Государство осуществляет регулирование инновационных процессов как прямыми, так и косвенными методами.
Исключительной прерогативой государства является правовое регулирование инновационных процессов.
Эффективность инновационных процессов существенно повышается при использовании механизмов конкурсности в распределении бюджетных средств. Этой цели могут служить специальные бюджетные или частично бюджетные (смешанные) фонды: Российский фонд технологического развития (РФТР), Фонд содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере, Федеральный фонд производственных инноваций и др.
Центральное место в системе прямого государственного регулирования занимает финансирование НИР и ОКР и инновационных проектов из бюджетных средств. Важное значение для генерирования нововведений и создания первоначального спроса на инновации имеют государственные контракты на выполнение НИР и ОКР и государственные заказы на инновационную продукцию.
Важный элемент прямой поддержки инновационных процессов – формирование государственной инновационной инфраструктуры. Государство может создавать сети центров распространения нововведений и консультационных центров, оказывающих деловые услуги инноваторам; способствует формированию рынка инноваций; осуществляет мониторинг и прогнозирование инновационных процессов в стране и за рубежом, а часто и поиск наиболее эффективных передовых технологий для широкого внедрения и т. д.
Определению рациональных ориентиров инновационной деятельности способствует прогнозирование науки и технологий на государственном уровне.
К методам прямого регулирования инновационной деятельности относятся меры моральной поддержки: вручение государственных наград, присвоение почетных званий, участие представителей научно-технической интеллигенции в важнейших государственных мероприятиях и т. п.
Немаловажную роль играет государство в подготовке кадров, формировании социального слоя менеджеров по управлению инновационными проектами.
Косвенные методы государственной поддержки инноваций опосредованно стимулируют инновационную деятельность, требуют значительно меньших бюджетных затрат по сравнению с прямым финансированием, ими может быть охвачен гораздо больший круг инновационных субъектов.
К мерам косвенного регулирования относятся прежде всего налоговые льготы. Льготное налогообложение прибыли реализуется как путем сокращения налогооблагаемой базы, так и путем уменьшения налоговых ставок, вычетами из налоговых платежей. Первый способ осуществляется через отнесение различного рода инновационных затрат на издержки производства. Второй путь находит отражение в различных льготах по уплате налога на прибыль. В РФ основная инновационная льгота по налогу на прибыль состоит в уменьшении облагаемой прибыли на сумму средств, направленных на техническое перевооружение, реконструкцию, расширение, обновление производства. Налогооблагаемая прибыль уменьшается также на сумму средств, направленных на проведение собственных НИР и ОКР, а также в РФФИ и РФТР, но не более 10 % облагаемой прибыли в общей сложности. Налогооблагаемая прибыль уменьшается на сумму дивидендов, выплачиваемых предприятиями физическим лицам, в случае их инвестирования внутри предприятия на техническое перевооружение, реконструкцию и расширение производства, включая затраты на НИР и ОКР.
Распространение нововведений стимулируется также налоговыми льготами по операциям, связанным с оборотом научнотехнической продукции. В РФ от НДС освобождаются: НИР и ОКР, выполненные за свет бюджета, а также средств РФФИ, РФТР и образуемых для этих целей внебюджетных фондов; НИР и ОКР, выполняемые учреждениями образования на основе хоздоговоров; патентно-лицензионные операции, связанные с объектами промышленной собственности (кроме посреднических); ввозимые на территорию РФ оборудование и приборы, используемые для научно-исследовательских целей; товары и технологическое оборудование, ввозимые в РФ в соответствии с договорами с иностранными организациями и фирмами для проведения совместных научных работ; обороты по реализации книжной продукции, связанной с образованием, наукой и культурой, а также редакционная, издательская, полиграфическая деятельность по производству соответствующей продукции, услуги по ее транспортировке и перегрузке.
Льготы по налогу на имущество, как правило, связаны с поддержкой не собственно инноваций, а хозяйствующих субъектов, участвующих в научно – производственном цикле на той или иной стадии. В РФ не облагается налогом имущество научно-исследовательских учреждений, предприятий и организаций РАН, Российская академия сельскохозяйственных наук, Российская академия медицинских наук, Российская академия образования, составляющее их научно-исследовательскую, опытно-производственную или экспертную базу, Государственный научный центр, а также научно-исследовательских учреждений министерств и ведомств по перечню, ежегодно утверждаемому правительством. Аналогичную направленность имеют льготы по уплате земельного налога.
Доступу к передовым инновационным технологиям способствует государственная поддержка финансового лизинга. В 1994 г. принято Постановление Правительства РФ «О развитии финансового лизинга в инвестиционной деятельности», предусматривающее введение ряда льгот по лизинговой деятельности и лизинговым платежам.