В целях осуществления руководства органами и учреждениями прокуратуры действует возглавляемая Генеральным прокурором РФ Генеральная прокуратура РФ (ГП). ГП – высшее звено системы прокуратуры.
Структуру ГП составляют главные управления, управления и отделы (на правах управлений, в составе управлений), возглавляемые начальниками – старшими помощниками Генерального прокурора РФ. Заместитель начальника – помощник Генерального прокурора РФ. Начальник и заместитель назначаются и освобождаются от должности Генеральным прокурором РФ. В этих подразделениях работают старшие прокуроры и прокуроры.
Генеральный прокурор РФ имеет также советников, старших помощников и старших помощников по особым поручениям, статус которых соответствует статусу начальников управлений; помощников и помощников по особым поручениям, статус которых соответствует статусу заместителей начальников управлений.
Состав ГП входят: Главное организационно-инспекторское управление; Управление кадров; Главное управление по надзору за исполнением федерального законодательства; Главное управление по надзору за уголовно-процессуальной и оперативно-розыскной деятельностью; Управление криминалистики; Управление по надзору за исполнением законов о федеральной безопасности; Управление по обеспечению участия прокуроров в рассмотрении уголовных дел судами; Управление по обеспечению участия прокуроров в гражданском и арбитражном процессе; Управление по надзору за законностью исполнения уголовных наказаний; Управление правового обеспечения; Главное управление по надзору за следствием; Управление по надзору за производством дознания и оперативно-розыскной деятельностью; Управление по надзору за расследованием уголовных дел в центральных аппаратах Следственного комитета при прокуратуре РФ, Следственного комитета при МВД России, ФСКН России, ФССП России и ФТС России и др., а также на правах структурного подразделения – Главная военная прокуратура.
Указ Президента РФ «О полномочном представителе Президента РФ в федеральном округе» обусловил создание в рамках ГП управлений, координирующих деятельность прокуратуры на территориях, входящих в состав каждого федерального округа.
В ГП образуется коллегия в составе Генерального прокурора РФ (председателя), его первого заместителя и заместителей (по должности), других прокурорских работников, назначаемых Генеральным прокурором РФ. Коллегия ГП является совещательным органом. На заседаниях коллегии вырабатываются решения по наиболее актуальным вопросам организации и деятельности прокуратуры. Решения коллегии реализуются приказами и указаниями Генерального прокурора РФ.
Вопросы организации и осуществления прокурорского надзора, не требующие обсуждения коллегией , рассматриваются на оперативных совещаниях при Генеральном прокуроре РФ, его заместителях, а также в главных управлениях, управлениях и отделах (на правах управлений).
При ГП действует Научно-консультативный совет (для научного содействия органам и учреждениям прокуратуры в выполнении задач, возложенных на них Законом о прокуратуре).