Город Гераклион был обнаружен под водой спустя 1200 лет. Современным ученым мало что известно о нем, но его знал весь древний мир. Так, например, греческий историк Диодор писал, что Геракл, сын Зевса, преградил течение Нила и тем самым спас людей, находившихся на берегу реки. В благодарность они воздвигли храм его имени и назвали в его честь город. Согласно другому греческому историку, Геродоту, Елена Прекрасная и ее возлюбленный Парис бежали в Гераклион, спасаясь нем от гнева мужа Елены, Менелая, но их заставил вернуться Тонис, страж ворот Нила. Несколько иначе рассказывает об этих событиях греческий историк VI в. Стесихор. Он говорит, что греки были введены в заблуждение богами по поводу местонахождения Елены Прекрасной для того, чтобы с помощью войны сократить население Трои. На самом деле, считает Стесихор, во время Троянской войны Елена находилась в Гераклионе.
В первом веке до н. э. произошло сильное землетрясение, и в мгновение ока Гераклион исчез с лица земли. На протяжении двух тысячелетий его руины были скрыты под водой. Но недавно французский археолог Франк Годьо объявил, что он обнаружил останки города, которые, по его мнению, относятся к Гераклиону: черную гранитную плиту или стелу, на которой написано слово «Гераклион», останки десяти кораблей в бывшей гавани, а также тысячи других предметов, включая драгоценности, монеты, вазы и личные вещи.
Надпись на основании стелы удостоверяет, что эта плита должна была быть воздвигнута в «Гераклеоне-Тронисе». Это первое ясное доказательство того, что обнаруженный город является полумифическим до сих пор Гераклионом.
Археолог Франк Годьо не нашел доказательств пребывания здесь Елены Прекрасной, но его открытие представляется фантастическим. Одним из первых был найден великий храм Гераклиона.
Остатки толстых каменных стен указывают на границу его территории. Рядом с разрушенными стенами археологи нашли три огромных статуи из розового гранита, которые предположительно были повержены в ходе землетрясения. Две статуи изображают до сих пор неизвестного фараона и его жену. Третья статуя изображает Хапи, египетского бога разлива Нила.
Внутри храма находится монументальная гробница из розового гранита, покрытая иероглифами. Ее верхняя часть до сих пор представляет трудности для прочтения, однако предварительный перевод текстов, помещенных на нижних частях, показывает, что это, несомненно, храм Гераклиона. Ряд ученых, в том числе Манфред Клаусе из Франкфуртского университета, полагает, что окончательная расшифровка надписей на гробнице даст еще больше.
Еще большее впечатление производит двухметровая черная гранитная стела — почти полная копия стелы, найденной в 1899 г. в Нократже. Это первый случай дублирования стел в египтологии. Стела из Нократжа, которая сейчас находится в египетском музее в Каире, несет на себе текст указа фараона Ноктанебуса Первого, основателя 30-й династии, который вступил на престол в ноябре 380 г до н. э. Этим указом вводился 10-процентный налог на греческих ремесленников и товары в Нократже и Тонисе, который должен был направляться на строительство храма богине Нейт. Текст заканчивается словами: «И сказал его Величество: „Пусть это будет высечено на стеле, воздвигнутой в Нократже, на берегу канала Ану“». Найденная стела не отличается от первой ничем, за исключением последнего предложения, в котором говорится: «И сказал его Величество: „Пусть это будет высечено на стеле, установленной на входе в греческое море в Гераклионе-Тонисе“».
Группа Годьо также нашла место, где располагалась гавань Гераклиона, в которой сейчас находятся обломки, по крайней мере, 10 кораблей, сваленных в кучу. Это позволяет предположить, что они погибли от приливной волны, последовавшей за землетрясением.
Везде, где исследователи осматривали подводный город, они находили разнообразные предметы. Все они датируются периодом от первого века до н. э. и ранее. Большинство из них — в хорошем состоянии, несмотря на пребывание под водой в течение 2 тысяч лет.
Среди находок — золотые серьги, браслеты, шпильки, кольца, гребни, Красивый греческий кубок, покрытый глазурью, курительница для ароматических веществ, сотни монет. У всех у них только слегка поцарапана поверхность. Находки поразили ученых. Раскопки продолжаются и по сей лень. Ученые делают все новые открытия. И скорее всего мы еще не раз услышим о великом городе Гераклион.