А (adenine) — аденин
ADAR (adenosine deaminase) — аденозиндеаминаза
ADE (antibody-dependent enhancement; immune enhancement of disease) — феномен антителозависимого усиления инфекции
AGM (african green monkeys) — африканские зеленые обезьяны
AP-1 (activated protein-1) — активированный белок-1
AREs (adenine and uracil rich elements) — аденин-урацилобогащенные элементы
ARH (autosomal recessive hypercholesterolemia) — аутосомальная рецессивная гиперхолестеролемия
BTK (Bruton's tyrosine kinase) — брайтоновская тирозинкиназа
С (cytosine) — цитозин
CDKN1A (cyclin-dependent kinase inhibitor 1A) — циклинзависимый ингибитор киназы 1А
DC-SIGN (dendritic cell-specific intracellular adhesion molecule 3-grabbing nonintegrin) — внутриклеточная адгезионная молекула 3-захватывающего неинтегрина, специфического к дендритным клеткам
C4B (сomplement component 4B) — компонент комплемента 4В
dN/dS (rate of nonsynonymous to synonymous substitutions per site) — соотношение несинонимических замен (dN) к синонимическим заменам (dS)
DRs (short direct repeats) — короткие терминальные повторы
dsRNA (double-stranded RNA) — двуцепочечная РНК
EGF-R (epidermal growth factor receptor) — рецептор эпидермального фактора роста
EN (endonuclease) — эндонуклеаза
Env (viral envelope glycoprotein) — вирусный оболочечный гликопротеин
ERVs (endogenous retroviruses) — эндогенные ретровирусы
FAMs (fossil Alu-monomers) — «окаменелые» Alu-мономеры
FCMD (Fukuyama-type congenital muscular dystrophy) — врожденная мышечная дистрофия Фукуяма-типа
FcR (Fc receptor) — Fc-рецептор
FL (full-length) — полноразмерный (например, транспозон)
G (guanine) — гуанин
GALV (Gibbon are leukemia virus) — вирус лейкемии гиббонов
GlyCAMI (glycosylation-dependent cell adhesion molecule I) — молекула клеточной адгезии, зависящая от гликозилирования I
GM-CSF (granulocyte — macrophage colony stimulating factor) — гранулоцитмакрофаг колониестимулирущий фактор
GPCR (guanosine nucleotide-protein-coupled receptor) — гуанозиннуклеотидбелок-соединяющий рецептор
GR (glucocorticoid receptor) — глюкокортикоидный рецептор
G6PD (glucose 6-phosphate dehydrogenase) — глюкоза-6-фосфатдегидрогеназа
Н, НA (hemagglutinin) гемагглютинин (вируса гриппа)
HA (hyaluronic acid) — гиалуроновая кислота
HAART (highly active antiretroviral therapy) — высокоактивная антиретровирусная терапия
HCK (hematopoietic cell kinase) — гематопоэтическая клеточная киназа
HSPA1A (heat shock protein 1A) — белок теплового шока 1А
IFNгамма (interferon gamma) — интерферон гамма
IFNгаммаR1 (interferon gamma receptor 1) — рецептор гамма-интерферона 1
IL (interleukin) — интерлейкин
IL-1Ra (interleukin-1 receptor antagonist) — антагонист рецептора интерлейкина-1
iNOS (inducible nitric oxide synthase) — индуцибельная СО-синтаза
IRF (immune restoration phenomenon) — синдром восстановления иммунитета
ITRs (inverted terminal repeats) — инвертированные терминальные повторы
KS (Kindler syndrome) — синдрома Киндлера
LINE (long-terminal interspersed element) — длинный терминальный вставочный повтор
LLAPs (Legionella-like amoebal pathogens) — легионеллоподобные амебные патогены
LTA (lymphotoxin a) — лимфотоксин a
LTR (long terminal repeat) — длинный концевой повтор
MAPKK (mitogen-activated protein kinase kinase) — митогенактивированный белок киназы киназы
MBL (mannose binding lectin) — лектин, связывающий маннозу
MBP (mannose binding protein) — протеин, связывающий маннозу
MHC (major histocompatibility complex) — главный комплекс гистосовместимости
MR (mannose receptor) — маннозный рецептор
MTO (mitochondrial translation optimization gene homolog) — генный гомолог оптимизации митохондриальной трансляции
N, NA (neuraminidase) — нейраминидаза (вируса гриппа)
NEF, nef (negative regulatory factor) — негативно регулирующий фактор[1]
NEN (neutralization escape mutants) — мутанты ВИЧ, избегающие нейтрализации антителами
NWMs (New World monkeys) — приматы Нового Света
OAS (original antigenic sin) — первичный антигенный грех
ORF, Orf (open reading frame) — открытая рамка считывания
OWMs (Old World monkeys) — приматы Старого Света
PBS (primer binding site) — праймерсвязывающий сайт
PDI (protein disulfide isomerase) — протеиндисульфидизомераза
Pfu (plaque-forming-unit) — бляшкоформирующая единица
PKP (plakophilin) — плакофиллин
Pol II (RNA polymerase II) — РНК полимеразы II типа
PPT (polypurine tract) — полипуриновый тракт РНК
PS (phosphatidylserine) — фосфатидилсерин
PSGLI (P-selectin glycoprotein ligand-1) — Р-селектин гликопротеин лиганд-1
Pyk2 (proline-rich tyrosine kinase-2) — пролинобогащенная тирозинкиназа-2
QA (quinolinic acid) — квинолиновая кислота
REV, rev (regulator of expression of virus proteins) — регулятор экспрессии вирусных белков
RPE2-1 (ribulose-5-phosphate-3-epimerase transcript variant 2) — вариант 2 транскриптарибулозо-5-фосфата-3-эпимеразы
RT (reverse transcriptase) — обратная транскриптаза
SA (splice acceptor) — сайт акцептора сплайсинга
SAGs (superantigens) — суперантигены
SAPK (stress-activated protein kinase) — стресс-активированная протеинкиназа
SD (splice donor) — сайт донора сплайсинга
SINE (short interspersed element) — короткий вставочный элемент
SLE (systemic lupus erythematosus) — системный волчаночный эритематоз
Sp1 (specificity protein-1) — специфичный белок-1
SPICE (smallpox inhibitor of complement enzymes) — ингибитор ферментов комплемента ВНО
SPTA1 (a-spectrin gene) — ген a-спектрина 1
SS (Sjцgren's syndrome) — синдром Шегрена
STAT (signal transducer and activator of transcription) — сигнальный преобразователь и активатор транскрипции
T (thymine) — тимин
TAP (transporter associated with antigen processing) — транспортер, ассоциированный с антигенным процессингом
TAT, tat (transactivator of transcription) — трансактиватор транскрипции
TEs (transposable elements) — транспозабельные элементы
TLR (Toll-like receptor) — Toll-подобный рецептор
TNF (tumor necrosis factor) — фактор некроза опухолей
TRAIL (TNF-related apoptosis-inducing ligand) — TNF-связанный апоптоз-индуцирующий лиганд
UTR (untranslated region) — нетранслируемый регион
VDR (vitamin D receptor) — рецептор витамина D
VIF, vif (virion infectivity factor) — фактор инфекционности вириона
Aa (Aedes aegypti) — комар, разносчик возбудителя желтой лихорадки
Ag (Anopheles gambiae) — комар, разносчик возбудителя малярии
ALV (Avian leukemia viruses) — вирус птичьей лейкемии
BCG (Bacillus Calmette — Guerin) — бацилла Кальметта — Гирена
Ce (Caenorhabditis elegans) — свободноживущая нематода (круглый червь)
Dm (Drosophila melanogaster) — чернобрюхая дрозофила) — двукрылое насекомое, вид плодовой мухи (Drosophilidae) из рода дрозофил
EBV (Epstein — Barr virus) — вирус Эпштейна — Барра
Eh (Entamoeba histolytica) — син. амеба дизентерийная; вид амеб семейства
Endamoebidae, паразитирующих в кишечнике человека
Ei (Entamoeba invadens) — паразитическая амеба, специфичная для пойкилотермных животных, в большей степени для змей
EV (Ectromelia virus) — вирус эктромелии мышей
FeLV (Feline leukemia virus) — вирус кошачьей лейкемии
HBV (Hepatitis В virus) — вирус гепатита В
HСV (Hepatitis С virus) — вирус гепатита С
HERVs (Human endogenous retroviruses) — эндогенные ретровирусы человека
HHV (Human herpesvirus) — герпесвирус человека
Hs (Homo sapiens) — человек разумный
НТLV (Human T-cell leukemia virus) — вирус Т-клеточной лейкемии человека in vitro — «в стекле», т. е. в пробирке
in vivo — на живом организме
MLV (Murine leukemia viruses) — вирус мышиной лейкемии
Mm (Mus. musculus) — мышь домовая — вид грызунов рода домовых мышей
MMTV (Mouse mammary tumor virus) — вирус рака молочной железы мышей
Os (Oryza sativa) — рис посевной
per se — сам(а) (само, сами) по себе, в чистом виде
Pf (Plasmodium falciparum) — малярийный плазмодий, возбудитель тропической малярии
Sc (Saccharomyces cerevisiae) — пивоваренные дрожжи
SIV (Simian immunodeficiency virus) — вирус иммунодефицита обезьян
Sp (Schizosaccharomyces pombe) — гаплоидные аскомицетовые дрожжи
sp. (species) — вид
TIR (terminal inverted repeat) — терминальный инвертированный повтор
Tv (Trichomonas vaginalis) — влагалищная трихомонада, возбудитель трихомониаза
VACV (Vaccinia virus) — вирус вакцины
vice versa — наоборот
ВИЧ — вирус иммунодефицита человека (в тех случаях, когда это специально не оговорено, ВИЧ-1)
ВНО — вирус натуральной оспы
ДНК — дезоксирибонуклеиновая кислота
ЖКТ — желудочно-кишечный тракт
кб — килобазы
кДa — килодальтон
КРС — крупный рогатый скот
ЛПС — липополисахарид
мк — микрон
м. п. о. — миллион пар оснований
нм — нанометр
нт. — нуклеотид
пкг/мл — пикограммов в одном миллилитре
п. о. — пара оснований
РАМН — Российская академия медицинских наук
РНК — рибонуклеиновая кислота
СВИ — синдром восстановления иммунитета
СКС — социокультурная система
СПИД — синдром приобретенного иммунодефицита
т. п. о. — тысяча пар оснований