» (около 1473, Национальная галерея, Лондон), «Новеллу о Настаджио дельи Онести» (1487, Прадо, Мадрид), а также для Торнабуани Боттичелли расписал виллу Лемми.
Одной из самых примечательных работ этого времени является так называемый «Алтарь Барди» (1485, Государственный музей, Берлин), полное название которого звучит как «Мадонна с Иоанном Крестителем и Иоанном Богословом». Алтарный образ был написан Боттичелли по заказу Джованни ди Аньоло Барди для его капеллы в церкви Санто Спирито. Композиционное построение произведения отличатся строгой каноничностью — в центре на богато украшенном троне с Младенцем на руках восседает Царица Небесная, по обе стороны от нее — святые Иоанн Креститель и Иоанн Богослов. Их фигуры, изображенные на фоне трехарочной садовой беседки, живописец уподобляет статуям. Но при всем этом «Алтарь Барди» сильно отличается от всего того, что было создано мастером раннее.
Линии более четкие, даже несколько жесткие, что можно отметить в «орнаменте», образуемом листвой. Образ Мадонны, ранее представленный художником как величественно-торжественный, в этой работе полон совершенно других интонаций: он исполнен печали и тревоги за судьбу Сына. Черты лица, кисти рук Марии более удлиненные, хрупкие и неземные.
Значительную роль в произведении играют такие теологические символы, как, например, лилии, оливы, лавры и пальмы — намек на воплощение Христа.
С начала 1480-х мастер все больше тяготеет к подобного рода композициям. Среди различных по своему характеру заказов его наиболее привлекали алтарные образы. Из этого числа работ наиболее примечательны «Алтарь святого Варнавы» (другое название — «Мадонна на троне со святыми Екатериной Александрийской, Августином, Варварой, Иоанном Крестителем, Игнатием и Михаилом Архангелом», около 1487, Галерея Уффици, Флоренция), «Мадонна Магнификат» (другое название — «Величание Мадонны», около 1483–1485, Галерея Уффици, Флоренция), «Мадонна с гранатом» (около 1487, Галерея Уффици, Флоренция).
Художник снискал себе огромную славу.
Известность его была столь велика, что когда герцог Миланский спросил, кто является лучшим живописцем во Флоренции, то услышал однозначный ответ, что это, несомненно, — Боттичелли, «который превосходно может писать как на стене, так и на доске, и картины которого отличаются необычайной силой и совершенством пропорций».