Эволюционная патология

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ

Авиценна (Абу Али Ибн Сина) . Канон врачебной науки. Книга IV, часть первая. — Ташкент, 1980.

Албертс Б., Брей Д., Льюис Дж. с совт. Молекулярная биология клетки: В 3-х т. // Пер. с англ. под ред. Г.П. Георгиева и Ю.С. Ченцова. — М., 1994.

Алешин В. В., Петров Н.Б. Условно нейтральные признаки // Природа. — 2003. — № 12. — С. 18–26.

Альштейн А. Д. Семейство Retroviridae // Общая и частная вирусология. — М., 1982. — Т. 2. — C. 240–289.

Алтухов Ю. П . Генетические процессы в популяциях. — М., 2003.

Андерсон Р. М., Мей Р. М. Моделирование пандемии СПИДа // В мире науки. — 1992. — № 7. — С. 6—10.

Андревс Х . Грипп Гонконг // Хроника ВОЗ. — 1970. — Т. 24, № 3. — С. 99–108.

Анисимов А. П. Факторы Yersinia pestis, обеспечивающие циркуляцию и сохранение возбудителя чумы в экосистемах природных сообществ. Сообщения 1 и 2 // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. — 2002. — № 3. — С. 3—23; № 4. — С. 3—11.

Архангельский Г. Ф . Большая холерная эпидемия 1852–1855 гг. её происхождение и значение // Архив суд. мед. и общей гигиены. — 1871. - № 4, раздел 6, С. 14–40.

Архангельский Г. Ф . Холерные эпидемии в Европейской России за 50 летний период 1823–1872 гг. — СПб., 1874.

Аст Г. Альтернативный геном // В мире науки. — 2005. — № 7. — С. 37–43.

Ахшарумов Д.Д . Чума последних годов XIX столетия. — Полтава, 1900.

Ахундова М . История Фредди Меркьюри. — Киев, 2005.

Бакулов И. А., Ведерников В.А., Семенихин А.Л. Эпизоотология с микробиологией. — М., 1997.

Балтазар М. (Baltazard M. ) Стойкость чумы в постоянных очагах // Журн. гиг. эпидемиол. (Прага). — 1964. — Vol. 8. — P. 333–343.

Бароян О. В . Очерки по мировому распространению важнейших заразных болезней человека. — М.,1967.

Бароян О. В . Современные данные по эпидемиологии и профилактике холеры Эль Тор. — М., 1967.

Бароян О. В . Судьба конвенционных болезней. — М., 1971.

Бароян О. В . Холера Эль Тор. — М., 1971.

Белиловский В. А., Гамалея Н. Ф., Бурда М. К. с соавт. Чума в Одессе. — Одесса, 1904

Белоцкий С. М., Авталион Р. Р. Воспаление и иммунный ответ в таблицах и рисунках. — М., 2006.

Беляков В. Д., Каминский Г. Ц., Голубев Д. Б., Тец В. В. Саморегуляция паразитарных систем. — Л., 1987.

Бердсли Т. Потерянный рай? // В мире науки. — 1993. — № 1. — С. 78–79.

Богуцкий В. М. Эпидемия чумы в Харбине и его окрестностях. — Противочумное бюро, Харбин, 1911.

Болотовский В. М . Полиомиелит // Руководство по эпидемиологии инфекционных болезней. — М., 1993.

Большая медицинская энциклопедия (под. ред. Н. А. Семашко). — М., 1932. — Т. 23. — С. 11.

Борисенков Е. П., Пасецкий В. М . Тысячелетняя летопись необычайных явлений природы. — М, 1988.

Борисов Л. Б. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология. — М., 2001.

Бразоль Л. Е. Дженнеризм и Пастеризм, критический очерк оснований оспопрививания. — Харьков, 1875.

Бужилова А. П. Homo sapiens. История болезни. — М., 2005.

Бургасов П. Н., Николаевский Г. П . Натуральная оспа. — М., 1972.

Бухарин О.В. Персистенция патогенных бактерий. — М., 1999.

Бухарин О. В., Литвин В. Ю. Патогенные бактерии в природных экосистемах. — Екатеринбург, 1997.

Бышевский А. Ш., Терсенов О. А . Биохимия для врача. — Екатеринбург, 1994.

Васильев К. Г., Сегал А. Е . История эпидемий в России. — М., 1960.

Васильев К. Г . Уроки гриппозной пандемии 1957 года // Сборник научных работ. — Рига, 1960. — С. 15–20.

Вертиев Ю. В. Бактериальные токсины: биологическая сущность и происхождение // Журн. Микробиол. — 1996. — № 3. — С. 43–46.

Введение в молекулярную медицину // Под ред. М. А. Пальцева. — М., 2004.

Вирусология // Под ред. Филдса Б, Найпа Д., Ченока З. и др. — М., 1989. — Т. 3.

Вогралик Г. Ф . Учение об эпидемических заболеваниях. — Томск, 1935.

Воробьев А. А., Быков А. С., Пашков Е. П. с соавт. Микробиология. — М., 1994.

Воробьев А. А. Не подводя черты. — М., 2003.

Впрюжский Д. И . Холерные больные в Николаевском военном госпитале в эпидемию последних годов и новейшее учение об этой болезни // Военно-медицинский журнал. — 1895. — Часть CLXXXIV, сентябрь. — С. 54–90.

Гавришева Н. А., Антонова Т. В. Инфекционный процесс: клинические и патофизиологические аспекты. — СПб., 1999.

Галактионов В. Г. Иммунология. — М., 1998.

Галактионов В. Г. Происхождение специфических иммуноглобулинов // Природа. — 2004. — № 7. — C. 40–46.

Галактионов В. Г. Эволюционная иммунология. — М., 2005.

Гамалея Н. Ф . Холера и борьба с ней. — Одесса, 1905.

Гамалея Н. Ф . Эпидемии последних лет. Холера. // Гигиена и санитария. — 1910. — Т. 1, № 2. — С. 156–170.

Гезер Г. История повальных болезней. — СПб., 1867.

Герштейн М., Дзю Чжен Подлинная жизнь псевдогенов // В мире науки. — 2006. — № 11. — С. 47–53.

Голубев Б. П. Экологические аспекты распространения вибрионов эль тор в объектах окружающей среды: Автореф. дис … канд. мед. наук. — Саратов, 1993.

Гризингер Г . Холера. — М., 1866.

Губерт В. О. Оспа и оспопрививание. — СПб., 1896.

Гладилин К. Л., Суворов А. Н. Проблема происхождения жизни: теоретическое о практическое значение // Прикладная биохимия и микробиология. — 1995. — Т. 31, № 1. — С. 60–69.

Делюмо Ж . Ужасы на западе. — М., 1994.

Дербек Ф. И . История чумных эпидемий в России. — Санкт Петербург, 1905.

Джон Б., Дербишир Э., Янг Г. с соавт . Зимы нашей планеты. — М., 1982.

Диаптроптов П. И . Обзор заболеваний чумой на побережье Средиземного моря и в портовых городах Европы в 1900 и в начале 1901 гг. //Русский архив патол., клин., мед. и бактериол. — 1901. — Т. 12. — С. 77–94.

Диатроптов П. И., Кост Н. А., Иванов Е. М., Елистратов П. И. и др . Об «испанской» болезни // Известия Народного комиссариата здравоохранения. — 1919. — № 1. — С. 7—16

Домарадский И. В. Чума. — М., 1998.

Жданов В. М . Эволюция заразных болезней человека. — С., 1963.

Жданов В. М . Эволюция вирусов // Природа. — 1988. — № 5, С. 4 — 14.

Жданов В. М . Эпидемиология. — М., 1961.

Захарова Л. В . Течение тяжелой формы гриппа с летальным исходом в эпидемию 1969 года в Куйбышеве // Материалы научно-практической конференции врачей Куйбышевской области. — Куйбышев, 1970. — С. 267–268.

Злыдников Д. М., Беляев Н. М., Романов Ю. А. и др . Клинические особенности гриппа А 2 — Гонконг в 1969 году // Клиническая медицина. — 1971. — Т. 48, № 5. — С. 97—102.

Евсевий Панфил . Церковная история. — М., 2001.

Ермакова Р. М., Поляков В. А., Гольшевская В. И. Трансфазовая передача атипичных микобактерий у кровососущих комаров // Сб. научн. тр. Всерос. НИИ вет. санит. гигиены и экологии. — 1995. — Т. 97. — С. 3–9.

Ерусалимчик Г. Л., Любимова Л. П., Гросман И. И. с соавт . Некоторые особенности клинического течения гриппа в Ленинграде в 1959 г. в сравнении с 1957 г. // Этиология, иммунология и клиника Азиатского гриппа. — Л., 1961. — С. 234–239.

Еськов К. Ю. История Земли и жизни на ней. — М., 2004 (http://warrax.net/51/eskov/cover_eskov.html).

Еськов К. Ю. Удивительная палеонтология. — М., 2008.

Жданов В. М. Эпидемиология. — М., 1961.

Жданов В. М., Львов Д.К. Эволюция возбудителей инфекционных болезней. — М., 1984.

Жмулев И. Ф. Общая и молекулярная генетика. — Новосибирск, 2002.

Заболотный Д. К. Чума на юго-востоке СССР и причины ее эндемичности. — Л., 1926.

Иванова В. Т., Бурцева Е. И., Слепушкин А. Н. и др. Характеристика штаммов вируса гриппа А(H3N2) в эпидемическом сезоне 2003–2004 гг. в России // Вопросы вирусологии. — 2006. — № 1. С. 19–23.

Иванцов А. Ю. VENDIA и другие докембрийские «артроподы» //Палеонтологический журнал. — 2001. — № 4. — С. 3 — 10.

Ивашнецов Г. А. Курс острых инфекционных болезней. — Л., 1925.

Калинина Н. М., Кетлинский С. А. Иммунология ВИЧ-инфекции // Иммунодефицитные состояния. — М., 2000. — С. 411–446.

Калкинс Г. Н. Протозоология (простейшие животные). — М., 1912.

Камю А. Чума. — М., 1996.

Карпухин Г. И., Швецова Е. Г., Малышева А. М. Итоги многолетнего опыта изучения эффективности экстренной профилактики гриппа ремантадином в эпидемиологических наблюдениях // Проблемы гриппа и ОРЗ. — Л., 1979. — С. 24–28.

Карпухин Г. И . Профилактика и лечение гриппа. — Л., 1985.

Козлов М. П., Султанов Г. В. Эпидемические проявления чумы в прошлом и настоящем. — Махачкала, 1993.

Коренберг Э. И. Происхождение возбудителей природноочаговых инфекций // Природа. — 2006. — № 10. — С. 33–40.

Кузник Б. И. Физиология и патология системы крови. — М., 2004.

Купер Э. Сравнительная иммунология. — М., 1980.

Лашкевич В. А., Коколева Г. А., Терешкина Н. В. и др . Сверхострый летальный некроз печени у обезьян, инфицированных высокопатогенным вариантом энтеровирусов (вирусы ЕСНО11 и ЕСНО 19) // Вопросы вирусологии. — 1996. — № 5. — С. 198–205.

Лебедев И. Н., Никитина Т. Н., Токарева А. Г. с соавт . П атогенетические аспекты нестабильности эмбрионального генома в развитии человека // Вестник ВОГиС. — 2006. — Том 10, № 3. — С. 520–529.

Лем С. Стратегии паразитов, вирус СПИДа и одна эволюционная гипотеза// Природа. — 1989. — № 5. — С. 96 — 104.

Литвин В. Ю., Гинцбург В. Я., Пушкарева В. И. и др. Эпидемиологические аспекты экологии бактерий. — М., 1998.

Лопухин А. П. Библейская история Ветхого Завета. — М., 1887.

Лысенко А. Я., Турьянов М. Х., Лавадовская М. В. и др. ВИЧ-инфекция и СПИД-ассоциируемые заболевания. — М., 1996.

Марамович А. С., Наркевич М. И. Холера // Руководство по эпидемиологии инфекционных болезней. — М., 1993. — Т. 2. — С. 85—103.

Маренникова С. С., Щелкунов С. Н. Патогенные для человека ортопоксвирусы. — М., 1998.

Марков А. В. Возвращение черной королевы, или закон роста средней продолжительности существования родов в процессе эволюции // Журн. общей биологии. — 2000. — Т.61, № 4. — С. 357–369.

Марков А. В. сайт «Проблемы эволюции» (http://www.macroevolution.narod.ru/index.html).

Медников Б. М . Аксиомы биологии. — М., 1982.

Минх Г. Н. Чума в России (Ветлянская эпидемия 1878–1879 гг.). — Киев, 1898.

Михайлова А. Е., Хайтович А. Б. Факторы сохранения холерных вибрионов в водоемах // Журн. микробиол. — 2000. — № 6. — С. 99—104.

Николаев Н. И . Чума в Манчжурии. Дис… д-ра мед. наук. — Киров, 1949.

Николаенко Д. В. Исследование диффузии ВИЧ/СПИДа как фундаментальная проблема // Универсум. — 2005. — № 6. — С. 28–32.

Николаенко Д. В. Критика зоонозной гипотезы происхождения эпидемии ВИЧ/СПИД и новые перспективы исследований // Эпидемия ВИЧ/СПИД в Украине. — 2006. — № 2. — С. 107–141.

Николаенко Д. В. Микрогеография эпидемии ВИЧ/СПИД. Случай Дурбана. Часть 1. // Эпидемия ВИЧ/СПИД в Украине. — 2006. — № 4. — С. 461–511.

Николаенко Д. В. Микрогеография эпидемии ВИЧ/СПИД. Случай Дурбана. Часть 2 // Энвайронментальная эпидемиология. — 2007. — Том 1, № 1. — С. 105–178.

Никульшин С. В., Онацкая Т. Т., Луканина Л. М . Изучение ассоциаций почвенных амеб H. rhisodes с бактериями — возбудителями чумы и псевдотуберкулеза в эксперименте // Журн. микробиол. — 1993. — № 9—10. — С. 2–5.

Общая и частная вирусология // Под. ред. Жданова В. М. и Гайдамовича С. Я. — М., 1982. — Т. 2.

Оппенгеймер С. Изгнание из Эдема. Хроника демографического взрыва. — М., 2004.

Ойфа А. И. Мозг и вирусы. — М., 1999.

Пашутин С. Возможные механизмы перехода химической эволюции в биологическую // Универсум. — 2006. — № 1. — С. 18–25.

Пауэр К. Поражение нервной системы ретровирусами: патологическая реакция хозяина или нейровирулентность как результат действия вирусных генов // Международный медицинский журнал. — 2001. — № 6.

Перуанский А . Об «испанской» болезни // Известия народного комиссариата здравоохранения. — 1919. — № 7–8. — С. 32–33.

Петтенкофер М . Холера. — СПб., 1885.

Петровский В. Л. К вопросу о первоисточниках нового чумного очага в Южной Маньчжурии // Сб. работ противочумных организаций Восточносибирского края за 1932–1933 гг./ Под ред. А. М. Скородумова. — Москва, Иркутск, 1932. — С. 147–150.

Петухов В. Л., Жигачев А. И., Назарова Г. А . Ветеринарная генетика. — М., 1996.

Пехов А. П. Биология и общая генетика. — М., 1994.

Пригожин И., Стенгерс И. Порядок из хаоса. — М., 1986.

Протасов Н. А. Исторический очерк эпидемий гриппа в России // Военно-медицинский журнал. — 1891. — Т. СLXXII, Вып. 3. — С. 534–531.

Пушкарева В. И. Патогенные бактерии в почвенных и водных сообществах (экспериментально-экологическое исследование). Автореф. дис. … докт. биол. наук. — М., 1994.

Раскина М. А., Афанасьев М.И . Холера азиатская и европейская. — СПБ.,1892.

Рихтер В. М . История медицины в России. — М., 1815.

Ройт А., Бростофф Дж., Мейл Д. Иммунология. — М., 2000.

Российский Д. М . Грипп. — М., 1942.

Садов А. А. Эпидемический грипп. — Л., 1927.

Сакагучи Ш., Фегервари З. Стражи иммунной системы // В мире науки. — 2006. — № 12. — С. 28–35.

Сарнгадхаран М. Г., Маркхэм П. Д., Гало Р . Вирусы Т-клеточных лейкозов человека // В кн. Вирусология. — М., 1989. — С. 331–382.

Серавин Л. Н. Простейшие — что это такое? — М., 1984.

Сингер М., Берг П. Гены и геномы. — М., 1998.

Смородинцев А. А., Коровин А. А . Грипп. — М., 1961.

Смородинцев А. А. Введение к сборнику // Грипп А2 Гонконг (сборник трудов). — Л., 1971. — С. 3–8.

Старкова Н. А. Клиническая картина «испанского гриппа» // Эпидемический сборник. Работы научной комиссии по изучению инфекционных болезней при Ростовском эвакопункте. — Ростов на Дону, 1921. — С. 271–280.

Стил Э., Линдли Р., Бланден Р. Что, если Ламарк прав? Иммуногенетика и эволюция. — М., 2002.

Стрельников В. В., Залетаев Д. В. Патогенетическая роль повторяющихся последовательностей человека // Введение в молекулярную медицину. — М., 2004. — C. 147–190.

Сунцов В. В., Сунцова Н. И. Чума. Происхождение и эволюция эпизоотической системы. — М., 2006.

Супотницкий М. В. После СПИДа // Российский химический журнал. — 1996. — Т. XL, № 2. — С. 141–156.

Супотницкий М. В. Эффективное патентование средств специфической профилактики инфекционных заболеваний //Биотехнология. — 1997, № 9-10. — С. 56–79.

Супотницкий М. В. Микроорганизмы, токсины и эпидемии. — М., 2000, 2005.

Супотницкий М. В. «Черная смерть» — механизм пандемической катастрофы // Сборник научных трудов, посвященных 75-летию НИИ микробиологии МО РФ. — Киров, 2003. — С. 239–241.

Супотницкий М. В. ВИЧ/СПИД-пандемия как природное явление // Универсум. — 2005. — № 6. — С. 23–27.

Супотницкий М. В. К вопросу о месте ВИЧ/СПИД-пандемии среди других инфекционных, эпидемических и пандемических процессов // Эпидемия ВИЧ/СПИД в Украине. — 2006. — № 2. — С. 163–196.

Супотницкий М. В., Супотницкая Н. С. Очерки истории чумы. — М., 2006.

Супотницкий М. В. Введение и комментарии к статье С. Лема «Стратегии паразитов, вирус СПИДа и одна эволюционная гипотеза» // Эпидемия ВИЧ/СПИД в Украине. — 2006. — № 6. — С. 750–751, 762–768.

Супотницкий М. В. Почему нельзя создать вакцину против ВИЧ/СПИДа // Медицинская картотека. — 2007. — № 12. — С. 22–33; 2008. — № 2. — С. 22–32.

Супотницкий М. В. Словарь генетических терминов. — М., 2007.

Тарантул В. З. Геном человека. Энциклопедия, написанная четырьмя буквами. — М., 2003.

Таршис М. Г., Черкасский Б. Л. Болезни животных, опасные для человека. — М., 1977.

Таунбенбергер Дж., Рид Э., Фаннинг Т. Реконструкция вируса убийцы // В мире науки. — 2005. — № 4, С. 56–65.

Терских В. И. Сапронозы (о болезнях людей и животных, вызываемых микробами, способными размножаться вне организма во внешней среде, являющейся для них местом обитания) // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. — 1958. — Вып. 8. — С. 118–120.

Тимаков В. Д., Зуев В. А. Медленные инфекции. — М., 1977.

Торсуев Н. А. Проказа (Lepra) // Руководство по микробиологии, клинике и эпидемиологии инфекционных болезней. — М., 1964. — Т. VI, С. 619–634.

Тэйлор Д., Грин Н., Стаут У. Биология. — М., 2004.

Эрисман Ф. Ф. Холера. Эпидемиология и профилактика. — М.,1893.

Федоров В. Н., Козакевич В.П. Современное распространение чумы в зарубежных странах // Природная очаговость и эпидемиология особо опасных инфекционных болезней. — Саратов, 1959. — С. 18–39.

Фон Нейман Дж. Общая и логическая теория автоматов // В кн.: А. Тьюринг. Может ли машина мыслить? — М., 1960, с. 59–102.

Фрейдлин И. С. Иммунная система и ее дефекты: Руководство для врачей. — СПб., 1998.

Хавкин В. М. Предохранительные прививки (холера, чума). — Харьков, 1999.

Черкасский Б. Л. Руководство по общей эпидемиологии. — М., 2001.

Шебанов Ф.В. Туберкулез. Клиника // Руководство по микробиологии, клинике и эпидемиологии инфекционных болезней. — М., 1964. — Т. VI, С. 591–607.

Шувалова Е. П. Тропические болезни. — М., 1973.

Шувалова Е. П., Белозеров Е. С., Беляева Т. Г. с соавт. Инфекционные болезни. — М., 2001.

Щепотьев Н. К. Чумные и холерные эпидемии в Астраханской губернии. — Казань, 1884.

Щепотьев Н. К. Материалы для эпидемиологии холеры. — Казань, 1890.

Ющук Н. Д., Мартынов Ю. В., Жогова М. А. с соавт. Эпидемиология (тесты, задачи и упражнения). — М., 1997.

Эрисман Ф. Ф . Холера. Эпидемиология и профилактика. — М.,1893.

Хаусман К. Протозоология. — М., 1988.

Яблоков А. В., Юсуфов А. Г. Эволюционное учение. — М., 1998.

Abd H., Johansson T., Golovliov I. et al. Survival and growth of Francisella tularensis in Acanthamoeba castellanii // Applied and Environmental Microbiology. — 2003. — Vol. 69, № 1. — P. 600–606.

Abel L., Vu D. L., Oberti J. et al . Complex segregation analysis of leprosy in southern Vietnam // Genet. Epidemiol. — 1995. — Vol. 12. — P. 63–82.

Adenike A., Pruscker J., Benson R. et al. / Legionella-Like pathogens — philogenetic status and possible role in respiratory disease // Emerging Infectious diseases. — 1996. — Vol. 3, № 2. — P. 225–230.

Albert J., Abrahamsson B., Nagy K. et al. Rapid development of isolate-specific neutralizing antibodies after primary HIV-1 infection and consequent emergence of virus variants which resist neutralization by autobogous sera // AIDS. — 1990. — Vol. 4. — P. 107–112.

Alcami A. New insights into the subversion of the chemokine system by poxviruses // Eur. J. Immunol. — 2007. — Vol. 37. — P. 880–883.

Allen P. G., Dawidowicz E. A. Phagocytosis in Acanthamoeba: a mannose receptor is responsible for the binding and phagocytosis of yeast // J. Cell. Physiol. — 1990. — Vol. 145, № 3. — P. 508–513.

Ampel N. Emerging disease issues and fungal pathogens associated with HIV infection // Emerging Infectious Diseases. — 1996. — Vol. 2, № 2. — P. 109–114.

Angel J. B, Walpita P., Lerch R. A. et al . Vaccine-associated measles pneumonitis in an adult with AIDS // Ann. Intern. Med. — 1998. — Vol. 129. — P. 104–106.

Antczak A. J., Tsubota T., Kaufman P. D. et al. Structure of the yeast histone H3-ASF1 interaction: implications for chaperone mechanism, species-specific interactions and epigenetics // BMC Structural Biology. — 2006. — Vol. 6. — № 26. — P. 1—12 (doi:10.1186/1472-6807-6-26).

Antony L., Burke R., Nano F. Growth of Francisella spp. in rodent macrophages // Infection and Immunity. — 1991. — Vol. 59, №. 9. — P. 3291–3296.

Arimi M. M., Nyachieo A., Langat D. K. Evidence for expression of endogenous retroviral sequences on primate reproductive tissues and detection of cross-reactive ERVS antigens in the baboon ovary: a review // East. Afr. Med. J. — 2006. — Vol. 83, № 2. — P. 106–112.

Bagasra O., Farzadegan H., Seshamma T. et al. Detection of HIV-1 proviral DNA in sperm from HIV-1-infected men // AIDS. — 1994. — Vol. 8. — P. 1669–1674.

Baldinotti F. D., Matteucci P., Mazzetti P. et al. Serum neutralization of feline immunodeficiency virus is markedly dependent on passage history of the virus and host system // J. Virol. — 1994. — Vol. 74. — P. 10834 — 10837.

Bannert N., Kurth R. Retroelements and the human genome: New perspectives on an old relation // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2004. — Vol. 101, Suppl. 2. — P. 14572 — 14579.

Barclay A. N. Ig-like domains: evolution from simple interaction molecules to sophisticated antigen recognition // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1999. — Vol. 96. — P. 14572 — 14579.

Baribaud F., Pohlmann S., Doms R. W. The role of DC-SIGN and DC-SIGNR in HIV and SIV attachment, infection, and transmission // Virology. — 2001. — Vol. 286. — P. 1–6.

Barker J., Brown M. R. W. Trojan horses of the microbial world: protozoa and the survival of bacterial pathogens in the environment // Microbiology. — 1994. — Vol. 140. — P. 1253–1259.

Barker J., Brown M. R. Speculations on the influence of infecting phenotype on virulence and antibiotic susceptibility of Legionella pneumophila // J. Antimicrob. Chemother. — 1995. — Vol. 36. — P. 7 — 21.

Barker L. Mycobacterium leprae interactions with the host cell: recent advances // Indian. J. Med. Res. — 2006. — Vol. 123. — P. 748–759.

Barth H., Aktories K., Popoff M. P. et al. Binary bacterial toxins: biochemistry, biology, and applications of common Clostridium and Bacillus proteins // Microbiology and Molecular Biology Revives. — 2004. — Vol. 68, № 3. — P. 373–402.

Belshaw R., Pereira V., Katzourakis A. et al. Long-term reinfection of the human genome by endogenous retroviruses // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2004. — Vol. 101, № 14. — P. 4894–4899.

Belshaw R., Dawson A. L., Woolven-Allen J. et al. Genomewide screening reveals high levels of insertional polymorphism in the human endogenous retrovirus family HERV-K(HML2): Implications for present-day activity // J. Virol. — 2005. — Vol. 79. — P. 12507 — 12514.

Belshaw R., Katzourakis A., Pacees J. et al. High copy number in human endogenous retrovirus families is associated with copying mechanisms in addition to reinfection // Mol. Biol. Evol. — 2005. — Vol. 22, № 4. — P. 814–817.

Belshaw R., Watson J., Katzourakis A. et al. Rate of recombinational deletion among human endogenous retroviruses // Journal of Virology. — 2007. — Vol. 81, № 17. — P. 9437–9442.

Benarroch D., Claverie J-M., Raoult D. et al. Characterization of mimivirus DNA topoisomerase IB suggests horizontal gene transfer between eukaryal viruses and bacteria // J. of Virol. — 2006. — Vol. 80, № 1. — P. 314–321.

Bendinelli M., Pistello M., Lombardi S. et al. Feline immunodeficiency virus: an interesting model for AIDS studies and an important cat pathogen // Clin. Microbiol. Rev. — 1995. — Vol. 8. — P. 87 — 112.

Benit L., Lallemand J. B., Casella J. F. et al . T ERV–L elements: a family of endogenous retrovirus-like elements active throughout the evolution of mammals // J. Virol. — 1999. — Vol. 73, № 4. — P: 3301–3308.

Benit L., Calteau A., Heidmann T. Characterization of the low-copy HERV-Fc family: evidence for recent integrations in primates of elements with coding envelope genes // Virology. — 2003. — Vol. 312. — P. 159–168.

Berger E. A., Murphy P. M., Farber J. M. Chemokine receptors as HIV-1 coreceptors: roles in viral entry, tropism, and disease // Annu. Rev. Immunol. — 1999. — Vol. 17. — P. 657–700.

Best S., Le Tissier P., Towers G. et al. Positional cloning of the mouse retrovirus restriction gene Fv1 // Nature. — 1996. — Vol. 382. — P. 826–829.

Bhatnagar V., Stoto M., Morton S. et al. Transmission patterns of smallpox: systematic review of natural outbreaks in Europe and North America since World War II // BMC Public Health. — 2006. — Vol. 6. — № 126 (http://www.biomedcentral.com/1471-2458/6/126).

Bjune G., Closs O., Barnetson St. Early events in the host-parasite relationship and immune response in clinical leprosy: its possible importance for leprosy control // Clin. Exp. Immunol. — 1983. — Vol. 54. — P. 289–297.

Blaise S., Ruggieri A., Dewannieux M. et al. Identification of an envelope protein from the FRD family of human endogenous retroviruses (HERV-FRD) conferring infectivity and functional conservation among simians // J. Virol. — 2004. — Vol. 78. — P. 1050–1054.

Blazquez S., Zimmer C., Guigon G. et al. Human tumor necrosis factor is a chemoattractant for the parasite Entamoeba histolytica // Infection and Immunity. — 2006. — Vol. 74, No. 2. — P. 1407–1411.

Bleul C. C., Wu L., Hoxie J. A. et al. The HIV coreceptors CXCR4 and CCR5 are differentially expressed and regulated on human T lymphocytes // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1997. — Vol. 94. — P. 1925–1930.

Boeke J. D., Stoye J. P . Retrotransposons, endogenous retroviruses, and the evolution of retroelements // Retroviruses, Cold Spring Harbor. — 1997. — P. 343–436.

Boissinot S., Entezam Ali, Young L. et al. The insertional history of an active family of L1 retrotransposons in humans // Genome Research. — 2004. — published online, Jun 14.

Bosch E. Jobling M. Duplications of the AZFa region of the human Y chromosome are mediated by homologous recombination between HERVs and are compatible with male fertility // Human Molecular Genetics. — 2003. — Vol. 12, № 3. — P. 341–347.

Bouchlal H., Chomont N., Haeffner-Cavaillon N. et al . Opsonization of HIV-1 by semen complement enchances infection of human epithelial cells // J. Immunol. — 2002. — Vol. 169, № 6. — P. 3301–3306.

Boyd J. E., James K. B cell responses to HIV and the development of human monoclonal antibodies // Clin. Exp. Immunol. — 1992. — Vol. 88, № 2. — P. 189–202.

Bracy J. L., Iacomini J. Induction of B-cell tolerance by retroviral gene therapy // Blood. — 2000. — Vol. 96. — P. 3008–3015.

Branck M . Agents transmissible from simians to man. — Berlin, 1987.

Braude A., Davis C., Fierer J . Infectious diseases and medical microbiology. — Philadelphia, 1986.

Breen R. A., Smith C. J., Johnson M. A. et al. Does immune reconstitution syndrome promote active tuberculosis in patients receiving highly active antiretroviral therapy? // AIDS. — 2005. — Vol. 19. — P. 1201–1206.

Briles D. E., Davie J. M. Clonal nature of the im- mune response. II. The effect of immunization on clonal commitment // J. Exp. Med. — 1980 — Vol. 152. — P. 151–160.

Brosius J., Gould S.J. On «genomenclature»: a comprehensive (and respectful) taxonomy for pseudogenes and other «junk DNA» // Proc. Natl Acad. Sci. USA. — 1992. — Vol. 89. — P. 10706 — 10710.

Brown E. W., Yuhki N., Packer C. et al. A lion lentivirus related to feline immunodeficiency virus: epidemiologic and phylogenetic aspects // J. Virol. 1994. — Vol. 68. — P. 5953–5968.

Brown M., Reed S., Levy J. A. et al. Detection of HIV-1 in Entamoeba histolytica without evidence of transmission to human cells // AIDS. — 1991. — Vol. 5, № 1. — P. 93–96.

Buller R. M. L., Palumbo G. J. Poxvirus pathogenesis // Microbiologicai Revievs. — 1991. — Vol. 55, № 1. — P. 80–122.

Burton D. R., Stanfield R. L., Wilson I. A. Antibody vs. HIV in a clash of evolutionary titans // Proc. Natl Acad. Sci. USA. — 2005. — Vol. 102, № 42 — P. 14943 — 1494.

Buseyne F., Janvier G., Teglas J. P. et al. Impact of heterozygosity for the chemokine receptor CCR5 32-bp-deleted allele on plasma virus load and CD4 T lymphocytes in perinatally human immunodeficiency virus-infected children at 8 years of age // J. Infect. Dis. — 1998. — Vol. 178, № 4. — P. 1019–1023.

Cabrera M., Shaw M. A., Sharples C. et al . Polymorphism in tumor necrosis factor genes associated with mucocutaneous leishmaniasis // J. Exp. Med. — 1995. — Vol. 182. — P. 1259–1264.

Cailhol J., Pizzocolo C., Brauner M. et al. Отсроченный синдром восстановления иммунитета // AIDS. — 2008. — Т. 1, № 1. — С. 71–72.

Carr A., Samaras K., Chisholm D. J. е t al. Pathogenesis of HIV-1-protease inhibitor-associated peripheral lipodystrophy, hyperlipidaemia, and insulin resistance // Lancet. — 1998. — Vol. 351. — P. 1881–1883.

Cavanaugh D. C., Randall R. The role of multiplication of Pasteurella pestis in mononuclear phagocytes in the pathogenesis of fleaborne plague // J. Immunol. — 1959. — Vol. 85. — P. 348–363.

Chaudhri G., Panchanathan V., Bluethmann H. et al . Obligatory requirement for antibody in recovery from a primary poxvirus infection // J. of Virol. — 2006. — Vol. 80, № 13. — P. 6339–6344.

Chen Jian-Min, Ferec C., Cooper D. LINE-1 Endonuclease-dependent retrotranspositional events causing human genetic disease: mutation detection bias and multiple mechanisms of target gene disruption // Journal of Biomedicine and Biotechnology. — 2006, Article ID 56182. — P. 1–9.

Chensue S. W. Molecular machinations: chemokine signalsin host-pathogen interactions // Clin. Microbiol. Rev. — 2001. — Vol.14, № 4. — P.821–835.

Ghigo E., Kartenbeck J., Lien P. et al . Ameobal pathogen mimivirus infects macrophages through phagocytosis // PLoS Pathogens. — 2008. — Vol. 4? № 6. — P. 1—17.

Cirillo J. D., Tompkins L. S., Falkow S. Growth of Legionella pneumophila in Acanthamoeba castellanii enhances invasion // Infect. Immun. — 1994. — Vol. 62. — P. 3254–3261.

Cirillo J. D., Falkow S., Tompkins L. S. et al. Interaction of Mycobacterium avium with environmental amoebae enhances virulence // Infect. Immun. — 1997. — Vol. 65. — P. 3759–3767.

Clark R., Kupper T. The interaction between innate and adaptive immunity // J. Invest. Dermatol. — 2005. — Vol. 125. — P. 629–637.

Clements G. J., Price-Jones M. J., Stephens P. E. et al . The V3 loop of the HIV-1 surface glyco-protein contains proteolytic cleavage sites: a possible function in viralfusion // AIDS Res. Hum. Retroviruses. — 1991. — Vol. 7. — P. 3 — 16.

Coffin J. M. Evolution of retroviruses: fossils in our DNA // Proceedings of The American Philosophical Society. — 2004. — V ol. 148, № 3. — P. 264–280.

Colombo R., Bignamini A. A., Carobene A. et al. Age and origin of the FCMD 3 ' — untranslated-region retrotransposal insertion mutation causing Fukuyama-type congenital muscular dystrophy in the Japanese population // Hum. Genet. — 2000. — Vol. 107. — P. 559–567.

Conticello S. G., Thomas C., Petersen-Mahrt S. Evolution of the AID/APOBEC family of polynucleotide (Deoxy)cytidine deaminases // Mol. Biol. Evol. — 2005. — Vol. 22, № 2. — Р. 367–377.

Contreras-Galindo R., Contreras-Galindo A., Lorenzo E. et al. Evidence for replication of human endogenous retroviruses type K (HERV-K) in HIV–I positive patients // Retrovirology. — 2006. — Vol. 3 (Supl. I), S33.

Contreras-Galindo R, Kaplan M.H, Markovitz D. M et al . Detection of HERV-K(HML-2) viral RNA in plasma of HIV type 1-infected individuals // AIDS Res. Hum. Retroviruses. — 2006 — Vol. 22, № 10. — P. 979–984.

Contreras-Galindo R., Lopes P., Veles R. et al. HIV-1 infection increases expression of human endogenous retroviruses type K (HERV-K) in vitro // AIDS Res. Hum. Retroviruses. — 2007. — Vol. 23, № 1. — Р. 116–122.

Conway D. J., Holland M. J., Bailey R. L. et al . Scarring trachoma is associated with polymorphism in the tumor necrosis factor alpha (TNF-alpha) gene promoter and with elevated TNFalpha levels in tear fluid // Infect. Immun. — 1997. — Vol. 65. — P. 1003–1006.

Costas J., Naverira H. Evolutionary history of the human endogenous retrovirus family ERV9 // Mol. Biol. Evol. — 2000. — Vol. 17, № 2. — P. 320–330.

Crotty S., Felgner P., Davies H. et al. Cutting Edge: Long-Term B Cell Memory in Humans after Smallpox Vaccination // The Journal of Immunology. — 2003. — Vol. 171. — P. 4969–4973.

Csuros M., Miklos I. Statistical alignment of retropseudogenes and their functional paralogs // Mol. Biol. Evol. — 2005. — Vol. 22, № 12. — P. 2457–2471.

Cullen B. G. Role and mechanism of action of the APOBEC3 family of antiretroviral resistance factors // Journal of Virology. — 2006. — Vol. 80, №. 3. — P. 1067–1076.

Dalton F., Melnick J., Bauer H. et al. The case for a family of reverse transcriptase viruses: retraviridae // Intervirilogy. — 1974. — Vol. 4. — P. 201–206.

de Messias I. J., Santamaria J., Brenden M. et al. Association of C4B deficiency (C4B*Q0) with erythema nodosum in leprosy // Clin. Exp. Immunol. — 1993. — Vol. 92. — P. 284–287.

Deininger P., Batzer M. Mammalian retroelements // Genome Res. — 2002. — Vol. 12. — P. 1455–1465.

Denis M. Envelope glycoprotein (gp120) from HIV-1 enhances Mycobacterium avium growth in human bronchoalveolar macrophages // Clin. and Exp. Immunol. — 1994. — Vol. 98, № 1. — P. 123–127.

Denis M. Tat protein from HIV-1 binds to Mycobacterium avium via a bacterial integrin. Effects on extracellular and intracellular growth // J. Immunol. — 1994. — Vol. 153, № 5. — P. 2072–2081.

Dion T. D., Meselson M., Gillemin J. et al. Anthrax // Medical Progress. — 1999. — Vol. 341, № 11. — P. 815–826.

Doolittle R. F., Feng D. F., Johnson M. S. et al. Origins and evolutionary relationships of retroviruses // Quart. Rev. Biology. — 1989. — Vol. 64. — P. 1 — 30.

Douek D. C., Brenchley J. M., Betts M. R. et a l. HIV preferentially infects HIV-specific CD4 T cells // Nature. — 2002. — Vol. 417, № 6884. — P. 95–98.

Douglas J., Soike K., Raynor J. The incidence of poliovirus in chimpanzees (Pan troglodytes) // Laboratory Animal Care. — 1970. — Vol. 20, № 2. — P. 265–268.

Downie A. W., McCarthy K. The antibody response in man following infection with viruses of the pox group. III. Antibody response in smallpox // J. Hyg. (London). — 1958. — Vol. 56. — P. 479–487.

Downing J. F., Pasula R., Wright J. R et al. Surfactant protein a promotes attachment of Mycobacterium tuberculosis to alveolar macrophages during infection with human immunodeficiency virus // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. — 1995. — Vol. 92, № 11. — P. 4848–4852.

Drozanski W. Fatal bacterial infection in soil amoebae // Acta Microbiol. — 1956. — Vol. 5. — P. 315–317.

Duncan S. R., Scott S. Oscillatory dynamics of smallpox and the impact of vaccination // J. Theor. Biol. — 1996. — Vol.183. — P.447–454.

Dunlap K., Palmarini M., Varela M. et al. Endogenous retroviruses regulate periimplantation placental growth and differentiation // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2006 — Vol. 103, № 39. — Р. 14390 — 14395.

Dunne M. Разработка антиретровирусных препаратов: проблема цены и доступности // AIDS (русское издание). — 2008. — Том. 1, № 1. — С. 86–92.

Eichner M., Dietz K. Transmission potential of smallpox: estimates based on detailed data from an outbreak // American Journal of Epidemiology — 2003. — Vol. 158, № 2. — P. 110–117.

Ellis J., Green M. Tularemia // Clin. Microbiol. Rev. — 2002. — Vol. 15, № 4. — P. 632–646.

Elton S., Bishop L. S., Wood B. Comparative context of plio-pleistocene hominin evolution // Journal of Human Evolution. — 2001. — Vol. 41. — P. 1—27.

Engele M., Stossel E., Castiglione K. et al . Induction of TNF in human alveolar macrophages as a potential evasion mechanism of virulent Mycobacterium tuberculosis // J. Immunol. — 2002. — Vol. 168. — P. 1328–1337.

Eradication de la variole. Repport d' un groupe scientifique de l'OMS. — Geneva, 1968. — P. 393.

Espinoza C., Feeney A. The extent of histone acetylation correlates with the differential rearrangement frequency of individual VH genes in Pro-B Cells // The Journal of Immunology. — 2005. — Vol. 175. — P. 6668–6675.

Essig A., Heinemann M., Simnacher U. et al. Infection of Acanthamoeba castellanii by Chlamydia pneumoniae // Appl. Environ. Microbiol. — 1997. — Vol. 63. — P. 1396–1399.

Esteban D. J., Buller R. M. Ectromelia virus: the causative agent of mousepox // J. Gen. Virol. — 2005. — Vol. 86. — P. 2645–2659.

Fenner F. The pathogenesis of the acute exanthems. An interpretation based on experimental investigations with mousepox (infectious ectromelia of mice) // Lancet. — 1948. — Vol. 2. — P. 915–930.

Fenner F., McAuslan B. R., Mims C. A. et al. Pathogenesis: the immune response // In The Biology of Animal Viruses. — 1974, 2nd ed., London — P. 417–418.

Fernandez-Prada C. V., Zelazowska E. B., Nikolich M. et al. Interactions between Brucella melitensis and human phagocytes: bacterial surface O-polysaccharide inhibits phagocytosis, bacterial killing, and subsequent host cell apoptosis // Infection and Immunity. — 2003. — Vol. 71, № 4. — P. 2110–2119.

Fernandez-Reyes D, Craig A., Kyes S. et al . A high frequency African coding polymorphism in the N-terminal domain of ICAM-1 predisposing to cerebral malaria in Kenya // Hum. Mol. Genet. — 1997. — Vol. 6. — P. 1357–1360.

Ferrero I., Anjuere F., MacDonald H. R. et al. In vitro negative selection of viral superantigen-reactive thymocytes by thymic dendritic cells // Blood. — 1997. — Vol. 90. — P. 1943–1951.

Feschotte C., Pritham E. DNA transposons and the evolution of eukaryotic genomes // Annu. Rev. Genet. — 2007. — Vol. 41. — P. 331–368.

Finlay B., Falkow S. Common Themes in Microbial Pathogenicity Revisited // Microbiology and Molecular Biology Reviews. — 1997. — Vol. 61, № 2. — P. 136–169.

Finzi D., Plaeger S. F., Dieffenbach C. W. Defective virus drives human immunodeficiency virus infection, persistence, and pathogenesis // Clinical and Vaccine Immunology. — 2006. — Vol. 13. — № 7. — P. 715–721.

Fitness J., Tosh K., Hill A. Genetics of susceptibility to leprosy // Genes and Immunity. — 2002. — Vol. 3. — P. 441–453.

Forestier C., Deleuil F., Lapaque N. et al. Brucella abortus lipopolysaccharide in murine peritoneal macrophages acts as a down-regulator of T cell activation // J. Immunol. — Vol. 165. — P. 5202–5210.

Francis T. Influenza: new acquaintance // Ann. Intern. Med. — 1953. — Vol. 39. — P. 203–221.

Frank O., Giehl M., Zheng C. et al. Human endogenous retrovirus expression profiles from brains of patients with schizophrenia and bipolar disorders // J. Virol. — 2005. — Vol. 79. — P. 10890–10901.

Franz D. R., Jahring P. B., Friedlander A. M. et al. Clinical recognition and management of patients exposed to biological warfare agents // JAMA. — 1997. — Vol. 278, № 5. — P. 399–411.

Fraser C., Hollingsworth T, Chapman R. et al . Variation in HIV-1 set-point viral load: Epidemiological analysis and an evolutionary hypothesis // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2007. — Vol. 104, № 44. — P. 17441 — 17446.

Freed E. O . HIV-1 replication // Somat. Cell Mol. Genet. — 2001 — Vol. 26. — P. 13–33.

Feschotte C., Pritham E. DNA transposons and the evolution of eukaryotic genomes // Annu. Rev. Genet. — 2007. — Vol. 41. — P. 331–368.

Frey S. E, Newman F., Ya L. et al. Response to smallpox vaccine in persons immunized in the distant past // JAMA. — 2003. — Vol. 289, № 24. — P. 3295–3299.

Frodshan A., Hill A. Genetics of infectious diseases // Human Molecular Genetics. — 2004. — Vol. 13, № 2. — P. 187–194.

Frost S., Wrin T., Smith D. M. et al . Neutralizing antibody responses drive the evolution of human immunodeficiency virus type 1 envelope during recent HIV infection // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2005. — Vol. 102, № 51. — P. 18514 — 18519.

Fugmann S. D., Messier C., Novack L. A. et al. An ancient evolutionary origin of the Rag1/2 gene locus // Proc. Natl Acad. Sci. USA. — 2006. — Vol. 103. — P. 3728–3733.

Furano A. V. The biological properties and evolutionary dynamics of mammalian LINE-1 retrotransposons // Prog. Nucleic Acids Res. Mol. Biol. 2000. — Vol. 64. — P. 255–294.

Fust G. Enhancing antibodies in HIV infection // Parasitology. — 1997. — Vol. 115, Suppl: S 127–140.

Gage K., Ostfield R., Olson J . Nonviral vector-borne zoonoses associated with mammals in the United States // J. Mammalogy. — 1995. — Vol. 76, № 3. — P. 695–715.

Galvani A., Slatkin M. Evaluating plague and smallpox as historical selective pressures for the CCR5-^32 HIV-resistance allele // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2003. — V ol. 100, № 25. — Р. 15276–15279.

Gallwitz S., Schutzbank T., Heberling R. L. et al. Smallpox: residual antibody after vaccination // Journal of Clinical Microbiology. — 2003. — Vol. 41, № 9. — Р. 4068–4070.

Geijtenbeek T. B., Kwon D. S., Torensma R. et al. DC-SIGN, a dendritic cell-specific HIV-1-binding protein that enhances trans-infection of T cells // Cell. — 2000. — Vol. 100. — P. 587–597.

Gilbert M., Rambaut F., Wlasiuk G. et al . The emergence of HIV/AIDS in the Americas and beyond // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2007. — Early Edition (www.pnas.org_cgi_doi_10.1073_pnas.0705329104).

Goedert J. J., Sauter M., Jacobson L. P. et al. High prevalence of antibodies against HERV-K10 in patients with testicular cancer but not with AIDS // Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention. — 1999. — Vol. 8. — P. 293–296.

Gonzalez J. M., Sherr E. B., Sherr B. F. Size-selective grazing on bacteria by natural assemblages of estuarine flagellates and ciliates // Appl. Environ. Microbiol. — 1990. — Vol. 56. — P. 583–589.

Gonzalez E., Bamshad M., Sato N. et al. Race-specific HIV-1 disease-modifying effects associated with CCR5 haplotypes // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1999. — Vol. 96, № 21. — P. 12004—12009.

Gonzalez E., Dhanda R., Bamshad M. et al . Global survey of genetic variation in CCR5, RANTES, and MIP-1 a: Impact on the epidemiology of the HIV-1 pandemic // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2001. — Vol. 98, №. 9. — Р. 5199–5204.

Gooldier J.L., Ostertag E.M., Kazazian H.H. Transdyction of 3'-flanking sequenced is common in L1 retrotransposicion // Hum. Curr. Genet. — 2000. — Vol. 9. — P. 653–657.

Goletti D., Weissman D., Jackson R. W. et al . Effect of Mycobacterium tuberculosis on HIV replication. Role of immune activation // J. Immunol. — 1996. — Vol. 157, № 3. — P. 1271–1278.

Gottfredsson M., Halldorsson B., Jonsson S. et al. Lessons from the past: familial aggregation analysis of fatal pandemic influenza (Spanish flu) in Iceland in 1918 // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2008. — Vol. 105. — № 4. — P. 1303–1308.

Grabenstein J., Fukuto H., Palmer L. et al. Characterization of phagosome trafficking and identification of PhoP-regulated genes important for survival of Yersinia pestis in macrophages // Infection and Immunity. — 2006. — Vol. 74, № 7. — P. 3727–3741.

Graur D., Shuali Y., Li W.-H. Deletions in processed pseudogenes accumulate faster in rodents than in humans // J. Mol. Evol. — 1989. — Vol. 28. — P. 279–285.

Greenwell-Wild T., Vazquez N., Sim D. е t al. Mycobacterium avium infection and modulation of human macrophage gene expression // J. Immunol. — 2002. — Vol. 169. — P. 6286–6297.

Greenwood A. D., Stengel A., Erfle V. et al. The distribution of pol containing human endogenous retroviruses in non-human primates // Virology. — 2005. — Vol. 334. — P. 203–213.

Greub G., Raoult D. Microorganisms resistant to free-living Amoebae // Clinical Microbiology Reviews. — 2004, — Vol. 17, No. 2. — P. 413–433.

Greub G., Raoult D. History of the ADP/ATP translocaseencoding gene: a parasitism gene transferred from a Chlamydiles ancestor to plants 1 billion years ago // Appl. Environ. Microbiol. — 2003. — Vol. 69. — P. 5530–5535.

Greub G., Raoult D. Microorganisms resistant to free-living Amoebae // Clinical Microbiology Reviews. — 2004, — Vol. 17, № 2. — P. 413–433.

Grosset J. Mycobacterium tuberculosis in the extracellular compartment: an underestimated adversary // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. — 2003. — Vol. 47, № 3. — P. 833–836.

Grossman L. I., Schmidt T. R., Wildman D. E. et al. Molecular evolution of aerobic energy metabolism in primates // Mol. Phylogenet. Evol. — 2001. —Vol. 18. — № 1. — P. 26–36.

Guildi-Rontani C. The alveolar macrophage the Trojan hourse of Bacillus anthracis // Trends Microbiol. — 2003. — Vol. 10. — P. 405–409.

Gurevich I., Tamir H., Arango V. et al. Altered editing of serotonin 2C receptor pre-mRNA in the prefrontal cortex of depressed suicide victims // Neuron. — 2002. — Vol. 34. — P. 349–356.

Hagge A., Ray N., Krahenbuhl J. et al. Adams an in vitro model for the lepromatous leprosy granuloma: fate of Mycobacterium leprae from target macrophages after interaction with normal and activated effector macrophages // The Journal of Immunology. — 2004. — Vol. 172. — P. 7771–7779.

Hak Sun Yu, Hae Jin Jeong, Yeon-Chul Hong et al. Natural occurrence of Mycobacterium as an endosymbiont of Acanthamoeba isolated from a contact lens storage case // Korean Journal of Parasitology. — 2007. — Vol. 45, №. 1. — P. 11–18.

Hale-Donze H., Greenwell-Wild T., Mizel D. et al . Mycobacterium avium complex promotes recruitment of monocyte hosts for HIV-1 and bacteria // J. Immunol. — 2002. — Vol. 169. — P. 3854–3862.

Han K., Sen S., Wang J. et al. Genomic rearrangements by LINE-1 insertion-mediated deletion in the human and chimpanzee lineages // Nucleic Acids Research. — 2005. — Vol. 33, № 13. — P. 4040–4052.

Hankarra R., Margolick J. B., Gange S. J. et al. Consistent viral evolutionary changes associated with the progression of human immunodeficiency virus type 1 infection // Journal of Virology. — 1999. — Vol. 73. — № 12. — P. 10489 — 10502.

Hanna P. C. Acosta D., Collert J. On the role of macrophages in anthrax // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1993. — Vol. 90. — P. 10198 — 10201.

Harb O., Lian-Yong Gao, KwaikY. A. From protozoa to mammalian cells: a new paradigm in the life cycle of intracellular bacterial pathogens // Environmental Microbiology. — 2000. — Vol. 2, № 3. — P. 251–265.

Hartley O., Klasse P.J., Sattentau Q. et al . V3: HIV's switch-hitter // AIDS Res. Hum. Retroviruses. — 2005. — Vol. 21. — P. 171–189.

Hartner J. C., Schmittwolf C., Kispert A. et al. Liver disintegration in the mouse embryo caused by deficiency in the RNA-editing enzyme ADAR1 // J. Biol. Chem. — 2004. — Vol. 279. — P. 4894–4902.

Has C., Wessagowit V., Pascucci M. et al. Molecular basis of kindler syndrome in Italy: novel and recurrent Alu/Alu recombination, splice site, nonsense, and frameshift mutations in the KIND1 gene // Journal of Investigative Dermatology. — 2006. — Vol. 126. — P. 1776–1773.

Hasler J., Strub K. Alu elements as regulators of gene expression // Nucleic Acids Research. — 2006. — Vol. 34, № 19. — P. 5491–5497.

Hastings R., Gills T., Krahenbuhl J. et al. Leprosy // Clinical Microbiology Revievs. — 1988. — Vol. 1, № 3. — P. 330–348.

Hawkes R. A. Enhancement of the infectivity of arboviruses by specific antisera produced in domestic fowls // Aust. J. Exp. Biol. Med. Sci. — 1964. — Vol. 43. — P. 465–482.

Hedges D. J., Callinan P. A., Cordaux R. et al. Differential Alu mobilization and polymorphism among the human and chimpanzee lineages // Genome Research. — 2004. — Vol. 14. — P. 1068–1075.

Hedrick P. W., Verrelli B. C. «Ground truth» for selection on CCR5-D32 // Trends in Genetics. — 2006. — Vol. 22, № 6. — P. 293–296.

Helbig K., Harris R., Ayres J. et al. Immune response genes in the post-Q-fever fatigue syndrome, Q fever endocarditis and uncomplicated acute primary Q fever // Q. J. Med. — 2005. — Vol. 98. — P. 565–574.

Henchal E. A., McCown J. M., Burke D. S. et al. Epitopic analysis of antigenic determinants on the surface of dengue-2 virions using monoclonal antibodies // Am. J. Trop. Med. Hyg. — 1985. — Vol. 34. — P. 164–169.

Hill A., Elvin J., Will A. et al. Molecular analysis of the association of HLA-B53 and resistance to severe malaria // Nature. — 1992. — Vol. 360. — P. 434–439.

Hill A., Worth A., Elliott T. et al . Characterization of two Epstein-Barr virus epitopes restricted by HLA-B7 // Eur. J. Immunol. — 1995. — Vol. 25, № 1. — P. 18–24.

Hill A. Genetics and genomics of infectious disease susceptibility // British Medical Bulletin. — 1999. — Vol. 55, № 2. — P. 401–413.

Hoal-Van H., Epstein J., Victor T. et al. Mannosebinding protein B allele confers protection against tuberculous meningitis // Pediatr. Res. — 1999. — Vol. 45 (Pt 1). — P. 459–464.

Homsy J., Meyer M., Tateno M. et al. The Fc and not CD4 receptor mediates antibody enhancement of HIV infection in human cells // Science. — 1989. — Vol. 16, № 244. — P. 1357–1360.

Horakova E., Gasser O., Sadallah S. et al. Complement mediates the binding of HIV to erythrocytes // The Journal of Immunology. — 2004. — Vol. 173. — P. 4236–4241.

Hosie M.J., Osborne R., Reid G. et al. Enhancement after feline immunodeficiency virus vaccination // Vet. Immunol. Immunopathol. — 1992. — Vol. 35. — P. 191–197.

Huang A. Y., Gulden P. H., Woods A. S. et al. The immunodominant major histocompatibility complex class I-restricted antigen of a murine colon tumor derives from an endogenous retroviral gene product // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1996. — Vol. 93. — P. 9730–9735.

Hughes J. F., Coffin J. M. Human endogenous retroviral elements as indicators of ectopic recombination events in the primate genome // Genetics . — 2005. — September 12.

Hui Pan, Bo-Shiun Yan, Rojas M. et al. Ipr1 gene mediates innate immunity to tuberculosis // Nature. — 2005. — Vol. 434, № 7034. — P. 767–772.

Huisman W., Karlas K. H., Siebelink K. H. et al. Feline immunodeficiency virus subunit vaccines that induce virus neutralizing antibodies but no protection against challenge infection // Vaccine. — 1998. — Vol. 16. — P. 181–187.

Hummel S., Schmidt D., Kremeyer B. et al . Detection of the CCR5-D32 HIV resistance gene in Bronze Age skeletons // Genes Immun. — 2005. — Vol. 6. — P. 371–374.

Hyeong Jun An, Doheon Lee, Kwang Hyung Lee et al. The association of Alu repeats with the generation of potential AU-rich elements (ARE) at 3' untranslated regions // BMC Genomics. — 2004. — № 5. — Р. 97.

Inoue M., Hoxie J., Reddy M. V. R. et al. Mechanisms associated with the generation of biologically active human immunodeficiency virus type 1 particles from defective proviruses// Proc. Nail. Acad. Sci. USA. — 1991. — Vol. 88. — P. 2278–2282.

Islam M., Drasar B., Bradley D. Survival of toxigenic Vibrio cholerae 01 with a common ducweed, Lemma minor, in artifical aquatic ecosystems // J. Trans. Roy, Trop. Med. а nd Hyg. — 1990. — Vol. 84, № 3. — P. 422–424.

Issel C. J., Horohov D. W., Lea D. F. et al. Efficacy of inactivated whole-virus and subunit vaccines in preventing infection and disease caused by equine infectious anemia virus // J. Virol. — 1992. — Vol. 66. — P. 3398–3408.

Jae-Won H., Dae-Soo K., Hong-Seok H. Formation of a new solo-LTR of the human endogenous retrovirus H family in human chromosome 21 // Mol. Cells. — 2006. — Vol. 22, № 3. — P. 360–363.

Jahrling P. B., Hensley L. E., Martinez M. J. et al. Exploring the potential of variola virus infection of cynomolgus macaques as a model for human smallpox // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2004. — V ol. 101, № 42. — Р. 15196 — 15200.

Jarrett O., Yamamoto J. K., Neil J. C. Feline immunodeficiency virus as a model for AIDS vaccination // AIDS. — 1990. — 4 (suppl.). — S163 — 165.

Jenner E. An Inquiry into the causes and effects of the: Variola Vaccine, a disease discovered in some of the western counties of England, particularly in Gloucestershire and known by the name of Cow-pox (with plates), London, 1798.

Joly A. L., Le Rolle A. L., Gonzalez A. L. et al . Co-evolution of rat TAP transporters and MHC class I RT1-A molecules // Curr. Biol. — 1998. — Vol. 8. — P. 169–172.

Jones A. L., Beveridge T. J., Woods D. E. Intracellular survival of Burkholderia pseudomallei // Infect. Immun. — 1996. — Vol. 64. — P. 782–790.

Jones K. A., Kadonaga J. T., Luciw P. A. et al. Activation of the AIDS retrovirus promoter by the cellular transcription factor, Sp1 // Science. — 1986. — Vol. 232. — P. 755–759.

Jordan I. K., Rogozin I. B., Glazko G. V. et al. Origin of a substantial fraction of human regulatory sequences from transposable elements // Trends Genet. — 2003. — Vol. 19, № 1. — P. 62–72.

Kalia V., Sarkar S., Gupta P. et al. Antibody neutralization escape mediated by point mutations in the intracytoplasmic tail of human immunodeficiency virus type 1 gp41 // J. Virol. — 2005. — Vol. 79, № 4. — P. 2097–2107.

Kalis R., Leond J., Streere A. et al . Association of treatment-resistant chronic Lyme arthritis with HLA-DR4 and antibody reactivity with OspA and OspB of Borrelia burgdorferi // Infect. Immunol. — 1993. — Vol. 61, № 10. — P. 2774–2779.

Kalu W. Effect of HIV infection on the clinical response of leprosy in Northern Nigeria — a study done in 2005 // Retrovirology — 2006. Vol. 3(Suppl. 1). — P. 32.

Kang P., Azad A., Torrelles J. et al. The human macrophage mannose receptor directs Mycobacterium tuberculosis lipoarabinomannan-mediated phagosome biogenesis // JEM. — 2005. — Vol. 202, № 7. — P. 987–999 (www.jem.org/cgi/doi/10.1084/jem.20051239).

Kang T. J., Chae G. T. Detection of Toll-like receptor 2 (TLR2) mutation in the lepromatous leprosy patients // FEMS Immunol. Med. Microbiol. — 2001. — Vol. 31. — P. 53–58.

Katzourakis A., Pereira V., Tristem M. Effects of recombination rate on human endogenous retrovirus fixation and persistence // Journal of Virology. — 2007. — Vol. 81, № 19. — P. 10712—10717.

Kaul M., Zheng J., Okamoto S. et al. HIV-1 infection and AIDS: consequences for the central nervous system // Cell Death and Differentiation. — 2005. — Vol. 12. — P. 878–892.

Kaushal D., Schroeder B. G., Tyagi S. et al. Reduced immunopathology and mortality despite tissue persistence in a Mycobacterium tuberculosis mutant lacking alternative sigma factor, SigH // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2002. — Vol. 99. — P. 8330–8335.

Kelly R. W., Holland P., Skibinski G. et al . Extracellular organelles (prostasomes) are immunosuppressive components of human semen // Clin. Exp. Immunol. — 1991. — Vol. 86. — P. 550–556.

Keckesova Z., Ylinen L., Towers G . Cyclophilin A renders human immunodeficiency virus type 1 sensitive to Old World monkey but not human TRIM5? antiviral activity // Journal of Virology. — 2006. — Vol. 80, № 10. — Р. 4683–4690.

Kelly R. W. , Carr G. G., Critchley H. O. A cytokine swit с h induced by human seminal plasma: an immune modulation with implication for sexually transmitted disease // Human Reproduction. — 1997. — Vol. 12, № 3. — P. 677–681.

Kidwell M. G., Lisch D . Transposable elements as sources of variation in animals and plants // Proc. Nat.l Acad. Sci. USA. — 1997. — Vol. 94. — P. 7704 —77 11.

Klein J., Nicolaidis N. The descent of the antibody — based immune system by gradual evolution // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2005. — Vol. 102, № 1. — P. 169–174.

Khodosevich K., Lebedev Y., Sverdlov E. Endogenous retroviruses and human evolution // Comp. Funct. Genom. — 2002. — Vol. 3. — P. 494–498.

Ko J., Splitter G. A. Molecular host-pathogen interaction in Brucellosis: current understanding and future approaches to vaccine development for mice and humans // Clin. Microbiol. Rev. — 2003. — Vol. 16, № 1. — P. 65–78.

Koening S., Gendelman H. E., Orenstein J. M. et al. Detection of AIDS virus in macrophages in brain tissue from AIDS patients with encephalopathy // Science. — 1986. — Vol. 233. — P. 1089–1093.

Kono Y., Kobayashi K., Fukunaga Y. Serological comparison among various strains of equine infectious anemia virus // Arch. Gesamte Virusforsch. — 1971. — Vol. 34. — P. 202–208.

Kraal G., Broug E., Iwaarden J. F. V. et al. The role of alveolar macrophages in pulmonary immune function //1 st ed. Marcel Dekker, Inc., NY., 1997.

Krull M., Brosius J., Schmitz J. Alu-SINE exonization: en route to protein-coding function // Mol. Biol. Evol. — 2005. — Vol. 22, № 8. — P. 1702–1711.

Kwun H. J., Han H. J., Lee W. J. et al. Transactivation of the human endogenous retrovirus K long terminal repeat by herpes simplex virus type 1 immediate early protein 0 // Virus. Res. — 2002. — Vol. 86. — P. 93—100.

Lander E. S., Linton L. M., Birren L. et al. Initial sequencing and analysis of the human genome // Nature. — 2001 — Vol. 409. — P. 860–921.

Landree M. A., Wibbenmeyer J., Roth D. Mutational analysis of RAG1 and RAG2 identifies three catalytic amino acids in RAG1 critical for both cleavage steps of V(D)J recombination // Genes & Dev. — 1999. — Vol. 13. — P. 3059–3069.

LaRosa G. J., Davide J. P., Weinhold K. et al. Conserved sequence and structural elements in the HIV-1 principal neutralizing domain // Science. — 1990. — Vol. 249. — P. 932–935.

La Scola B., Raoult D. Survival of Coxiella burnetii within freeliving amoeba Acanthamoeba castellanii // Clin. Microbiol. Infect. — 2001. — Vol. 7. — P. 75–79.

La Scola B., Audic S., Robertet C. et al. A giant virus in amoebae // Science. — 2003. — Vol.299, № 5615. — P. 2033.

Lachgar A., Jaureguiberry G., Le Buenac H. et al. Binding of HIV-1 to RBCs involves the Duffy antigen receptors for chemokines (DARC) // Biomed Pharmacother. — 1998. — Vol. 52, № 10. — P. 436–439.

Lander E. S., Linton L. M., Birren B. et al . Initial sequencing and analysis of the human genome // Nature. — 2001. — Vol. 409. — P. 860–921.

Landry J. B., Rouhl A., Medsxtrfyd P. et al. The Opitz syndrome gene Mid1 is transcribed from a human endogenous retroviral promoter // Mol. Biol. Evol. — 2002. — Vol. 19, № 11. — P. 1934–1942.

Lee Ann Campbell, Cho-Chou Kuo, Grayston J. T. Chlamydia pneumoniae and Cardiovascular Disease // Emerging Infectious diseases. — 1998. — Vol. 4, № 4. — P. 571–579.

Lee Y. N., Bieniasz P. Reconstitution of an infectious human endogenous retrovirus // PLoS Pathogens. — 2007. — Vol. 3, № 1. — P. 0119–0130.

Leeflang E. P., Liu W. M., Chesnokov I. N. et al. Phylogenetic isolation of a human Alu founder gene: drift to new subfamily identity // J. Mol. Evol. — Vol. 37. — P. 559–565.

Leffler H., Carlsson S., Hedlund M. et al. Introduction to galectins // Glycoconjugate Journal. — 2004. — Vol. 19. — P. 433–440.

Lewinski M. K, Yamashita M., Emerman M. et al. Retroviral DNA integration: Viral and cellular determinants of target-site selection // PloS Pathog. — 2006. — Vol. 2, № 6. — P. 611–620.

Lehmann M. H., Walter S., Ylisastigui L. et al. Chemotactic activity of HIV-1 for human monocytes // Retrovirology. — Vol. 3 (Supl. 1), S70.

Li X., Gold B., O'Huigin C. et al . Unique features of TRIM5alpha among closely related human TRIM family members // Virology. — 2007. — Vol. 360, № 2. — P. 419 — 33.

Ling J., Pi W., Bollag R. et al . The solitary long terminal repeats of ERV-9 endogenous retrovirus are conserved during primate evolution and possess enhancer activities in embryonic and hematopoietic cells // J. Virol. — 2002. — Vol. 76, № 5. — P. 2410–2423.

Liu R., Paxton W. A., Choe S. et al . Homozygous defect in HIV-1 coreceptor accounts for resistance of some multiply-exposed individuals to HIV-1 infection // Cell. — 1996. — Vol. 86, № 3. — P. 367–377.

Lively C. M., Dybdahl M. F. Parasite adaptation to locally common host genotypes // Nature. — 2000. — Vol. 405. — P. 679–681.

Lo S., Gilbert J., Hetrick F. Stability of human enteroviruses in estuarine and marine waters // Appl. Environ. Microbiol. — 1976. — Vol. 32. — P. 245–249.

Locati M., Murphy P. M. Chemokines and chemokine receptors: biology and clinical relevance in inflammation and AIDS // Annu. Rev. Med. — 1999. — Vol. 50. — P. 425–440.

Lopez-Sanchez P., Costas J., Naveira H. Paleogenomic record of the extinction of human endogenous retrovirus ERV9 // Journal of Virology. — 2005. — Vol. 79, № 11. — Р. 6997–7004.

Lynch С., Gumming J. The distribution of influenza by direct contact-hands and eating utensils // Am. J. Public. Health (N Y). — 1919. — Vol. 9, № 1. — P. 25–38.

Lusso P., Crowley R. W., Malnati M. S. et al . Human herpesvirus 6A accelerates AIDS progression in macaques // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2007. — Vol. 104, №. 12. — P. 5067–5072.

Lurie M., Dannenberg A. Macrophage function in infectious disease with inbred Rrabbits // Bacteriological Reviews. — 1965. — Vol. 26, № 4. — P. 466–476.

Luttrell L. M., van Biesen T., Hawes B. E. et al. G-protein-coupled receptors and their regulation: activation of the MAP kinase signaling pathway by G-roteincoupled receptors // Adv. Second Messenger Phosphoprotein Res. — 1997. — Vol. 31. — P. 263–277.

Lutz S. M., Vincent B. J., Kazazian Jr. et al. Allelic heterogeneity in LINE-1 retrotransposition activity // Am. J. Hum. Genet. — 2003. — Vol. 73. — P. 1431–1437.

Lynch С., Gumming J. The distribution of influenza by direct contact-hands and eating utensils // Am. J. Public. Health (N Y). — 1919. — Vol. 9, № 1. — P. 25–38.

Magin C., Hesse J., Lower J. et al. Corf, the Rev/Rex homologue of HTDV/HERV-K, encodes an arginine-rich nuclear localization signal that xerts a trans-dominant phenotype when mutated // Virology. — 2000. — Vol. 274. — P. 11–16.

Magin-Lachmann C., Hahn S., Strobel H. et al. Rec (formerly Corf) function requires interaction with a complex, folded RNA structure within its responsive element rather than binding to a discrete specific binding site // J. Virol. — 2001. — Vol. 75, № 21. — P. 10359 —1035 71.

Malik S., Abel L., Tooker H. et al . Alleles of the NRAMP1 gene are risk factors for pediatric tuberculosis disease // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2005. — Vol. 102, № 34. — P. 12183—12188.

Mang R., Maas J., Chen X. et al . Identification of a novel type C porcine endogenous retrovirus: evidence that copy number of endogenous retroviruses increases during host inbreeding // Gen. Virol. — 2001. — Vol. 82(Pt 8). — P. 1829–1834.

Mangeney M., Heidmann T. Tumor cells expressing a retroviral envelope escape immune rejection in vivo // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1998. — Vol. 95. — P. 14920 — 14925.

Marketon M., DePaolo P., DeBord K. et al. Plague bacteria target immune cells during infection // Science. — 2005. — Vol. 309, № 5741. — P. 1739–1741.

Marquet S., Schurr E. Genetics of susceptibility to infectious diseases: tuberculosis and leprosy as examples // Drug Metabolism and Disposition. — 2001. — Vol. 29, № 4, Part 2. — P. 478–483.

Marolda C. L., Hauroder B., John M. A. et al. Intracellular survival and saprophytic growth of isolates from the Burkholderia cepacia complex in free-living amoebae // Microbiology. — 1999. — Vol. 145. — P. 1509–1517.

Martin J., Herniou E., Cook J. et al . Human endogenous type-I-related viruses have an apparently widespread distribution within vertebrates // J. Virol. — 1997. — Vol. 71. — P. 437–443.

Masatoshi N. Selectionism and neutralism in molecular evolution // Mol. Biol. Evol. — 2005. — Vol. 22, № 12. — P. 2318–2342.

Massung R., Esposito J. J., Knight J. C. Topography of variola smallpox virus inverted terminal repeats // Virology. — 1995. — Vol. 211, № 1. — P. 350–355.

Matthews R. Classification and nomenclature of viruses // Intervirilogy. — 1979. — Vol. 2., № 3–5. — P. 132–296.

Maurer D., Harrington B., Lane J. Smallpox vaccine: contraindications, administration, and adverse reactions // American Family Physician. — 2003. — Vol. 68, № 5. — P. 889–896.

Mazingue C., Cottrez-Detoeuf F., Louis J. In vitro and in vivo effects of interleukin-2 on the protozoan parasite Leishmania // Europ. J. Immunol. — 1989. — Vol. 19, № 2. — P. 487–492.

Medstrand P., Mager D. L. Human-specific integration of the HERV-K endogenous retrovirus family // J. Virol. — 1998. — Vol. 72. — P. 9782–9787.

Medstrand P., van de Lagemaat L. N., Mager D. L. Retroelement distribution in the human genome: variations associated with age and proximity of genes // Genome Res. — 2002. — Vol. 12. — P. 1483–1495.

McCaffrey R. A., Saunders C., Hensel M. et al . N-Linked glycosylation of the V3 loop and the immunologically silent face of gp120 protects human immunodeficiency virus type 1 SF162 from neutralization by anti-gp120 and anti-gp41 antibodies // Journal of Virology. — 2004. — Vol. 78, № 7. — P. 3279–3295.

McGuire W., Hill A., Allsopp C. et al . Variation in the TNF-a promoter region associated with susceptibility to cerebral malaria // Nature. — 1994. — Vol. 371. — P. 508–511.

McFadden G. Smallpox: An ancient disease enters the modern era of virogenomics // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2004. — Vol. 101, № 42. — P. 14994 — 14995.

McNicholl J., Smith D. K., Qari S. et al. Host genes and: the role of the chemokine receptor gene CCR5 and its allele (32CCR5) // Emerging Infectious diseases. — 1997. — Vol. 3, № 3. — P. 261–272.

Mikl M. C., Watt I. N., Lu M. et al. Mice deficient in APOBEC2 and APOBEC3 // Mol. Cell. Biol. — 2005. — Vol. 25. — P. 7270–7277.

Miller L. Protective selective pressure // Nature. — 1996. — Vol. 383. — P. 480–481.

Miller R. A. Leprosy and AIDS: a review of the literature and speculations on the impact of CD4+ lymphocyte depletion on immunity to Mycobacterium leprae // Int. J. Lepr. Other Mycobact. Dis. — 1991. — Vol. 59, № 4. — P. 639 —6 44.

Minkel J. R. Ten years later, AIDS vaccine search continues // Scientific American. com. — 2007, May 18.

Moyes D. L., Martin A., Saecer S. et al . The distribution of the endogenous retroviruses HERV-K113 and HERV-K115 in health and disease // Genomics. — 2005. — Vol. 86, № 3. — P. 337–341.

Nisole S., Stoye J. P., Saib A . TRIM family proteins: retroviral restriction and antiviral defence // Nat. Rev. Microbiol. — 2005. — Vol. 3. — P. 799–808.

Mollaret H. Conservation experimentale de la pest dans le sol // Bull. Soc. Phatol. Exot. — 1963. — Vol. 56. — P. 1168–1182.

Moses A. E., Adelowo K. A., Nwankwo E. A. Effect of HIV infection on the clinical spectrum of leprosy in Maiduguri // Niger Postgrad. Med. J. — 2001. — Vol. 8, № 2. — P. 74–77.

Moyes D., Griffiths D., Venables P. J. Insertional polymorphism: a new lease of life for endogenous retroviruses in human disease // Trends in Genetics. — 2007. — Vol. 23. — P. 326–333.

Muller V., De Boer R. J. The integration hypothesis: an evolutionary pathway to benign SIV infection // PLoS Pathogens. — 2006. — Vol. 2. — № 3. — P. 149–151.

Nadal D., Leppert D., Frei K. et al . Tumour necrosis factor-alpha in infectious meningitis // Arch. Dis. Child. — 1989. — Vol. 64. — P. 1274–1279.

Najakshin A. M., Mechetina L. V., Alabyev B. Y. et al. Identification of an IL-8 homolog in lamprey (Lampetra fluviatilis ): early evolutionary divergence of chemokines // Eur. J. Immunol. — 1999. — Vol. 29. — P. 375–382.

Nara P., Smit L., Dunlop et al . Evidence for rapid selection and deletion of HIV-1 subpopulations in vivo by V3-specific neutralizing antibody: a model of humoral-associated selection // In 21st Congress of the JABS on Progress in Animal Retroviruses, Annecy, France, 1989 and Dev. BioL Stand. — 1990. — Vol. 72. — P. 315–341.

Nara P. L., Garrity R. R., Goudsmit J. Neutralization of HIV-1: a paradox of humoral proportions // FASEB J. — 1991. — Vol. 5. — P. 2437–2455.

Narayan O., Griffin D. E., Clements J. E. Virus mutation during «slow infection»: temporal development and characterization of mutants of visna virus recovered from sheep // J. Gen. Virol. — 1978. — Vol. 41. — P. 343–352.

Nellaker С., Yao Н., Jones-Brando L. Transactivation of elements in the human endogenous retrovirus W family by viral infection // Retrovirology. — 2006 (http://www.retrovirology.com/content/3/1/44).

Nelson P. N., Hooley P., Roden D. et al. Human endogenous retroviruses: transposable elements with potential? // Clin. Exp. Immunol. — 2004. — Vol. 138. — P. 1–9

New D., Wong J. The evidence for G-protein-coupled receptors and heterotrimeric G proteins in protozoa and ancestral metazoa // Biol. Signals Recept. — 1998. — Vol. 7, № 2. — P. 98—108.

Nicolaisen-Strouss K., Kumar H. P. M., Fitting T. et al . Natural feline leukemia virus variant escapes neutralization by a monoclonal antibody via an mino acid change outside the antibody-binding epitope // J. Virol. — 1987. — Vol. 61. — P. 3410–3415.

Norley S., Beer B., Holzammer S. et al. Why are the natural hosts of SIV resistant to AIDS? // Immunol. Lett. — 1999. — Vol. 66. — P. 47–52.

Nuzhdin S. V. Sure facts, speculations, and open questions about the evolution of transposable element copy number // Genetica. — 1999. — Vol. 107. — P. 129–137.

Odoux C., Albers A., Amoscato A. A. et al. TRAIL, FasL and a blocking anti-DR5 antibody augment paclitaxel-induced apoptosis in human non-small-cell lung cancer// Int. J. Cancer. — 2002. — Vol. 97. — P. 458–465.

Ono M., Kawakami M., Takezawa T A novel human nonviral retroposon derived from an endogenous retrovirus // Nucleic Acids Res. — 1987. — Vol. 15. — P. 8725–8737

Orenstein J. M., Fox C., Wahl S.M. et al. Macrophages as a sours of HIV during opportunistic infection // Science. — 1997. — Vol. 276. — P. 1857–1861.

Ostertag E. M., Kazazian H. Biology of mammalian L1 retrotransposons // Annu. Rev. Genet. — 2001. — Vol. 35. — P. 501–538.

Ostertag E. M., Goodier J., Zhang Y. et al. SVA elements are nonautonomous retrotransposons that cause disease in humans // Am. J. Hum. Genet. — 2003. — Vol. 73. — P. 1444–1451.

Pace II J, K., Feschotte C. The evolutionary history of human DNA transposons: evidence for intense activity in the primate lineage // Genome Res. — 2007. — Vol. 17. — P. 422–432.

Paces J., Pavl?cek A., Paces V. HERVd: database of human endogenous retroviruses // Nucleic Acids Res. — 2002. — Vol. 30. — P. 205–206.

Padow M., Lai L., Fisher R. J. et al. Analysis of human immunodeficiency virus type 1 containing HERV-K protease // AIDS Res. Hum. Retroviruses. — 2000. — Vol. 16, № 18. — P. 1973–1980.

Pagel M., Venditti C., Meade A. Large punctuational contribution of speciation to evolutionary divergence at the molecular level // Science. — 2006. — Vol. 314. — P. 119–121.

Palmero D., Ritacco V., Ambroggi et al . Multidrug-resistant tuberculosis in HIV-negative patients, Buenos Aires, Argentina // Emerging Infectious Diseases. — 2003. — Vol. 9, № 8. — P. 965–969.

Palladino M. J., Keegan L. P., O'Connell M. A. et al. A-to-I pre-mRNA editing in Drosophila is primarily involved in adult nervous system function and integrity // Cell. — 2000. — Vol. 102. — P. 437–449.

Pereira G. A., Stefani M. M., Filho J. A. et al. Human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) and Mycobacterium leprae co-infection: HIV-1 subtypes and clinical, immunologic and histopathologic profiles in a brasilian cohort // Am. J. Trop. Med. Hyg. — 2004. — Vol. 71, № 5. — P. 679–684.

Pillai D.R., Kain K.C. Entamoeba histolytica: identification of a distinct beta2 integrin-like molecule with a potential role in cellular adherence // Exp. Parasitol. — 2005. — Vol. 109, № 3. — P. 135–142.

Pinter C., Siccardi A. G., Longhi R. et al . Direct interaction of complement factor H with the C1 domain of HIV type 1 glycoprotein 120 // AIDS Res. Hum. Retroviruses. — 1995. — Vol. 11. — P. 577–588.

Pogo A. O., Chaudhuri A. The Duffy protein: a malarial and chemokine receptor // Semin. Hematol. — 2000. — Vol. 37. — P. 122–129.

Poignard P., Saphire E. O., Parren P. W. е t al. gp120: Biologic aspects of structural features // Annu. Rev. Immunol. — 2001. — Vol. 19. — P. 253–274.

Polard P., Chandler M. Bacterial transposases and retroviral integrases // Mol. Microbiol. — 1995. — Vol. 15. — P. 13–23.

Polavarapu N., Bowen N., McDonald J. Newly identified families of human endogenous retroviruses // Journal of Virolology. — 2006. — Vol. 80, № 9. — P. 4640–4642.

Porterfield J. S. Antibody-dependent enhancement of viral infectivity // Adv. Virus. Res. — 1986. Vol. 31. — P. 335–355.

Prince A. S. The host response to anthrax lethal toxin: unexpected observations // J. Clin. Invest. — 2003. — Vol. 112. — P. 656–658.

Prince A. M., Brotman B., Lee D. H. et al. Lack of evidence for HIV type 1-related SIVcpz infection in captive and wild chimpanzees (Pan troglodytes verus ) in West Africa. AIDS Res // Hum. Retrovir. — 2002. — Vol. 18. — P. 657–660.

Profy A. T., Salinas P. A., Eckler L. I. et al. Epitopes recognized by the neutralizing antibodies of an HIV-1-infected individual // J. Immunol. — 1990. — Vol. 144. — P. 4641–4648.

Prudhomme S., Bonnaud B., Mallet F. Endogenous retroviruses and animal reproduction // Cytogenet. Genome Res. — 2005. — Vol. 110. — P. 353–364.

Quayle A. J., Xu C., Mayer K. H. et al. T lymphocytes and macrophages, but not motile spermatozoa, are a significant source of human immunodeficiency virus in semen // J. Infect. Dis. — 1997. — Vol. 176, № 4. — P. 960–968.

Quentin Y. The Alu family developed through successive waves of fixation closely connected with primate lineage history // J. Mol. Evol. — 1988. — Vol. 27. — P. 194–202.

Quentin Y. Origin of the Alu family: a family of Alu-like monomers gave birth to the left and the right arms of the Alu elements // Nucleic Acids Res. — 1992. — Vol. 20. — P. 3397–3401.

Radkowski M. T., Laskus T., Goch A. et al. Affinity of anti-GP41 antibody in patients infected with human immunodeficiency virus type I // Eur. J. Clin. Invest. — 1993. — Vol. 23. — P. 455–458.

Rajalingam R., Singal D. P., Mehra N. K. Transporter associated with antigen-processing (TAP) genes and susceptibility to tuberculoid leprosy and pulmonary tuberculosis // Tissue Antigens. — 1997. — Vol. 49. — P. 168–172.

Rajalingam R., Mehra N. K., Singal D. P. Polymorphism in heatshock protein 70-1 (HSP70-1) gene promoter region and susceptibility to tuberculoid leprosy and pulmonary tuberculosis in Asian Indians // Indian J. Exp. Biol. — 2000. — Vol. 38. — P. 658–662.

Rambukkana A., Yamada H., Zanazzi G. et al. Role of a-dystroglycan as a Schwann cell receptor for Mycobacterium leprae // Science. — 1998. — Vol. 282 . — P. 2076–2079.

Ramirez M., Sigal L. Macrophages and dendritic cells use the cytosolic pathway to rapidly cross-present antigen from live, vaccinia-infected cells // The Journal of Immunology. — 2002. — Vol. 169. — P. 6733–6742.

Rausch J. W., Le Grice S. F. Purine analog substitution of the HIV-1 polypurine tract primer defines regions controlling initiation of plus-strand DNA synthesis // Nucleic Acids Rec. — 2007. — Vol. 35, № 1. — P. 256–268.

Reid A. H., Fanning T., Hultin J. V. et al. Origin and evolution of the 1918 «spanish» influenza virus hemagglutinin gene // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1999. — Vol. 96. — P. 1651–1656.

Reid A. H., Fanning T., Janczewski T. A. et al . Characterization of the 1918 «Spanish» influenza virus neuraminidase gene // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2000. — Vol. 97. — P. 6785–6790.

Reid A. H., Fanning T. G., Janczewski T. A. et al. Characterization of the 1918 «spanish» influenza virus matrix gene segment // J. о f Virology. — 2002. — Vol. 76, № 21. — Р. 10717—10722.

Ribot W., Panchal R., Brittingham K. et.al. Anthrax lethal toxin impairs innate immune functions of alveolar macrophages and facilitates Bacillus anthracis survival // Infection and Immunity. — 2006. — Vol. 74, № 9. — Р. 5029–5034.

Rizzon C., Marais G., Gouy M. et al. Recombination rate and the distribution of transposable elements in the Drosophila melanogaster genome // Genome Research. — 2002. — Vol. 12. — P. 400–407 (http://www.genome.org/cgi/doi/10.1101/ gr.210802).

Robinson W. E, Montefiori D. C, Mitchell W. M . Antibody-dependent enhancement of human immunodeficiency virus type 1 infection // Lancet. — 1988. — Vol. 9, № 1. — P. 790–794.

Rodriguez-Zaragoza S. Ecology of free-living amoebae // Crit. Rev. Microbiol. — 1994. — Vol. 20. — P. 225–241.

Rocha-Azevedo B., Jamerson M., Cabral G. A. et al. The interaction between the amoeba Balamuthia mandrillaris and extracellular matrix glycoproteins in vitro // Parasitology. — 2007. — Vol. 134. — P. 51–58.

Rogers J., Dowsett A. B., Dennis P.J. et al. Influence of temperature and plumbing material selection on biofilm formation and growth of Legionella pneumophila in a model potable water system containing complex microbial flora // Appl. Environ. Microbiol. — 1994. — Vol. 60. — P. 1585–1592.

Ronai D., Iglesias-Ussel M. D., Fan V. et al. Complex regulation of somatic hypermutation by cis-acting sequences in the endogenous IgH gene in hybridoma cells // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2005. — Vol. 102, № 33. — P. 11829 — 11834.

Roop R. M., Bellaire B. H., Valderas M. et al. Adaptation of the brucellae to their intracellular niche // Molecular Microbiology. — 2004. — Vol. 52, № 3. — P. 621–630.

Roth M. J., Schwartzberg P. L., Goff S. P. Structure of the termini of DNA intermediates in the integration of retroviral DNA: dependence on IN function and terminal DNA sequence // Cell. — 1989. — Vol. 58, № 1. — P. 47–54.

Rubins K., Hensley L., Jahrling P. et al. The host response to smallpox: analysis of the gene expression program in peripheral blood cells in a nonhuman primate model // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2004. — Vol. 101, № 42. — P. 15190 — 15195.

Rupprecht C., Smith S., Fekadu M. et al . The ascension of wildlife rabies: a case for public health concern or intervention // Emerging Infectious Diseases. — 1995. — Vol. 1 № 4. — P. 107–114.

Ruthel G., Ribot W. J., Hoover T. A. et al. Time-lapse confocal imaging of development of Bacillus anthracis in macrophage // J. Infect. Dis. — 2004. — Vol. 189. — P. 1313–1316.

Sabeti P. C., Walsh E., Schaffner S . The case for selection at CCR5-^32 // PLoS Biology. — 2005. — Vol. 3, № 11. — P. 1963–1969.

Samaranayake Y., Samaranayake L. Candida krusei: biology, epidemiology, pathogenicity and clinical manifestations of an emerging pathogen // J. Med. Microbiol. — 1994. — Vol.41, № 5. — P.295–299.

Santiago M.L., Range F., Keele B.F. et al. Simian immunodeficiency virus infection in free-ranging sooty mangabeys (Cercocebus atys atys) from the Tai Forest, Cote d ' Ivoire: Implications for the origin of epidemic human immunodeficiency virus type 2 // J. Virol. — 2005. — Vol. 79. — P. 12515 — 12527.

Santiago M. L., Rodenburg C. M., Kamenya S. et al. SIVcpz in wild chimpanzees // Science. — 2002. — Vol. 295. — P. 465.

Sasaki S., Takeshita F., Okuda K. et al. Mycobacterium leprae and leprosy: a compendium // Microbiol. Immunol. — 2001. — Vol. 45, № 11. — P. 729–736.

Scanlan C.N., Pantophlet R., Wormald M.R. et al. The broadly neutralizing anti-human immunodeficiency virus type 1 antibody 2G12 recognizes a cluster of alpha1->2 mannose residues on the outer face of gp120 // J. Virol. — 2002. — Vol. 76. — P. 7306–7321.

Shaw M.A., Donaldson I.J., Collins A. et al. Association and linkage of leprosy phenotypes with HLA class II and tumour necrosis factor genes // Genes Immun. — 2001. — Vol. 2. — P. 196–204.

Shen L., Wu L.C., Sanlioglu S. et al . Structure and genetics of the partially duplicated gene RP located immediately upstream of the complement C4A and the C4B genes in the HLA class III region: molecular cloning, exon-intron structure, composite retroposon, and breakpoint of gene duplication // J. Biol. Chem. — 1994. — Vol. 269. P. 8466–8476.

Schlesinger L.S., Hull S.R., Kaufman T.M. Binding of the terminal mannosyl units of lipoarabinomannan from a virulent strain of Mycobacterium tuberculosis to human macrophages // J. Immunol. — 1994. — Vol. 15. — P. — 4070–4079.

Schluger N. W . Immunology of tuberculosis // Indian. J. Med. Res. — 2004. — Vol. 120. — P. 213–232.

Schluger N. W. The pathogenesis of tuberculosis. The first one hundred (and twenty-three) years // Am. J. Respir. Cell. Mol. Biol. — 2005. — Vol 32. — P. 251–256.

Schuchat A., Deaver K., Wenger J. et al . Role of foods in sporadic listeriosis. 1. Case-control study of dietary risk factors // JAMA. — 1992. — Vol. 267, № 12. — P. 2041–2050.

Scollard D. M., Adams L. B., Gillis T. P. et al . The continuing challenges of leprosy // Clinical Microbiology Reviews. — 2006. — Vol. 19, № 2. — Р. 338–381.

Senkevich T. G., Koonin E. V., Buller R. M. L. A poxvirus protein with a RING zinc finger motif is of crucial importance for virulence // Virology. — 1994. — Vol. 198. — P. 118–128.

Shankarappa R., Margolick J.B., Gange S. et al. Consistent viral evolutionary changes associated with the progression of human immunodeficiency virus type 1 infection // J. of Virology. — 1999. — Vol. 73. — № 12. — P. 10489 — 10502.

Sharp P. M., Bailes E., Gao F. et al. Origins and evolution of AIDS viruses: estimating the time-scale // Biochem. Soc. Trans. — 2000. — Vol. 28. — P. 275–282.

Sharp P. M., Shaw G. M., Hahn B. H. Simian immunodeficiency virus infection of chimpanzees // J. Virol. — 2005. — Vol. 79. — P. 3891–3902.

Shen L., Wu L. C., Sanlioglu S. et al. Structure and genetics of the partially duplicated gene RP located immediately upstream of the complement C4A and the C4B genes in the HLA class III region: molecular cloning, exon-intron structure, composite retroposon, and breakpoint of gene duplication // J. Biol. Chem. — 1994. — Vol. 269. — P. 8466–8476.

Shih A., Coutavas E., Rush M.G. Evolutionary implications of primate endogenous retroviruses // Virolog. — 1991. — Vol. 182. — P. 495–502.

Silvestri G., Sodora D.L., Koup R.A. et al. Nonpathogenic SIV infection of sooty mangabeys is characterized by limited bystander immunopathology despite chronic high-level viremia // Immunity. — 2003. — Vol. 18. — P. 441–452.

Singh P., Kaur G., Sharma G. et al. Immunogenetic basis of HIV-1 infection, transmission and disease progression // Vaccine. — 2008. — doi:10.1016/j.vaccine.2008.01.012 (in press).

Singer S. S., Maennel D. N., Hehlgans T. et al. From ‘‘junk'' to gene: curriculum vitae of a primate receptor isoform gene // J. Mol. Biol. — 2004. —Vol. 341. — P. 883–886.

Smalheiser N.R., Torvik V.I. Alu elements within human mRNAs are probable microRNA targets // Trends Genet. — 2006. — Vol. 22. — P. 532–536.

Smith H. The revival of interest in mechanisms of bacterial pathogenicity // Biol. Rev. — 1995. — Vol. 70, № 2. — P. 277–316.

Smith I. Mycobacterium tuberculosis pathogenesis and molecular determinants of virulence // Microbiology Reviews. — 2003. — Vol. 16, № 3. — P. 463–496.

Smith S.A., Kotwal G.J. Immune response to poxvirus infections in various animals // Crit. Rev. Microbiol. — 2002. — Vol. 28, № 3. — P. 149–185.

Sorek R., Ast G., Graur D. Alu-containing exons are alternatively spliced // Genome Res. — 2002. — Vol. 12. — P. 1060–1067.

Sorek R., Lev-Maor G., Reznik M. et al. Minimal conditions for exonization of intronic sequences: 50 splice site formation in Alu exons // Mol. Cell. — 2004. — Vol. 14. — P. 221–231.

Sorvillo F., Lieb L., Waterman S. Incidence of campylobacteriosis among patients with AIDS in Los Angeles county // J. Acquir. Immune. Defic. Syndr. Hum. Retrovirol. — 1991. — Vol. 4, № 3. — P. 598–602.

Spencer T. E., Mura M., Gray C. A. et al. Receptor usage and fetal expression of ovine endogenous betaretroviruses: implications for coevolution of endogenous and exogenous retroviruses // J. Virol. — 2003. — Vol. 77. — P. 749–753.

Spencer J. A., Van Dijk A. A., Horzinek M. C. et al. Incidence of feline immunodeficiency virus reactive antibodies in free-ranging lions of the Kruger National Park and the Etosha National Park in southern Africa detected by recombinant FIV p24 antigen Onderstepoort // J. Vet. Res. — 1992. — Vol. 59. — P. 315–322.

Sprenger H., Krause A., Kaufmann A. et al. Borrelia burgdorferi induces chemokines in human monocytes // Infect. Immun. — 1997. — Vol. 65. — P. 4384–4388.

Spriggs M. K., Koller B. H., Sato T. et al. b 2 — microglobulin-, CD8 + T-cell-deficient mice survive inoculation with high doses of vaccinia virus and exhibit altered IgG responses // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1992. — Vol. 89. — P. 6070–6078.

Stanford M., McFadden G., Karupiah G. Immunopathogenesis of poxvirus infections: forecasting the impending storm // Immunology and Cell Biology. — 2007. — Vol. 85. — P. 93 — 102.

Stanley J. S., Bhaduri L. M., Narayan O. et al . Topographical rearrangements of visna virus envelope glycoprotein during antigenic drift // J. Virol. — 1987. — Vol. 61. — P. 1019–1028.

Stengel A., Roos C., Hunsmann G. et al. Expression profiles of endogenous retroviruses in Old World monkeys // Journal of Virolology. — 2006. — Vol. 80, № 9. — P. 4415–4421.

Stevenson M., Gendelman H.E. Cellular and viral determinants that regulate HIV-1 infection in macrophages // J. Leukoc. Biol. — 1994. — Vol. 56. — P. 278–288.

Stevenson M. HIV-1 pathogenesis // Nat. Med. — 2003. — Vol. 9. — P. 853–860.

Straley S., Harmon P. Yersinia pestis grows within phagolysosomes in mouse peritoneal macrophages // Infection and Immunity. — 1984. — Vol. 45, № 3. — P. 655–659.

Stremlau M., Owens C. M., Perron M. J. et al. The cytoplasmic body component TRIM5alpha restricts HIV-1 infection in Old World monkeys // Nature. — 2004. — Vol. 427. — P. 848–853.

Su Hua-Poo., Garman S., Allison T.J. et al. The 1.51-A structure of the poxvirus L1 protein, a target of potent neutralizing antibodies // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2005. — Vol. 102. — № 12. — 4240–4245.

Supotnitskii M. V. After AIDS // Mendeleev Chemistry Journal. — 1995. — Vol. 40, № 2. — P. 189–208.

Sutkowski N., Conrad B., Thorley-Lawson D. A. et al . Epstein — Barr virus transactivates the human endogenous retrovirus HERVK18 that encodes a superantigen // Immunity. — 2001. — Vol. 15. — P. 579–590.

Sverdlov E. D . Retroviruses and primate evolution // Bioessays. — 2000. — Vol. 22. — P. 161–171.

Switzer W. M., Parekh B., Shanmugam V. et al . The epidemiology of simian immunodeficiency virus infection in a large number of wild- and captive-born chimpanzees: evidence for a recent introduction following chimpanzee divergence // AIDS Res. Hum. Retrovir. — 2005. — Vol. 21. — P. 335–342.

Szafranski K., Dingermann T., Glockner G. et al. Template jumping by a LINE reverse transcriptase has created a SINE-like 5S rRNA retropseudogene in Dictyostelium // Mol. Gen. Genomics. — 2004. — Vol. 271. — P. 98 — 102.

Tadmori W., Mondal D., Tadmori I. et al . Transactivation of human immunodeficiency virus type 1 long terminal repeats by cell surface tumor necrosis factor alpha // J. Virol. — 1991. — Vol. 65. — P. 6425–6429.

Takeda A., Tuazon C.U., Ennis F.A. Antibody-enhanced infection by HIV-1 via Fc receptor-mediated entry // Science. — 1988. — Vol. 242. — № 4878. — P. 580 — 5833.

Talbot E.A., Perkins M.D., Fagunes S. et al. Disseminated bacille Calmette-Guerin disease after vaccination: case report and review // Clin. Infect. Dis. — 1997. — Vol. 24. — P. 1139–1146.

Tang W., Gunn T. M., McLaughlin D. F. et al . Secreted and membrane attractin result from alternative splicing of the human ATRN gene // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2000. — Vol. 97. — P. 6025–6030.

Tapinos N., Rambukkana A. Insights into regulation of human Schwann cell proliferation by Erk1/2 via a MEK-independant and p56Lck-dependent pathway from leprosy bacilli // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2005. — Vol. 102. — P. 9188–9193.

Taubenberger J.K., Reid A. H., Krafft A. E. et al. Initial genetic characterization of the 1918 «spanish» influenza virus // Science. — 1997. — Vol. 275. — P. 1793–1796.

Taubenberger J.K., Reid A.H., Fanning T. et al . The 1918 innfluenza virus: a killer comes into viev // Virilogy. — 2000. — Vol. 274. — P. 241–245.

Tendler C. L., Greenberg S. J., Blattner W. A. et al. Transactivation of interleukin-2 and its receptor induces immune activation in human T-cell lymphotropic virus type I-associated myelopathy: pathogenic implications and a rationale for immunotherapy // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1990. — Vol. 87. — P. 5218–5222.

Tirado S. M., Yoon K. S. Antibody-dependent enchancement of virus infection and disease // Viral. Immunol. — 2003. — Vol. 164, № 1. — P. 69–86.

Toth F. D., Mosborg-Petersen P., Kiss J. et al. Antibody-dependent enhancement of HIV-1 infection in human term syncytiotrophoblast cells cultured in vitro // Clin. Exp. Immunol. — 1994. — Vol. 96, № 3. — Р. 389–394.

Towers G. J., Hatziioannou T., Cowan S. et al . Cyclophilin A modulates the sensitivity of HIV-1 to host restriction factors // Nat. Med. — 2003. — Vol. 9. — P. 1138–1143.

Towers G. J. The control of viral infection by tripartite motif proteins and cyclophilin A // Retrovirology. — 2007. — 4:40 doi:10.1186/1742-4690-4-40 (www.retrovirology.com/content/4/1/40).

Thali M., Bukovsky A., Kondo E. et al. Functional association of cyclophilin A with HIV-1 virions // Nature. — 1994. — Vol. 372. — P. 363–365.

Thom S., Warhurst D., Drasar B. S. Association of Vibrio cholerae with fresh water amoebae // J. Med. Microbiol. — 1992. — Vol. 36. — P. 303–306.

Thomas H. I., Wilson S., O”Tolle C. M. et al. Differential maturation of avidity of IgG antibodies to gp41, p24 and p17 following infection with HIV-1 // Clin. Exp. Immunol. — 1996. — Vol. 103. — P. 185–191.

Trindade M. A. B., Valente N.Y.S., Manini M.I.P. et al. Two patients coinfected with Mycobacterium leprae and Human immunodeficiency virus type 1 and na?ve for fntiretroviral therapy who exhibited type 1 leprosy reactions mimicking the Immune reconstitution inflammatory syndrome // J. of Clinicfl Microbiology. — 2006. — Vol. 44, № 12. — P. 4616–4618.

Trujillo R., Rogers R., Molina R. et al. Noninfectious entry of HIV-1 into peripheral and brain macrophages mediated by the mannose receptor // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2007. — Vol. 104, № 12. — P. 5097–5102.

Turner G., Barbulescu M., Su Mei et al. Insertional polymorphisms of full-length endogenous retroviruses in humans // Current Biology. — 2001 — Vol. 11, № 19. — P. 1531–1535.

Urnovitz H., Murphy W. Human endogenous retroviruses: nature, occurrence, and clinical implications in human disease // Clinical Microbiology Reviews. — 1996. — Vol. 9, № 1. — P. 72–99.

van de Lagemaat L. N., Landry J. R., Mager, D. L. et al . Transposable elements in mammals promote regulatory variation and diversification of genes with specialized functions // Trends Genet. — 2003. — Vol. 19. — P. 530–536.

Valente L., Nishikura K. ADAR gene family and A — I RNA editing: diverse roles in posttranscriptional gene regulation // Prog. Nucleic. Acid. Res. Mol. Biol. — 2005. — Vol. 79. — P. 299–338.

Varon R., Gooding R., Steglich C. et al. Partial deficiency of the C-terminal-domain phosphatase of RNA polymerase II is associated with congenital cataracts facial dysmorphism neuropathy syndrome // Nature Genet. — 2003. — Vol. 35. — P. 185–189.

Vazquez P., Basualdo S., Reyes-Teran G. et al. Human Immunodeficiency virus type 1 in seronegative infants born to HIV-1-infected mothers // Virology Journal. — 2006. — Vol. 3, № 52 (http://www.virologyj.com/content/3/1/52).

Vazquez N., Greenwell-Wild T., Marinos N. J. et al . Human Immunodeficiency virus type 1-induced macrophage gene expression includes the p21 gene, a target for viral regulation // Journal of Virology. — 2005. — Vol. 79, № 7. — P. 4479–4491.

Vernazza P. L., Gilliam B. L., Dyer J. et al. Quantification of HIV in semen: correlation with antiviral treatment and immune status // AIDS. — 1997. — Vol. 11, № 11. — P. 987–993.

Wahl S. M., Greenwell-Wild T., Peng G. et al . Co-infection with opportunistic pathogens promotes human immunodeficiency virus type 1 infection in macrophages // J. Infect. Dis. — 1999. — Vol. 179. — P. 457–460.

Wahl S. M., Greenwell-Wild T., Hale-Donze H. et al. Permissive factors for HIV-1 infection of macrophages //J. Leukoc. Biol. — 2000. — Vol. 68. — P. 303–310.

Wahl S., Greenwell-Wild T., Gang Peng et al . Viral and host cofactors facilitate HIV-1 replication in macrophages // J. Leukoc. Biol. — 2003. —Vol. 74. — P. 726–735.

Wahl S., Greenwell-Wild T., Vazquez N. HIV accomplices and adversaries in macrophage infection // J. Leukoc. Biol. — 2006. — Vol. 80. — P. 973–983.

van den Broek J., Chum H. J., Swai R. et al. Association between leprosy and HIV infection in Tanzania // Int. J. Lepr. Other Mycobact. Dis. — 1997. — Vol. 65, № 2. — P. 203–210.

Wang S. Z., Rushlow K. E., Issel C. J. et al. Enhancement of EIAV replication and disease by immunization with a baculovirus-expressed recombinant envelope surface glycoprotein // Virology — 1994. — Vol. 199. — P. 247–251.

Wang-Johanning F., Frost A. R., Jian B. et al. Quantitation of HERV-K env gene expression and splicing in human breast cancer // Oncogene. — 2003. — Vol. 22. — P. 1528–1535.

Weichenrieder O., Wild K., Strub K. et al. Structure and assembly of the Alu domain of the mammalian signal recognition particle // Nature. — 2000. — Vol. 408. — P. 167–173.

Weisburg W. G., Woese C. R., Dobson M. E. et al. A common origin of rickettsiae and certain plant pathogens // Science. — 1985. — Vol. 230. — P. 556–558.

Wei X., Decker J.M., Hui H. et al. Antibody neutralization and escape by HIV-1 // Nature. — 2003. — Vol. 422, № 6929. — P. 307–312.

Werner G.T., Jentzsch U., Metzger E. et al. // Arch. Virol. — 1968. — Vol. 64, № 3. — P. 247–256.

Westby M., Lewis M., Whitcomb J. et al . Emergence of CXCR4-using human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) variants in a minority of HIV-1-infected patients following treatment with the CCR5 antagonist maraviroc is from a pretreatment CXCR4-using virus reservoir // Journal of Virology. — 2006. — Vol. 80, № 10. — Р. 4909–4920.

Wilson A., Symons J., McDowell T. et. al . Effects of polymorphism in the tumor necrosis factor alpha promoter on transcriptional activation // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1997. — Vol. 94, № 10. — P. 3195–3199.

Winiecka-Krusnell J., Wreiber K., A. von Euler L. et al. Free-living amoebae promote growth and survival of Helicobacter pylori // Scand. J. Infect. Dis. — 2002. — Vol. 34. — P. 253–256.

Wood D., Richmond B. Human evolution: taxonomy and paleobiology // J. Anat. — 2000. — Vol. 196. — P. 19–60.

Wolfe N. D. et al . Wild primate populations in emerging infectious disease research: the missing link? // Emerg. Infect. Dis. — 1998. — Vol. 4? № 2. — P. 1 49 —1 58.

Wolf T. F., DeJong J., Van Den Berg H. et al . Evolution of sequences encoding the principal neutralization epitope of human immunodeficiency virus type 1 is host dependent, rapid and continuous // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 1990. — Vol. 87. — P. 9938–9942.

Woude S.V., Apetrei C. Going Wild: Lessons from Naturally Occurring T-Lymphotropic Lentiviruses // Clinical Microbiology Revievs. — 2006. — Vol. 19, № 4. — P. 728–762.

Wu Lien-Ten U.A., Chun J.W., Pollitzen R. et al . Plague. A manual for medical and public health workers. — Shanghai, 1936.

Wu S., Spouge J., Conley S. et al . Human plasma enhances the infectivity of primary human immunodeficiency virus type 1 isolates in peripheral blood mononuclear cells and monocyte-derived macrophages // Journal of Virology. — 1995. — Vol. 69, № 10. — P. 6054–6062.

Wyatt R., Kwong P.D., Desjardins E. et al. Structure of an HIV gp120 envelope glycoprotein in complex with the CD4 receptor and a neutralizing human antibody // Nature. — 1998. — Vol. 393. — P. 705–711.

Xin-He Lai, Golovliov I., Sjostedt A. Francisella tularensis induces cytopathogenicity and apoptosis in murine macrophages via a mechanism that requires intracellular bacterial multiplication // Infection and Immunity. — 2001. — Vol. 69, № 7. — P. 4691–4694.

Xu R., Johnson A., Liggitt D. et al. Cellular and humoral immunity against vaccinia virus infection of mice // The Journal of Immunology. — 2004. — Vol. 172. — P. 6265–6271.

Xuminer D., Rosenfeld G.B., Pitlik S.D. AIDS in pre-AIDS era // Rev. Infect. Dis. — 1987. — Vol.9. — P.1102–1109.

Yoneyama H., Harada A., Imai T. et al. Pivotal role of TARC, a CC chemokine, in bacteria-induced fulminant hepatic failure in mice // J. Clin. Investig. — 1998. — Vol. 102. — P. 1933–1941.

Zagury D. Anti-HIV cellular immunotherapy in AIDS // Lancet. — 1991. — Vol. 338, № 8768. — P. 694–695.

Zennou V., Perez-Caballero D., Gottlinger H. et al. APOBEC3G incorporation into human immunodeficiency virus type 1 particles // J. Virol. — 2004. — Vol. 78. — P. 12058 — 12061.

Zhang F., Hatziioannou T., Perez-Caballero D. et al. Antiretroviral potential of human tripartite motif-5 and related proteins // Virology. — 2006.

Zhang Kun-Lin, Mangeat B., Ortiz M. et al . Model structure of human APOBEC3G // PLoS ONE. — 2007. — Vol. 2, № 4. — Р. 1–6.

Zhang H., Hoffmann F., He J. et al . Evolution of subtype C HIV-1 Env in a slowly progressing Zambian infant // Retrovirology. — 2005 (http://www.retrovirology.com/content/2/1/6).

Zhantao Yang, Zhinyi Cao, Panjwani N. Pathogenesis of Acanthamoeba keratitis: carbohydrate mediated host-parasite interactions // Infection and Immunity. — 1997. — Vol. 65, №. 2. — P. 439–445.

Zhu Z. B, Hsieh S. L, Bentley D. R. et al. A variable number of tandem repeats locus within the human complement C2 gene is associated with a retroposon derived from a human endogenous retrovirus // J. Exp. Med. — 1992. — Vol. 175. — P. 1783–1787

Zwick M. B., Labrijn A.F., Wang M. et al. Broadly neutralizing antibodies targeted to the membrane-proximal external region of human immunodeficiency virus type 1 glycoprotein gp41 // J. Virol. — 2001. — Vol. 75. — P. 10892 — 10905.

Zwick M.B., Saphire E.O., Burton D.R. gp41: HIV's shy protein // Nat. Med. — 2004. — Vol. 10. — P. 133–134.