31 марта 1940 года на «Щ-309» был назначен новый командир — капитан-лейтенант Кабо. 18 мая лодка отправилась в Кронштадт, где ей предстоял плановый ремонт после участия в военной кампании. 20 мая радостные моряки увидели сквозь утреннюю дымку красавец Кронштадт, стоявшие на рейде корабли, и вскоре попали в объятия друзей. За полугодие, прошедшее с того дня, как «Дельфин» покинул Кронштадт, его экипаж приобрел боевый опыт, стал более зрелым. Новые знания надо было закрепить в дальнейшей боевой учебе.
Произошли изменения и на Балтике. Летом 1940 года трудящиеся Эстонии, Латвии и Литвы свергли ненавистные им буржуазные правительства и создали свои пролетарские республики, добровольно вступившие в великое братство народов — Союз Советских Социалистических Республик. Краснознаменный Балтийский флот получил новые военно-морские базы, вышел на простор Балтийского моря.
Перед кораблями флота встала неотложная задача — в короткий срок освоить морской театр. Поэтому днем и ночью, в плохую видимость и в хорошую совершались плавания в Таллин, Либаву, Ригу, Клайпеду, в прилегающие к ним заливы и бухты. Во время плаваний отрабатывались различные учебные задачи.
Да и международная обстановка не допускала снижения темпов боевой подготовки.
Пожар войны, охвативший Европу, приближался к советским границам. «Над миром бушует пламя второй мировой войны, — писало в своем обращении Политуправление Краснознаменного Балтийского флота, — льется кровь юношей, стариков и детей, горят города, уничтожаются огромные материальные и культурные ценности…» Политуправление призывало личный состав к постоянной боевой готовности, к настойчивой, с полным напряжением сил, боевой учебе.
12 июня 1941 года «Щ-309» вышла в очередной учебно-тренировочный поход, на этот раз в Рижский залив. Кроме штатного личного состава на лодке находились мичманы, стажировавшиеся после окончания училища. Цель похода — отработка торпедных стрельб, которая обычно является завершающим этапом боевой подготовки экипажа, подытоживающим его длительный труд. На таких учениях проверяется умение личного состава подводного корабля скрытно подойти к кораблям «противника», определить элементы их движения, произвести точный залп по избранной цели и незаметно отойти.
…Еще до рассвета лодка заняла «боевую» позицию и приступила к поиску «противника», который мог появиться с любого направления. В отсеках почти осязаемая тишина. Все предельно сосредоточены. У перископа — старший помощник командира капитан-лейтенант Семен Зосимович Тращенко. Едва он обнаружил быстроходный корабль «противника», как по кораблю была объявлена «боевая тревога». Лодка начала свою первую в этом учебном походе торпедную атаку.
«Щ-309» движется на перископной глубине, которую точно держит боцман Пронин. Командир электромеханической боевой части инженер-капитан-лейтенант Аверьянов приготовился не дать лодке всплыть после выпуска торпед. Волнуется мичман Фокин, руководивший подготовкой торпедистов и торпед. Наконец долгожданные команды:
— Аппараты товсь!
— Пли!
Легкие, один за другим, толчки и шипение воздуха ощутили и услышали в лодке все: две торпеды, выпущенные старшиной 2-й статьи Малявкиным, помчались навстречу цели.
Бесконечными показались минуты ожидания результатов атаки. Но вот на фок-мачте корабля-цели взвивается сигнал: «Атака проведена успешно!»
За первой последовали более сложные атаки: теперь «противник» имел сильное охранение. Торпедные атаки перемежались артиллерийскими стрельбами, всевозможными учениями по введению в строй поврежденных механизмов, по борьбе за живучесть корабля и другими. Экипаж лодки действовал во время всех этих учений слаженно и уверенно.
— Исключительно хорошо справляется личный состав со своими обязанностями по всем видам тревог, — заметил немногословный обычно капитан-лейтенант Тращенко. Эти слова не могли не доставить удовольствия команде: уж больно скуп был Семен Зосимович на похвалы. Но сейчас старпом был доволен, ведь успех учений — результат огромного труда, вложенного им и командиром электромеханической боевой части в обучение личного состава.
Учебный поход был напряженным и трудным. Однако возвращались в базу с большим подъемом. Каждый офицер, старшина и матрос твердо знали мудрое правило русского военного искусства: «Трудно в учении — легко в бою».
После учений «Щ-309» была переведена в первую линию боевых кораблей Краснознаменного Балтийского флота. За достигнутые успехи в боевой и политической подготовке командир 6-го дивизиона капитан 2 ранга М. В. Федотов объявил благодарность всему личному составу лодки, а старшины 2-й статьи Малявкин и Петрюк, старший краснофлотец Давыдов были сфотографированы у развернутого Знамени 2-й бригады подводных лодок.