В целом порядок ревизии финансовой отчетности унитарного предприятия такой же, как и порядок ревизии обычных коммерческих организаций. Вместе с тем в бухгалтерском учете таких предприятий есть ряд особенностей. Например, порядок отражения передачи имущества в хозяйственное ведение (оперативное управление) унитарному предприятию сверх определенного уставными документами уставного фонда и изъятия такого имущества разъяснен письмами Минфина РФ, в соответствии с которыми стоимость полученных основных средств «на баланс» унитарного предприятия, без увеличения уставного капитала, должна отражаться как увеличение прибыли унитарного предприятия, что конечно, несколько искажает данные о реальной прибыли по данным бухгалтерского баланса.
Контроль за деятельностью унитарных предприятий направлен на повышение эффективности использования федерального имущества, закрепленного за данными предприятиями. К контролю за деятельностью унитарного предприятия можно отнести утверждение показателей экономической эффективности его деятельности и контролирование их выполнения. В целях проведения анализа эффективности деятельности предприятий соответствующему органу исполнительной власти рекомендуется образовывать балансовую комиссию, задачами которой, в частности, являются оценка эффективности использования имущества предприятиями и контроль за выполнением утверждаемых показателей экономической эффективности деятельности предприятий.
Комиссия анализирует представленные материалы и по результатам анализа оценивает качество систем управления предприятий, а также уровень профессиональной компетентности руководителей предприятий. Комиссия может давать рекомендации по повышению эффективности деятельности предприятий, осуществлять повторное рассмотрение документов предприятий. Определение величин показателей экономической эффективности деятельности унитарных предприятий осуществляется федеральными органами исполнительной власти, на которые возложены координация и регулирование деятельности в соответствующих отраслях или сферах управления. Такие величины определяются ежегодно до начала отчетного года на основании программ (планов) деятельности унитарных предприятий; бухгалтерской и иной отчетности; данных реестра показателей экономической эффективности деятельности федеральных государственных унитарных предприятий; иных информационных ресурсов. Определение фактически достигнутых за отчетный период величин показателей экономической эффективности деятельности унитарных предприятий осуществляется руководителями унитарных предприятий ежеквартально в соответствии с законодательством о бухгалтерском учете.
Для оценки экономической эффективности деятельности унитарных предприятий утверждаются и анализируются на предмет фактического достижения величины следующих показателей (в тыс. руб.): выручка (нетто) от продажи товаров, продукции, работ, услуг (за минусом налога на добавленную стоимость, акцизов и аналогичных обязательных платежей); • чистая прибыль; • часть прибыли, подлежащая перечислению в федеральный бюджет; • чистые активы.