Эпигенетика

Алфавитный указатель

4-Фенилбутират (РВА), 460

5-Аза-2’-дезоксицитидин, 459-460

5-Азацитидин, 459-460

Abfl, 76, 81

Absent Small или Homeiotic (ASH)

— семейство, 179, 223, 232, 235-236, 240-242

ACF, компенсация дозы и, 309

Ade2 как репортерный ген у дрожжей, 72-73

Adeb, 109-110 Air ген, 358, 360-361,363

Alcohol dehydrogenase (Adh) трансгены, 99

am гены, RIP и 120

ANT. См. Измененная Ядерная Пересадка (ANT); комплекс Аntennapedia (ANT-С)

Antennapedia (ANT-С) комплекс, 231

Arabidopsis

— Arabidopsis RNAiy, 156-157, 162-165

— веб-сайты с информацией о, 466

— как модельный организм, 35-37

— клеточная пролиферация и, 224

— компоненты эпигенетической регуляции у, 171-177

— организация генома, 54

— формирование гетерохроматина, 101-102

Argonaute белки, 121, 145, 149, 154-156, 162-164, 282, 295, 377

Argonaute-подобные белки, 121, 123, 145, 149,155-156, 163-164, 282,295

Arp. См. Белок 4, родственный актину ASH семейство. См. Absent Small или Homeotic Asm-1, 122-123,282

ATRX ген, 434 Aubergine, 100

BCR, 393, 397

Bithorax комплекс (BX-C), 231

Blimp1, 372-374, 398-400

Bmi1, 223-225

Brahma, 49, 233, 243

BRG1, 235-236

BRM. См. Brahma Brown доминантный (bwD), 98

В-клетки, 388-392, 398-401

c-Kit рецептор (CD117) 390

C. elegans

— MES-модификаторы гистонов у, 296-298

— MSUD у, 296

— PcG-гены у, 215

— PRC2 и, 214-215

— RNAi и, 164

— X -хромосомная регуляция у 292, 294-298

— анатомия, 289

— веб-сайты с информацией о, 467

— гетерохроматиновые метки на единственной Х-хромосоме, 294-295

— детерминация пола у, 287-288 з

— ародышевых клеток спецификация у, 294, 373-374

— импринтинг Х-хромосомы сперматозоида у, 298-299

— компенсации дозы комплекс у, 288, 290-293

— неклеточно-автономный сайленсинг и транзитивность, у 184

— оценка отношения Х:А у, 290-291

— половых хромосом дисбаланс у, 288

— сайленсинг у, 283

— центромеры структура и функция у, 271

CAF. См. Фактора Сборки Хроматина комплекс

CARM 1, 201

Cd79a, клетки 391

CDKN1C, Беквита-Видеманна синдром и, 428, 430-431

Cdx2, 379

CenH-район. См. CENP-A

CENP-A

— RNAi и, 157

— общий обзор, 247-248

— поддержание, 114

— сайленсинг и, 115

— центромерный хроматин, 252-253, 272-275

— цетромеры дробянковых дрожжей и, 113-116

— эволюция центромеры и, 276-277

CHD белки, 197, 239 Chfr, 454

Chp1,109-110, 112, 114, 156,158-161

Chp2, 109-110

CHRAC, 309

Chromoshadow-домены, 93, 199, 305

Cidl2, 112, 114, 159-160

cis-модификаций паттерны

— H2AZ и, 258

— MSL комплекс и, 308

— болезни и, 426, 435-437

— геномный импринтинг и, 353-355, 363-364

— посттрансляционная модификация гистонов и, 204

CKcnplot1, 360

CLF. См. Курчавый лист

Clr4

— siRNA продукция и, 113

— гетерохроматина формирование, 110-114, 156-162

— рекрутирование энзимов, модифицирующих хроматин, 161-162

CMT3, 178

CpG динуклеотиды

— CpG-островки, раковые заболевания, 448-449, 451-452, 456-457

— МеСР2 и, 342-343, 432-433

— веб-сайты с информацией о, 465

— геномный импринтинг и, 362

— гиперметилирование, 449

— метилирование ДНК и, 51, 326, 334-338, 361,425

— модификации гистонов и, 455

— раковые заболевания и, 447

— у растений, 169

CPSF-A. См. Фактор-А специфичности расщепления-полиаденилирования

CREBBP, 432

CTCF, 340-341, 362-363

Cul4, 160

D. Melanogaster, спецификация зародышевых клеток у 373-374

D1, 101

d48, клеточная линия, 141-142, 147

DDM1. См. Сниженное метилирование ДНК 1

DDP1, 101

Demeter (DME), 174, 178, 181, 188, 378

Dicer

— MSUD и, 123

— RNAi-опосредованный сайленсинг у растений и, 182-187

— scnRNA модель и, 147

— siRNAsH, 112, 158-161

— модификации гетерохроматина и, 161-162

— подавление и, 121

— сперматогенез и, 377

Dicer-подобные (DCL) белки, 182-183

DIM-2, 120-123

DIM-5, 121-122

Dlk1 кластер, 357-359

DMRs, 357-359

Dnmts. См. Метилтрансферазы ДНК (DNMTs)

Docking-домены, 258

DOT1, 198,267, 297

DPY белки 290

dRingl (dRingl/SCE) белки, 219-220

DRM. См. Метилтрансферазы с перестроенными доменами Drosha, 185

Drosophila

— kismet (kis) и, 239-240

— MSUD отсутствие у, 283

— PcG гены у, 55, 216, 218, 220

— polyhomeotic (ph) дупликация у, 220

— PRC1 «нацеливание» у, 220-222

— RNAi и, 164

— веб-сайты с информацией о, 467

— гетерохроматину, 93, 100-101, 278-279

— дисфункция половой хромосомы у, 283

— как модельный организм, 36-37

— кариотип, 303 клеточная память и, 211

— компенсация дозы у, 288, 302-311

— метилирование и, 51

— модификации гистонов, сайленсинг и, 95-96

— мозаичные фенотипы у, 88-90

— «нацеливание» формирования гетерохроматина, 97-100

— неоцентромеры у, 272

— организация генома, 55

— процесс сегрегации у, 279

— сайленсинг и, 95-96, 101-102

— утрата отцовской хромосомы у, 281

— фактор нарушения сегрегации, 280-281

— хромосомные белки и модификаторы у, 90-93, 96-97, 268

— центромерный хроматин и, 274

dsRNA. См. Двухнитевая РНК

dsx гены, 306-307 DTip60, 259

E(var) (Enhancer of variegation), 90-92

E(Z) семейство. См. Энхансера zeste (E(Z)) семейство

E(Z)-ESC комплекс, 296-297. См. также PRC2

Е2А, 391-392

ЕЗ убиквитинлигаза, 429, 454

EBF1, 390-392

EMF. См. Эмбриональный Цветок (EMF)

ENCODE, 465

Enx1, 223, 325

ERC, 84

ESC. См. Сверхчисленные половые гребешки (ESC)

Eversporting displacements (Хромосомные перестройки, обусловливающие мозаичное проявление признака), 14, 27. См. также Мозаицизм, обусловленный эффектом положения

EZH2, 200, 224, 325, 388, 394

Ezh2/Enxl. 325

FACT. См. Облегчение транскрипции хроматина

Female-sterile homeotic (fsh) ген, 232

Flamenco, 164

Flt3, 390

FMRP белок, 436-437

FOX-1, 290

FR901, 228 460

Fragilis, 373

FWA., 164

G9a, 400

GAGA фактор, 243

GASC1. См. jumonji-деметилаза гистонов (JHDM1)

Gnas семейство, 357-359, 428, 431

GNAT семейство, 194

Groucho семейство, 399-400

Gtl2,360

HI, 260, 472

H19 ген, 352-353, 360, 362-363, 428, 430-431

H2A

— дефектный по тельцу Бара (H2ABbd), 248, 259

— определение, 248

— откладка и замещение, 258-259

Н2АХ, 255-257, 267, 472

H2AZ 248, 257-259

— локализация, 250

— макро, 259, 323

— формирование вариантов, 248

Н2В 258-259, 469

H3, 196, 247-248, 251-254, 273-275, 469-471

H3.3, 248, 254-255, 275

H3.Зрепрограммирование сперматозоидов, 378

H3K27, метилирование

— MES белки и, 296-298

— PRC «нацеливание» и, 221

— V(D)J рекомбинация и, 394

— Х-инактивация и, 325-327

— гетерохроматиновый сайленсинг и, 95-96

— общий обзор, 200

— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 375

H3K36, 197-198, 297

H3K4, 196-197, 325-326

H3K79, 198, 267

H3K9

siRNAs и, 154 su(var) и, 95-96

— в единственных Х-хромосомах самцов C. elegans, 294-295

— метилирование ДНК и, 339-340

— «нацеливание» на гетерохроматин и, 87

— общий обзор, 198-200

— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 375

— распределение репрессированной ДНК, 138

— сайленсинг и, 95-96. 101-102, 109-111, 145-146

— сперматогенез и, 376

— у растений, 179

— центромерный хроматин и, 274

Н4

— KYP/SUVH4, 180

— MSL комплекс и, 304

— SIR комплексы и, 79-80

— общий обзор, 200

— таблица, включая ссылки, 471

— формирование вариантов и, 248

Нах гены развитие примордиальных зародышевых клеток и, 373

HBRM, 237

HDAC. См. Деацетилазы гистонов (HDACs)

HDOT1L, 198

her-1 ген, 291-293

HIC-1, 455

HIRA. См.Регулятор гистонов А

HKMTs. См. Метилтрансферазы лизинов гистонов (HKMTs)

HML, 74-75

HMR, 74-75

НО эндонуклеаза, 74-77

НОАР (HP1/ORC ассоциированный белок). 269

Homeless, 99-100 HOTHEAD ген, 21

Нох гены

— PcG белки и 212-213

— PcG сайленсинг и 219

— PREs и 220

— Sex combs reduced (Scr) и 234

— клеточная память и 211, 231

— регуляция у Drosophila 231-233

НР1. См. Белок гетерохроматина 1

HpaII крошечные фрагменты, 336-337, 340

НРone, 121

Hrr1, 112, 114, 159-160

hSET, 241

HU белки, 248

IAP ретротранспозон, 375, 377

ICE, 358-359, 361-363

ICF синдром. См. Иммунодефицитная Центромерная Нестабильность

IFNB1, 399

IGF2

— Беквита-Видеманна синдром и, 428, 430-431

— геномный импринтинг и, 352-353, 357-359, 362-363

— рак толстой кишки и, 453

IgH, 393

Ikaros-ассоциация, 398

IL-7, рецептор 390

In(l)wm4, 91. См. также white ген

INI1, раковые заболевания и, 235

INO80-C, 259

ISWI комплексы, 239, 309-310, 415. См. также Brahma семейство; SNF2H семейство

JIL1 киназа, 97-98, 102, 305

Jumonji-деметилаза гистонов (JHDM1), 47, 200

К79 метилирование, общий обзор, 198

KCNQ, 357-359, 430

killer штаммы, 133

Kismet (kis), 234-235, 239-240

KTO белок, 242

KYP/SUVH4, 180

Light, 98

Like heterochromatin protein (LHP1), 182

Linaria vulgaris, 170

LSD1 аминоксидаза, 97

LSD1. См. Лизин-специфичная деметилаза

LSH2, 340

mb-1 ген, 392

MBD белки. См. Метил-CpG-связывающиеся белки

МеСР2, 342-343, 432-434

Medea (МЕА), 178, 180-181, 215, 217, 223-224

Medea/Fertilization independent seed formation (MEA/FIS1), 180

MEIDOS, 216

Meisetz, 376

MES белки, 215, 296-298

MIP. См. miRNAs, премейотически индуцированные метилированием

Miwi-подобные белки, 377

MIX-1 белки, 290

MLE, 304-306, 308

MLH1 ген, 437, 450, 453-454

MLL, 233, 235, 241

MNa3a. См. Микрококковая нуклеаза MOF, 304-306, 308

Morpheus-молекула (MOM), 181, 187

MS-275, 460

MSCI, 318

MSP, 459

MSUD. См. Мейотический сайленсинг неспаренной ДНК

mtF гены, 143-144

MYST семейство, 194

n-1 правило, 316, 319-320

Nanog, 375, 379-380

Nasonia vitripennis, 281

ncRNA-опосредованного сайленсинга модель, 362-364

Ndj1, 269

Necdin, 429

NESP55, 431

Neurospora crassa

— MSUD y, 117, 122-124, 282-283

— RIP и, 119 120, 123-124

— жизненный цикл, 116-117

— изображения, 118, 124

— как инструмент, 107

— как модельный организм, 36-37

— метилирование у, 117-119

— общий обзор, 116-117

— подавление у, 121-122

— сайленсинг у, 282-283

NONCODE веб-сайт, 360, 466

NotchL 391

Nowal, 146 NT-ES, 418-421

NuA4/Tip60, 259

NuRD, 343

NURF, 309, 429

NVP-LAQ824, 460

Oct4, 379-380, 416

Oenothera blandina, 101

OSA, 239

P53BP1, 198

p55, 214

PADI4, 202, 378

PAF комплекс, 198

PAI2, 162

Paramecia, 36, 130-132. См. также Инфузории

Parp, 380

Pasha, 185

Pax5, 390-392, 396, 400-401

PcG белки. См. Polycomb белки

PGC-клетки, развитие примордиальных зародышевых клеток и, 372-375

Ph 1 локус, 280

PHERES 1, 216

Pickle (PKL), 181

Piwi, 100, 154-156, 160, 164

PML-лейкемия, 56

Pol IV. См. РНК-полимераза IV

Polar granule component (pgc) ген, 374

Polycomb (PcG) белки

— CpG метилирования и, 339-340

— HP1 и, 98

— Х-инактивация и 58, 325-326

— генетическая идентификация, 212-214

— геномный импринтинг и, 362

— клеточная память и, 56, 212, 230

— метилтрансферазы гистонов растений и, 180

— метки сайленсинга хроматина и, 214-219

— модификация хроматина у животных и, 164-165

— общий обзор, 54, 219

— поддержание транскрипционного сайленсинга и, 219-223

— развитие млекопитающих и, 223-226

— функция, 55-57 хроматин растений и, 180-181

— эпигенетическая регуляция у Arabidopsis и, 176

Polycomb репрессивные комплексы (PRCs)

— H3K27 метилирование и, 200

— Х-инактивация и, 57, 223

— клеточная память и, 211

— компоненты, 219-220

— компоненты и эволюционный консерватизм, 214-216

— модификация хроматина, 218

— «нацеливание» на сайленсированные гены, 220-222

— предотвращение наследуемой репрессии, 222-223

— репрессивные функции и, 222

— транскрипционная репрессия и, 231

— у растений, 180

— функция в развитии, 218-219

Polycomb элементы ответа

— GAGA фактор и, 243

— H3K27 метилирование и, 200

— антисайленсинг и, 223

— клеточная память и, 211

Polycomb-подобный (PCL) белок 215

— PRC1 «нацеливание» и, 220-222

— транскрипционная репрессия и, 232

PRC2. См. Пререпликационный комплекс 2

Prdm1, 398-399

Priming, линия, 391

PRMTs. См. Метилтрансферазы аргининов белков

PSR хромосома, 281-282

PTGS. См. Посттранскрипционный сайленсинг генов

Pws кластер, 357-359 RAG, 393, 420-421

RanGAP ген, 281

Rapl. См. Репрессор-активаторный белок I (Rapl)

RC гистоны, 250-251

RdDM. См. РНК-направляемое метилирование ДНК

rDNA, 84, 266, 278-279

rDNA кольца, 84

RDRP. См. РНК-зависимая РНК-полимераза

Replication processivity clamp (PCNA), 250

Rid ген, 120

Rikl, 160

Ring-белки, 213. 219-220, 242. 325

RIR См. Индуцируемая повторами точечная мутация

RISC. См. РНК-индуцируемый сайленсирующий комплекс

RITS. См. РНК-индуцируемый эффектор транскрипционного сайленсинга

RITS и сборка гетерохроматина и, 158-160

— сайленсинг и, 46

— сайленсинг у S. pombe и, 112, 115-116

— сайленсинг у инфузорий и, 139, 147

— сайленсинг у растений и, 182-187

— сборка «молчащего» хроматина и, 112

— сперматогенез и, 376

RNAi, 269. См. также Меиотический сайленсинг неспаренной ДНК (MSUD); Посттранскрипционный сайленсинг генов; Подавление

— Arabidopsis и, 162-164

— Chpl и, 109

— Drosophila и, 99

— dsRNA и siRNA и, 158-161

— НР1 локализация и, 121

— N. crassa и S. pombe и, 107

— ncRNAs и, 358-359

— PTGS у растений vs., 177

— геномные перестройки и, 139

— доказательства роли в сайленсинге, 156

— ломкой Х-хромосомы синдром и, 437

— метилирование ДНК млекопитающих и, 339-340

— модели распознавания и, 160-161

— модификация хроматина и, 113, 162-164

— общий обзор, 52-53, 153-154

— развитие многоклеточных и, 36

— рекрутирование хроматин-модифицирующих энзимов, 161-162

— сборка гетерохроматина и, 87-88, 102, 153-165

— структура хроматина и, 156-158

— у инфузорий, 130, 139, 147

Rolled, 93

roXRNAs, 48-49

Rsp, 281

RTT. См. Ретта синдрома

R-делеционные элементы, 143-144

Saccharomyces cerevisiae

— trans-взаимодействие у, 81-82

— trxG белки и, 236

— ацетилирование гистонов и, 80

— веб-сайты с информацией о, 466

— выпетливание теломер и, 80-81

— генетические инструменты, 72-73

— гетерохроматин, 74-78

— деацетилирование гистонов и, 78-79

— жизненный цикл, 73-74

— идентичность центромеры и, 275

— как модельный организм, 36-37

— наследование эпигенетических состояний у, 82-83

— нестабильность рДНК-повторов у, 84

— общий обзор, 71-72

— описание, 72-73

— организация генома, 54

— репрессия и, 79-80

— сайленсинг у vs. у S. pombe, 107-108

— структура и функция центромеры у, 270-271

— тайминг репликации. 266

Sad-1 (Супрессор доминирования аска) ген, 123-124, 282

SAGA, 49, 257

Sallimus (sis) ген, 242 Sas2, 80, 303-304 Sccl, 83

Schizosaccharomyces pombe

— RNAi y, 112-114

— Sir2 белок и, 75

— веб-сайты с информацией о, 466

— гетерохроматин и RNAi и, 156-158

— гетерохроматиновая организация хромосому, 156-158

— идентичность центромер и, 271

— как модельный организм, 36-37

— кинетохоры и, 271

— общий обзор, 107-108

— организация генома, 54

— сайленсинг генов и, 52

— сайленсинг хроматина у, 108

— сборка «молчащего» хроматина и, 111-113

— состав центромер, 113-115

— супрессия эпигенетического мозаицизма, 62

— транскрипция центромерных повторов у, 113

— эпигенетическая наследственность центромерного состояния у, 114-115

SCID-мыши, 420

Scmx ген, 328

scnRNA модель, 52, 147

SCNT. См. Терапевтическое клонирование

SDC белки, 288, 290

sea-1, 290

SEP-домены. См. S-аденозил-метионин (SAM)

SET-домены

— trxG белки и, 236

— модификации гистонов и, 179-180, 196,241

— развитие зародышевых клеток и, 376

— ремолелинг хроматина и, 216

— формирование плазматических клеток и, 400

Sex combs reduced (Scr), 232, 234

SEX-1,290

SFRPs, 455

SIR белки. См. Белки-регуляторы «молчащей» информации siRNAs

— dicer-подобные (DCL) белки и, 184

— RITS и, 158-160 scnRNAsvs, 145

— генерация, 158-159, 161-162

— подавление и, 121

— сборка гетерохроматина и, 159

SKD белок, 242

SLC22A1L, 430

SMARCAL1, 435

SMYD3, 197

SNF2, 49, 204, 340

snoRNAs, 360, 428-429

SNURF-SNRPN, 429

Sonic hedgehog (Shh), 225

Sox2, 379-380

Splayed (SPD), 181

SPM-домены, 14. См. также S-аденозил-метионин (SAM)

SRY ген. 315

Stella, 99, 372-375

Su(var) гены

— Drosophila и, 90-93

— H3K9 метилирование и, 95-96

— компенсация дозы и, 309

— метки сайленсинга хроматина и, 214

— репрограммирование сперматозоидов и, 378

— сперматогенез и, 376

— эффект положения мозаичного типа, 37

SubTOBv, 260

SUPERMAN, 36, 162, 186

SUVH белки, 101, 180, 199-200

SWI/ISWI энзимы. См. Brahma-семейство

SWI2/SNF2, репрессия хроматина и, 235-236, 239

Swi6, 110-112, 114, 156-161

Switch2/Sucrose Non-Fermentable2 (SWI2/SNF2)

— H2AZ и, 257, 260 МеСР2 и, 433

— метилирование ДНК и, 340

— метилирование и, 49

— модификации гетерохроматина и, 163

— ремоделинг хроматина и, 181

— структура нуклеосом и, 204

SWR1-C, 259 SXL, 306-307

S-аденозил-метионин (SAM), 179, 215, 220, 445, 448

S-фаза митоза, 83, 266-267

Т. themiophila, веб-сайты с информацией о, 466

“ТА” внутренние элиминируемые сегменты (IES), 137

ta-siPHK, 185 TCRp, 393

Tetrahymena, 36, 52, 131-132. См. также Инфузории

TGS. См. Транскрипционный сайленсинг генов (TGS)

Tip60, 259, 305

Toll-подобные рецепторы, 51

Tonalli (Тпа) ген, 2452

tra гены, 306-307

Trans-sensing, 282

trans-эффекты, 41, 191-192, 258, 426, 431-435

Trithorax (trxG) белки

— PcG белка рекрутирование и, 220

— SET-домены в, 236

— идентификация, 232-235

— как активаторы или антирепрессоры, 243

— клеточная память и, 54, 56, 211-212, 231

— метилтрансферазы гистонов и, 179

— модификации гистонов и, 242

— общий обзор, 55-57,231-236,242-244

— транскрипция и, 235-236, 243

— функциональные взаимодействия между, 242

— хроматин и, 236-242

Tsix ген, 317, 319, 321-322

Twi1 ген, 145-146, 156

U7 малый ядерный рибосомный комплекс, 250

Ube3aas, 360

Ura3, 72-73

V(D)J рекомбинация, 390, 393-394

Variable Surface antigen Genes (VSG). 16

VRN-комплекс, 180, 214-219

white ген, 71, 88-89, 98-99

Winged helix домены, 000

wm4, См. white ген

Wnt путь, 455

Х-инактивации центр (XIC), 57, 317, 325, 327

Х-инактивация, 57, 223, 314, 317-322

— H2A варианты и, 259-260

— PcG репрессия и, 224

— болезни и, 434

— воспроизведение и поддержание у млекопитающих, 317-322

— идентификация у млекопитающих, 316

— импринтированная, 317-319, 321-322

— инициация у млекопитающих. 317-322

— исторические симпозиумы и, 16

— клонирование и, 417

— общий обзор, 28, 57-58, 314, 317

— определение, 287-288

— переключаемые режимы у млекопитающих, 322

— поддержание, 371

— реактивация и репрограммирование и, 328-330, 337, 375, 380

— регуляция у млекопитающих, 318-322

— случайная vs. импринтированная, 317-322

— у C. elegans, 294-299

— факультативный гетерохроматин и 57-58

Х:А отношение 290-291, 306-307

Х-реактивация, 328-330

Х-сигнальные элементы (XSEs), 290-291, 299

Х-элементы. 81 ХВР1, 399

Хее, 321

Xenopus, веб-сайты с информацией о, 478. См. также Амфибии

Xist ген

— геномный импринтинг и, 364

— исторические симпозиумы и, 16

— плюрипотентные эмбриональные стволовые клетки и, 380

— регуляция у млекопитающих, 322-323

— эмбриональные стволовые клетки и, 319

ХО эмбрионы, 320

XOL-1, 288, 290-291

Хр импринты, 298-299, 316

Yellow ген. 91 YKu, 76, 78, 80

Y-хромосомы, 90, 315

Y’-элементы, 81

—-— район, 119

Автогамия, 131-133, 141-143

Автономно Реплицирующиеся Последовательности (ARS), 266

Автономный путь, 216

Адаптивная эволюция, 253

Адренолейкодистрофия, сцепленная с Х-хромосомой, 425

Активный хроматин, 46, 135-136, 254-255

Аллельное исключение, 396-398

Альтернативные перестройки, 141

Амфибии, 406, 409-410, 414-416

Ангельмана синдром, 427-430

Ангиогенез, 446

Анеуплоидия, определение, 264

Аномалии, клонирование животных и, 410-411

Аномальная хромосома 10 (Ab10), 282

Антигенная специфичность, 387

Антирепрессоры, 243

Антисайленсинг, 222-223

Антисмысловая транскрипция, 340, 395

Антител разнообразие

— гены рецепторов антигенов, 389-390

— метилирование и, 51

— развитие лимфоцитов и, 392-398

— рекомбинация и, 389-390, 392-395

— соматические клетки и, 28

— эпигенетика и, 30

Апоптоз, 267, 446

Аскоспоры, 116

АТФ-hook белок D1, 101

АТФ-зависимые комплексы ремоделинга, 42, 49, 233, 237-240, 309

Аутизм, 432

Аутосомные гены, 290-293, 306-307

Аутосомные сигнальные элементы (ASEs), оценка отношения Х:А и, 290-293

Ахиазматическая сегрегация, 278-279

Ацетилирование PRC2 и, 218

— trxG белки и, 240-241

— V(D)J рекомбинация, 394

— активный хроматин и, 46

— варианты гистонов и, 135-136

— гистоны и, 28, 40

— ломкой Х-хромосомы синдром и, 436-437

— распространение комплекса SIR и, 80

— регулирование транскрипции [этой модификацией], 192-193

— репарация ДНК и, 267

— репрограммирование сперматозоидов и, 378

— транскрипциям 193-195

Ацетилтрансферазы гистонов (HATs)

— компенсация дозы и, 304

— модификации гистонов и, 46

— очистка, 36

— Рубинштейна-Тайби синдром и, 432

— у инфузорий, 135-136

— экспрессия генов и, 28-29, 80, 194

База данных по хроматину растений, 172-175

Барра тельца

— Н2А и, 248,259

— Х-инактивация и, 57, 314, 316

Беквита-Видеманна синдром, 440-442

Белки Группы Высокой Подвижности (HMG), 259

Белок 1 гетерохроматина (НР1)

— H2AZ и, 258

— H3K9 метилирование и, 198-200 PcG и, 55 RNAi и, 121

— su(var) и, 37, 91-93, 101, 199, 309, 378

— сайленсинг и, 181-182, 222

— функция, 96

Белок 4,

— родственный актину (Агр4), 259

Бидл и Тэйтум (Beadle, Tatum), 116

Бисульфитная модификация, 338

Бластоцисты, ES- и TC-cells, 380

Близнецы, изменчивость у, 35

Блокирующего фактора модель, Х-инактивация и, 320

Болезни. См. также конкретные болезни

— внешняя среда и, 438-439

— геномный импринтинг и, 357, 427-439

— исследования болезней человека, 426-427

— клонирование и, 410-411

— метилирование и, 51, 344

— общий обзор роли эпигенетики в, 426-427

— структура хроматина в cis-конфигурации и, 435-437

— структура хроматина в trans-конфигурации и, 431-435

Большая бороздка, 340

Бромодомены, 42, 195, 239

Важное значение эпигенетики, 34

Важный (I) сайленсер, 77-78

Вальпроевая кислота, 459

Варианты гистонов. См. также конкретные варианты

— CENP-Аи, 275

Х-инактивация и, 317, 323-325

— геномный импринтинг и, 354

— общий обзор, 49-50, 247-248

— определение, 34

— репрограммирование сперматозоидов и, 377-378

— роли для, 135

— транскрипционные состояния, 204

— центромеры и, 252-254

— энзимы для, 18, 21, 48, 158

Веб-сайты, 358, 360, 465-467

Видаза [ингибитор метилирования ДНК], 459

Видообразование, MSUDh, 122-123

Вилки, репликация ДНК и, 266

Вироиды, 186

Внутренние элиминируемые сегменты segments siRNAsH, 145

— ингибирование элиминации, 143-144

— материнская наследственность и, 143

— перестройки у инфузорий, 136

— распределение гетерохроматина и, 136-137

— транскрипция и, 52

— элиминация чужеродных последовательностей, 142-143

Внутренняя клеточная масса (ICM), 318, 371-372, 379-380

Выбор, случайная Х-инактивация и, 319-321

Выпетливание, теломера, 80-81

Гаметические импринты, 353, 357-359

Гаметогенез, 376-377, 416

Геликазы, 100, 112, 121, 159, 164, 237, 304-305, 308

Гематопоэтическая система. См. Лимфоциты

Гематопоэтические стволовые клетки (HSC), 225

Гемиметилированная ДНК, 51

Ген А, 140-141,437

Генетика, эпигенетика vs., 27, 34-35

Геномный импринтинг

— ncRNAs и, 359-360

— PRC2 и, 223

— Х-хромосомы сперматозоида у С elegans, 298-299

— Ангельмана синдром и, 427-430

— Беквита-Видеманна синдром и, 428,430-431

— болезни и, 426

— веб-сайты с информацией о, 465

— исторические симпозиумы и, 18

— исторический обзор 16, 350-353

— как cis-действующая регуляторная система, 353-355, 363

— как модель эпигенетической регуляции у млекопитающих, 364-365

— как моноаллельный сайленсинг, 58

— компоненты у растений, 181

— метилирование ДНК и, 354, 360-362

— определение, 349, 369

— Прадера-Вилли синдром и, 427-430

— псевдогипопаратиреоидизм и, 428, 431

— Сильвера-Рассела синдром и, 428, 431

— утрата, 60-61, 452

— функция гена и, 356

— функция у млекопитающих, 355-357

— элементы контроля импринтов и, 357-359

— эмбрионального и неонатального роста контроль, 355

Гены рецепторов антигенов, 389-390, 392-395

Гены-супрессоры опухоли, 446-447

Гептобластома, 430

Гермафродиты, 131, 213, 287-299

Гетерогаметный пол, определение, 315

Гетерозиготность, утрата, 452

Гетерокариотическая фаза, 116, 122

Гетероталличные штаммы дрожжей, 74

Гетерохроматин. См. также «Молчащий» хроматин

— H2AZ и, 257-258

— H3K9 метилирование и, 87

— RITS и RNAi и, 158-160

— RNAi и, 52-53, 153-165

— Х-инактивация и, 319, 322-325

— белки, ассоциированные с, 93-94

— в неоцентромерах человека, 252

— изменчивость у, 100-101

— исторические симпозиумы и, 17

— конститутивный, 40. 44. 57-58, 323-325

— мейотический дрейф и, 280-282

— метилирование и, 51

— «нацеливание», 99-100

— определение, 34, 40, 71

— перестройки генома и, 139-140

— перинуклеарное прикрепление, 81-82

— репрессия активности генов и, 75-77

— сборка, 77-78

— сегрегация хромосом и, 113

— спаривание и, 277-280

— типы спаривания дрожжей и, 75-77

— упаковка, 88-89

— факультативный, 40, 57-58, 323-325, 327

— центромеры дрожжей и, 109-111

— эухроматин vs., 44-46, 97, 100, 177

Гиббереллины, 216

Гипергомоцистеинемия, 435, 438

Гиперметилирование, 61, 254, 449-452

Гипермутация, 51

Гипометилирование, 60, 435, 449

Гипопаратиреоидизм, 431

Гипотеза гистонового кода

— trxG белки и, 242

— ассоциированные с гетерохроматином белки и, 254

— вариации в, 101-102

— общий обзор, 19-20, 46-47, 205, 425

разнообразие рецепторов антигенов и, 394

Гистоны

— CENP-A и, 272-274

— RAG2 и, 392, 395

— ацетилирование и, 28

— варианты у инфузории, 135

— веб-сайты с информацией о, 465

— исторические симпозиумы и, 17

— линкер, 260, 376 метилирование, 19-20

— обзор модификаций, 46-48

— общий обзор, 191-192

— поддерживающее метилирование и, 120-121

— разнообразие у, 247-248 структура, 49-50

— функция, 248

— хромосомная организация и, 34

— эволюция, 259-260

Гликозилазы, 178-179, 181, 188, 341, 343, 378

Голокинетические хромосомы, 252

Голоцентрические хромосомы,265, 277

Гомеологичное спаривание, 280

Гомеотические гены, 233. См. также Trithorax (trxG) белки

Гомеотические трансформации, 212-213

Гомогаметичный пол, определение, 315

Гомологичная рекомбинация, 72, 355

Гомология, 139-141, 143-144

Гомоталлические штаммы дрожжей, 74

Граничные элементы, 17, 19. 80-81

Дарвиновская теория эволюции, 25

Двухнитевая РНК (dsRNA). См. также RNAi

RNAi-опосредованный сайленсинг у растений и, 182-187

— геномный импринтинг и, 363

— образование разрывов. 267

— сайленсинг у инфузорий, 139

— синтез, 159-160

Деацетилазы гистонов (HDACs)

— МеСР2 и, 432-433

— NuRD и, 343 PRC2 и, 215

— Sir2 семейство, 75-76, 79-80

— ингибиторы, 459-460

— исторические симпозиумы и, 19

— лейкемии и, 447

— модификации гистонов и, 46

— раковые заболевания и, 61, 345, 456-458

Дупликация, 120, 123-124, 220. См. также Точечная мутация, индуцированная повторами

Зависимый от гомологии сайленсинг 139

Задних Половых Гребешков (PSC) белки, 215, 219-220

Запрограммированная элиминация ДНК, 36

Зародышевые клетки. См. также Примордиальные зародышевые клетки

— Х-реактивация у, 329

— механизмы, регулирующие спецификацию, 372-377

— наследование перестроек ресничек и, 140-144

— плюрипотентность и, 379-381

— развитие, 369-374

— тотипотентность и, 54

Защитные механизмы, 50, 146-148

Зебуларин, 459-460

Зигзаг-модели организации хроматина, 43

Зиготы, 370

Избыточность, элементы сайленсера и, 78

Измененная Ядерная Пересадка (ANT), 421

Имагинальные диски, 212

Иммуноглобулины, 388, 395-398

Иммунодефицитная Центромерная Нестабильность (ICF), 336, 432, 434-435

Иммуноотторжение, 420

Иммунопреципитация, 22, 79-80. 95, 138,145, 193

Импринтинг. См. Геномный импринтинг Импринтинг хромосомный. См.

Импринтинг геномный Импринтированная Х-инактивация, 317-319, 321-322

Инвазивные элементы, 53

Ингибиторы, 60-61, 459-461

Индуцированная повторами точечная мутация (RIP)

— MSUD и, 122-123 RNAi и, 156

— исторические симпозиумы и, 16

— как модель, 36

— метилирование и, 50

— у Neurospora crassa, 117, 119-120, 123-124

Индуцированный антигеном рецептора сигналинг, 398

Индуцированный вирусом сайленсинг генов (VIGS), 177, 183

Индуцированный повторами сайленсинг генов (RIGS), 101

Индуцируемая активацией дезаминаза (AID), 51, 388, 398

Инсулятора модель, 362-363

Инфузории

— RNAi у. 145, 147

— активный vs. «молчащий» хроматин у, 135-136

— жизненный цикл, 132

— зависимый от гомологии сайленсинг у, 139

— как модельный организм, 27, 36

— коньюгация и, 131-132

— общий обзор, 130

— патгернинг кортикальный у 133-134

— перестройки у, 138-139

— поддержание двух геномов, 131

— системы защиты генома у, 146-148

— цитоплазматическая наследственность у, 27, 132-133, 142-143

История эпигенетических исследований

— генетика и развитие и, 27

— геномный импринтинг и, 350-353

— гиперметилирование и, 449-450

— ДНК соматических клеток и, 28

— Колд Спринг Харбор и, 14-19

— метилирование и, 28, 448-450

— механистическая

— взаимосвязанность и, 30-31

— общий обзор, 26

— трансплантация ядер и, 406

— хроматин и, 28-30

Канцерогены, метилирование цитозина и, 449

Кариогамия, 107, 116-118, 120, 131-132

Кариотип Drosophila, 303

Киназы

— JIL1 киназа, 97-98, 102, 305

— модификации гистонов, 47

— фосфоинозитол 3-киназа-подобных киназ семейство, 255

Кинетохоры

— CenH3 и, 252-253

— CENP-Аи, 273-275

— идентичность центромер и, 275

— сайленсинг и, 108-111, 113-114

— формирование и функция, 271-272

— функция, 269

— хромосомная наследственность и, 264

— центромеры дробянковых дрожжей и, 108-109

Клетки крови, PcG-репрессия и, 223

Клеточная память

— Нох-гены и, 211, 231

— PcG и trxG и, 55-57

— метилирование ДНК и, 334-335, 343

— общий обзор, 211-212, 230-232

— повторяющиеся элементы и, 54

— трансплантация ядер и, 417-418

Клеточные судьбы. См. Соматическое репрограммирование

Клеточный цикл, 49, 82, 221, 412

Клонирование. См. Трансплантация ядер; Репродуктивное клонирование

Клоны, 35, 409, 414 417

Кнудсона (Knudson) двухударная теория, 60

Ковалентная модификация. 34, 241-242, 244

Когезины, 83, 114-115, 165, 256-257

Коллохоры, 278-279

Кольца повторов экстрахромосомной рДНК (ERC), 84

Коммитирование линий, 390-392

Компактизация, эволюция гистонов и, 259-260

Компартментализация у инфузорий. 130

Компенсация, 419. См. также

Компенсация дозы

Компенсация дозы

— клонирование и, 417

— механизмы 58

— определение 287

— у C. elegans 288, 290-293

— у Drosophila 302-311

— у млекопитающих 288, 313-330

Комплекс компенсации дозы (DCC), 288, 290-293

Конденсация, 33, 76-77, 294, 298-300

Конденсины, их сходство с DCC, 288, 290

Конститутивный гетерохроматин, 40, 44, 57-58, 323-325

Контролирующие элементы, 14

Контрольная Точка Сборки Веретена (SAC), 269

Коньюгация, 131-132

Координация, ремоделин хроматина и, 49

Корепрессоры, 342

Короткие интерферирующие РНК (siRNA), 52, 112-114, 139

Кортикальный паттернинг, 133-134

Косупрессия, 121, 177. Си. также Посттранскриппионный сайленсинг генов

Кошки, клонирование, 35

Крючки аскогенных гиф,

Кукуруза, 280, 282

Курчавый лист (CLF), 180, 213, 215-216

Кэпирование, 80

Лейкемия, 56, 235, 413, 447-448, 459

Лизин-специфичная деметилаза (LSD1), 47, 180, 200

Лизины. См. также Метилтрансферазы лизинов гистонов (HKMTs)

— ацетилирование, 194

— деметилирование, 200

— метилирование, 47, 180, 200

Лимфомагенез, 223

Лимфоциты

— ICF синдром и, 434

— В-клеток дифференцировка и, 398-401

— клонирование мышей из, 412-413

— коммитирование линий в, 390-392

— плюрипотентность и, 390

— разнообразие рецепторов антигенов и, 392-398

Линкерные гистоны, 251, 260, 376

Локализация, экспрессия генов и, 20

Ломкой Х-хромосомы синдром, 426, 436-437

МакКлинток (McClintock), Барбара, 268

МакроН2А, 259, 323, 472

Макронуклеусы

— активный vs. «молчащий» хроматин и, 135-135

— деление у инфузорий, 140-144

— индукция специфических делеций у инфузорий, 140-141

— определение, 130

— перестройки у инфузорий и, 131

— «спасение» наследуемых делеций в, 142-143

— фрагментация хромосом и, 138

М-делеционные элементы, 143-144

Медицина, трансплантация ядер и, 413-414

Межгенные повторы. См. Неточные делеции

Мейоз

— гетерохроматин и, 280-282

— зародышевых клеток эпигенетические механизмы и, 376

— процесс, 264-265, 288, 290

— хромосомная наследственность и, 264-265

Мейотический дрейф, 277-278, 280-282

Мейотический сайленсинг неспаренной ДНК (MSUD)

— RNAi и, 156

— у C. elegans, 296

— у Drosophila, 283

у Neurospora crassa, 117, 122-124, 282-283

— у мышей, 283

Меллер (Muller, H.J.), 303

Менделевская наследственность, 34-35, 133, 187

Метил-CpG-связывающиеся белки

— 5-метилцитозин, 448-449

— метилирование и, 51, 178-179, 341 -342

— репарация ДНК и, 343

— репликация ДНК и, 341-342

— Ретта синдром и, 342-343, 432-434

— сводка функций, 342

— транскрипционный контроль и, 343

— функция, 334

Метилентетрагидрофолат редуктазы недостаточность, 435

Метилирование. См. также

Метилирование ДНК

— — В-клеток развитие и, 392-395

— MSUD и, 122-123

— PRC2 и, 218

— RIP и, 119-120

— trxG белки и, 242

— Х-инактивация и, 318, 325

— аномальное у клонированных эмбрионов, 416

— аргининов, 47, 201-202

— болезни и, 435

— в трофоэктодермальных клетках, 380

— гетерохроматиновый сайленсинг у Drosophila и, 95-96

— гипотеза гистонового кода и, 19

— исторические симпозиумы, 15-17

— история эпигенетики и, 28

— кластеры импринтированных генов и, 359-360

— контроль у Neurospora, 120-121

— модификации гетерохроматина, 163

— модификации гистонов и, 40, 47, 135

— «молчащий» хроматин и, 254

— наследуемость, 334

— неопластическая трансформация и, 60-61

— общий обзор, 50-51, 196-202

— определение, 34

— отсутствие у S. pombe и, 108

— поддержание, 118, 120, 178, 335, 361

— распределение репрессированной ДНК и, 138

— регуляторы у растений, 53, 177-178

— репарация ДНК и, 267

— репликация ДНК и, 30

— сайленсинг растений и, 53

— сайты в гистоновых «хвостах», 41

— транскрипционный контроль и, 236

— у Neurospora crassa, 117-119

— функция, 34

— эпигенетическая регуляция у Arabidopsis к, 174

Метилирование denovo, 177-178, 186-187, 335-337

Метилирование ДНК

— CpG-островки и, 455-456

— N. crassa и, 107

— siRNAs и, 154

— Х-инактивация и, 325

— аллельное исключение, 396-398

— болезни и, 424-426, 430-431

— в ICM клетках, 379

— в эмбриональных стволовых клетках, 380

— веб-сайты с информацией о, 465

— внешняя среда и, 345, 438-439

— геномный импринтинг и, 354, 360-362

— ингибиторы, 459-460

— картирование, 338

— клеточная память и, 334-335

— мутации и, 343-344

— происхождение паттернов, 335-340

— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 375

— раковые заболевания и, 446, 448-449, 452, 459

— регуляция экспрессии генов, 340-343

— репрограммирование и, 378-379

— у млекопитающих, 334

— у растений, 170

— хромосомная стабильность и, 344

Метилирование, индуцированное премейотически (MIP) 120, 156

Метилтрансфераз (МЕТ1) семейство. 178

Метилтрансферазы. См. также ДНК-метилтрансферазы (DNMTs);

Метилтрансферазы лизинов гистонов (HKMTs)

— de novo, 335-336

— Х-инактивация, 325

— болезни и, 435

— метилирование аргининов и, 47, 201-202

— модификации гетерохроматина и, 162-164

— модификации гистонов и, 121-122, 235, 388

— поддержание у млекопитающих, 335

— РНК и, 51-53, 177-178, 186-187

— у растений, 177-179

Метилтрансферазы аргининов белков (PRMTs) 47, 61, 201-202

Метилтрансферазы ДНК (DNMTs)

— H3K9 метилирование и, 198-200

— ICF синдром и, 434

— RIP и, 119-120

— геномный импринтинг и, 361, 377

— гомология у 118

— защита CpG-островков и, 339

— ингибирование, 459

— исключение из ядра, 378-379

— метилирование и, 50

— млекопитающих, 335

— подавленней, 121-122

— полуметилированная ДНК и, 335

— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 375

— раковые заболевания и, 61, 449, 459

— у Drosophila, 97

Метилтрансферазы лизинов гистонов (HKMTs)

— В-клетки и, 398-399

— CpG метилирование и, 339

— Drosophila и, 37 Ezh2 и, 200, 224, 325, 388, 394

— MLL как, 233, 235

— SET домены и, 236

— SUVH белки и, 101

— trxG белки и, 235

— варианты гистонов инфузорий и, 135

— компенсация дозы и, 310

— метилирование ДНК у N. crassa и, 121

— модификации гистонов и, 47

— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 373

— раковые заболевания и, 61, 388

— репарация ДНК и, 267

— РНК-полимераза II и, 198

— сайленсинг и, 95-96

— у растений, 179

— формирование гетерохроматина и, 109-110

Метилтрансферазы с перестроенными доменами (DRM), 178, 186

Методы лечения, эпигенетические, 459-461

Миелоидные клетки, 390, 459

Миелоидный диспластический синдром, 459

Микроиньекция, 408

Микрококковая нуклеаза, 89-90, 110

Микронуклеусы, 130-132, 135-138, 140-141

МикроРНК, 377

Микрочипы, 338, 451

Минус (-) тип спаривания, 108

Митоз, 264-265, 273-276

Митотическая контрольная точка. См. Контрольная точка сборки веретена (SAC)

Млекопитающие

— trxG белки у, 235-236

— веб-сайты с информацией о, 467

— геномный импринтинг у, 349-365

— изменения, ассоциированные с репрограммированием ядер у, 416-417

— компенсация дозы у, 288, 313-330

— организация генома, 54

— получение из терминально-дифференцированных клеток, 411-414

— процедуры пересадки ядер для, 406-409

— репрограммирование у, 369, 371

— фенотипы клонированных. 410-411

— формирование неоцентромер у, 272

Модели распознавания, RNAi и, 160-161

Модельные системы, 36-38, 170-171

Модификации, 60-61, 317. См. также Модификация гистонов; Конкретные процессы

Модификация гистонов В-клетки, 398-399

— CpG-островки и, 455-456

— PcG и trxG и, 54-57, 231-232

— RAG2 и, 395

— Х-инактивация и, 296-298, 325-327

— геномный импринтинг и, 353-354, 362

— конститутивный vs. факультативный гетерохроматин, 323-325

— ломкой Х-хромосомы синдром и, 436-437

— общий обзор, 36, 46-48, 192

— репрограммирование

— сперматозоидов и, 377-378

— сайленсинг у C. elegans и, 296-98

— сайленсинг у Drosophila и, 95-96

— сайленсинг у S. pombe и, 108

— сайты для, 41

— сокращение локуса и, 395-396

— сперматогенез и, 298 т

— аблица, включая ссылки, 468-473

— темы в, 203-205

— транскрипционные факторы и, 388

— утрата отцовской хромосомы и, 281-282

— центромерный хроматин и, 274-275

— энзимы для модификации у растений, 178

— эпигенетическая регуляция у Arabidopsis и, 174

Мозаицизм, обусловленный эффектом положения (PEV)

— Drosophila и, 27, 37 ТРЕ и, 269

— исторические симпозиумы и, 14-15

— общий обзор, 90-91, 101

— определение, 88

— супрессия, 269

— Х-инактивация и, 88

— хромосомные белки, 90-91, 97-98

«Молчащие» кассеты, типы спаривания и, 75-77

— исторические симпозиумы и, 15

Мутагенез, 173, 176, 344

Мухи-сциариды, 281

Мыши

— Blimp 1 и, 372-374

— MSUD у, 283

— PcG гены у, 220

— Х-инактивация у, 317-318, 329

— веб-сайты с информацией о, 467

— геномный импринтинг и, 350-351, 356

— исследования раковых заболеваний и, 452

— как модельный организм, 37

— организация генома, 54

— получение моноклональных из зрелых клеток, 412-413

— ранняя детерминация зародышевых клеток у, 372

— регуляция функции теломер у, 269-270

— сайленсинг у, 283

— со «шпилечными» хвостами, 350-351

Нанохромосомы, 138

Наследственность, 34, 82-83, 133-134, 187-188. См. также Цитоплазматическая наследственность

Негенетические различия, примеры, 35

Независимая от репликации (RI) сборка нуклеосом, 250-251

Независимый от оплодотворения эндосперм (fie), 215

Нейральные стволовые клетки (NSC). 225

Нейроны, 30, 412-413, 434-435

Нейротрофный фактор из мозга (Bdnf), 343

Неклеточно-автономный сайленсинг 184

Некодирующие РНК

— siRNAsH, 112

— Х-инактивация и, 317

— болезни и, 430

— геномный импринтинг и, 359-362

— гетерохроматинизация и, 53

— компенсация дозы и, 307-309

— сперматогенез и, 377

— функция, 34, 425-426

Неопластическая трансформация, 35, 60-61, 224, 452-453. См. также Раковые заболевания

Неоцентромеры, 272, 276-277

Неслучайная Х-инактивация, 324, См. также Импринтированная Х-инактивация

Неспаренная ДНК, 282-283

Неточные делеции, 137-138

Нокауты, 37, 124, 135, 270, 379-380

Нуклеазы, 71, 74, 89-90, 110

Нуклеосомы

— CENP-A и, 274-275

— H3K36 метилирование и, 197-198

— trxG белки и, 240-241

— архей vs. эукариот, 248-250

— ацетилирование и, 194

— исторические симпозиумы и, 15

— определение, 39

— ремоделинг хроматина, 49

— структура, 40

Облегчение транскрипции хроматина (FACT), 49, 204

Оболочки ядра, 81-82

Обонятельные нейроны, 30, 412-413

Общие миелоидные прогениторы (CMPs), 390

Овцы, клонирование, 407-408

Ограничение по калориям, 84

Однонуклеотидные полиморфизмы (SNPs), 353

Однородительская дисомия, 424, 427-428

Окно возможностей, 329

Онкогенез, 18, 60-61, 235. См. также Раковые заболевания

Ооциты

— IАР ретротранспозон у 377

— асимметричное распределение и, 377

— деметилазы ДНК и, 417

— млекопитающих, 369-370

— процедуры ядерных пересадок и, 406-407, 417-418

Оплодотворение, 131-132, 170, 378

Опухоли, 35, 60-61, 224, 362, 452-455. См. также Раковые заболевания

Организация генома

— веб-сайты с информацией, 466-467

— гетерохроматин и, 45 сравнение, 54

— эпигенетический контроль и, 62

Остановки, Х-инактивация и, 327

Острая миелоидная лейкемия, 447

Острая промиелоцитарная лейкемия. 56, 447

Осы, утрата отцовских хромосом у, 281-282

Отбор, 34, 315, 321

Память, 20. См. также Клеточная память

Парамутация, 14, 30, 35, 177, 187

Паратиреоидизм, 431

Партеногенез, 355-356, 369

Первичная неслучайная

Х-инактивация, 321, 324

Перекрестное оплодотворение, 131

Перемещаемые элементы. См. также Ретротранспозоны

— N. crassa и, 116

— P-элементы как, 89 RIP и, 123-124

— RNAi у растений и, 186

— геномные перестройки и, 139-140

— геномы млекопитающих и, 53-54

— исторические симпозиумы, 21, 27

— метилирование ДНК и, 50

— модификации гетерохроматина и, 164

— «нацеливание» формирования гетерохроматина и, 99-100

— неопластическая трансформация и, 59-60

— растения и, 36, 184

— ремоделинг хроматина и, 163, 364

— сайленсинг и, 53

Перестройки, 133, 138-139, 272

Перицентромерные фокусы, 56

Петунии, 153, 156, 173, 177

Пиримидиновые димеры, 267

Плазма, Blimp 1 и, 372-374

Плазматические клетки, 398-400

Плазмодесмы, 172

Пластичность, 54, 56, 59, 400-401

Плейогомеотические (РНО) белки, 220

Плече-лопаточно-лицевая миопатия, 436-437

Плюрипотентность

— лимфоциты и, 390

— определение, 369

— развитие лимфоцитов и, 390

— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 372-374

— развитие стволовых клеток и, 379-382

— репрограммирование и, 58-59, 381-382 сперматогенез и, 376

Плюрипотентные стволовые клетки, 379-382

Плюс (+) тип спаривания, 108

Повторяющиеся элементы, 54, 108-109, 111-112, 137

Подавление, 116, 121-122

Подвижные генетические элементы. См. Перемещающиеся элементы

Поддержания минихромосом (МСМ) белки, 266

Поддерживающее метилирование, 120, 178, 335, 361

Подобные плейогомеотическим (PHOL) белки, 220

Полигомеотические (PH) белки, 219

Полимеразы, 186. См. также конкретные PH К-полимеразы

Полиплоидия, 170, 172

Политенные хромосомы, 35

Полицентричные хромосомы, определение, 265

Половое воспроизведение, преимущества, 314-315

Половые тельца, 257

Посттранскриппионный сайленсинг генов (PTGS). См. также RNAi

— Drosophila и, 99

— RNAi-опосредованный сайленсинг у растений и, 182-183

— деградация РНК и, 52

— дробянковые дрожжи и, 113

— как эквивалент RNAi у растений, 177

— общий обзор, 153

Посттрансляционные модификации

— ацетилирование, деацетилирование и, 193-195

— гистоны и, 192-193

— деиминирование, 47, 202, 379-380

— метилирование и, 196-202

— темы в, 203-205

— убиквитинирование, сумоилирование и, 202-203

— фосфорилирование и, 195

Почкующиеся дрожжи. 74-77. См. также Saccharomyces cerevisiae

Прадера-Вилли синдром, 427-430

Пре-BCR, 397

Превращение пола, 281-282

Пререпликационный комплекс 2 (PRC2)

— Х-инактивация и, 325, 327

— геномный импринтинг и, 223

— деацетилазы гистонов (HDACs) и, 215

— развитие растений и, 217

— ремоделинг хроматина и, 218

— ретинобластомы (Rb) белки и, 224-225

Преформизм, 369, 372

Примордиальные зародышевые клетки

— Blimp 1 и, 372-374, 398-400

— Х-реактивация, 329

— детерминация, 372

— плюрипотентные, 369, 374-375

— плюрипотентные клеточные линии из, 380-381

— развитие, 372-374

Прионы, 19, 21, 31, 34

Проблемы исследований, 64-65

Прогениторы Гранулярных Нейронов Мозжечка (CGNPs), 225

Прогерия, 56

Продолжительность жизни. См. Старение

Происхождение распознающих комплексов (ORC), 75-76, 78, 80, 266, 269

Пролиферация, 55, 223-225

Промоторы, CpG-островки и, 339

Протоперитеции, 116

Процесс репликации ДНК

— MBD1 и, 341-342

— варианты гистонов и, 49

— контроль, 266-267

— метилирование и, 30

— откладка гистонов и, 250-251

— ретротранспозоны и, 268

— у растений, 182

Псевдоаутосомный район. 317

Псевдогипопаратиреоидизм, 428, 431

Псевдокинетохоры, 282

Психические болезни, внешняя среда и, 425

Пузырьки, 266

ПЦР, 338, 459

Рабдомиосаркома, 430

Развитие

В-клеток, 390-392

PcG-репрессия и, 218-219, 223-226

история эпигенетики и, 27

метилирование ДНК и, 337-338

органа из одной клетки, 388-390

регуляция X-инактивации у млекопитающих и, 317

репрограммирование и, 417

Размеры геномов, 54

Разнообразие. См. Разнообразие антител

Раковые заболевания

— CpG-островков метилирования, 339

— H3K27 метилирование и, 200

— MLH1 ген и, 437, 450, 453-454

— PRC комплексы и, 57, 219-223

— trxG гены и, 223, 235

— гиперметилирование и, 61, 449-452

— деметилазы и, 200

— исторические симпозиумы и, 18

— метилирование ДНК и, 334, 344.

— 448-449, 459

— метилтрансферазы и, 61, 388, 449, 459

— обзор, 60-61

— причины их, 446-447

— сайленсинг и, 452-458

— темы исследований, 458

— трансплантация ядер и, 413-414

— хроматин и, 447-448

— эпигенетические методы лечения, 459-461

Распространение гетерохроматина, 79-80, 88-89, 96-97

Распространения и отступления модель, 327

Растана модель блокирующего фактора, 320-321

Растения. См. также Arabidopsis RNAi-опосредованного сайленсинга пути, 182-187

— выгоды от использования для исследований, 170-177

— геномный импринтинг и, 350

— жизненный цикл, 172

— как модельные организмы, 36

— молекулярные компоненты хроматина у, 177-182

— не-РНК эпигенетическая регуляция, 187

— участие PRC2s в развитии, 217

— эволюция центромер у, 276

— эпигенетическая регуляция у, 170

Реверсия, 20

Регулятор гистонов A (HIRA), 275, 378

Регуляторы «Молчащей» Информации (SIR)

— белки ацетилирование гистонов и, 80

— ацетилирование, деацетилирование и, 79-80, 195, 198

— гетерохроматиновая репрессия и, 75-77

— деацетилирование гистонов и, 78-79

— заякоривание гетерохроматина и, 83

— исторические симпозиумы и, 17-19

— как пример, 36

— «молчащий» хроматин и, 78

— репрессия и, 75, 77-80

— старение и, 83-84

— структура семейства, 75-76

— теломерный эффект положения (ТРЕ) и, 79

— ядерная локализация, 81-82

Рекомбинация, 72, 355, 388, 382-395

Релокализация, генов

иммуноглобулинов, 395

Ремоделинг хроматина

— В-клетки и, 398-399

— PRC2 и, 218 trxG

— белки и, 236-240

— Xist и, 57

— АТФ-зависимые комплексы, 42, 49, 233, 237-240, 309

— белки ремоделинга хроматина у растений, 181

— болезни и, 34

— варианты гистонов и, 49-50

— исторические симпозиумы и, 29

— компенсация дозы и, 303-306

— метилирование ДНК и, 340

— неопластическая трансформация и, 59-60

— определение, 34

— перемещающиеся элементы и, 364

— разнообразие рецепторов антигенов и, 392-395

— транскрипционный контроль и, 204

— факторы ремоделинга и, 49

— эпигенетическая регуляция у Arabidopsis и, 174-175

Ремоделинга хроматина комплексы, 49-50

Репарация ДНК

— Н2АХи, 255-257

— MBD4 и, 343-344

— раковые заболевания и, 446

— структура хроматина и, 267-268

Репликационного Белка А комплекс, 181

Репликация. См. Процесс репликации ДНК

Репортерные гены, дрожжи и, 72-73, 75

Репрессия. См. также Polycomb репрессивные комплексы

— В-клеток развитие и, 392, 399

— Вс16 и Blimp1 и, 399-400

— LSD1 и, 200

— SIR-белка концентрация и, 79-80

— trxG белки и, 243

— выпетливание теломер и, 80-81

— гетерохроматина, 75-77

— консерватизм, 374-375

— метилирование ДНК и, 340-344

— метилирование и, 199-200

— модификации гистонов и, 192

— сумоилирование и, 202-203

— типы спаривания дрожжей и, 75-77

Репрессор сайленсинга (ROS1), 178

Репрессор-активатор-белок 1 (Rapl), 77-80

Репрограммирование. См. также Трансплантация ядер в клонах, 409, 416

— общий обзор, 58-59

— от зиготы до бластоцисты, 379

— плюрипотентность и, 58-59, 375-376, 381-382

— после оплодотворения, 378

— потенциал для тотипотентности и, 412

— состояние дифференцировки донорской клетки и, 411-413

— стабильность Х-инактивации, 328-329

— стволовых клеток, 381-382

— тотипотентность и плюрипотентность, 369

— у амфибий, 414-416

— у млекопитающих, 416-417

Репродуктивное клонирование, 418-421

Рестрикционные энзимы, 338

Ресурсы и базы данных по геномам организмов, 466-467

Ретинобластомные (Rb) белки, 224-225

Ретродифференцировка, 411

Ретротранспозоны, 44. 94, 271, 385, 387

Ретта синдром, 334, 342-343, 432-434

Рецепторы ростового фактора, 235

РНК-зависимая РНК-полимераза (RDRP), 52, 123, 155, 162, 282, 295

РНК-зависимый сайленсинг у C. elegans, 283

РНК-индуцируемый сайленсирующий комплекс (RISC), 154, 183, 185

РНК-индуцируемый эффектор транскрипционного сайленсинга (RITS), 110, 112, 114, 154, 158-161, 199, 437

PHК - метилтрансферазы, 51

РНК-направляемое метилирование ДНК(RdDM), 52-53, 183, 186-187

РНК-направляемое РНК-полимеразный комплекс (RDRC), 114, 159-161

РНК-нокдаун. См. Посттранскрипционный сайленсинг

РНК-полимераза, 162-163, 165, 175

РНК-полимераза II

— H3K36 метилирование и, 197-198

— H3K4 метилирование и, 196-197

— HKMTs и, 198 PcG белки и, 243

— факторы, влияющие на элонгацию, 204

— центромерные повторы и, 113

РНК-полимераза IV, 53, 186-187

Родительские геномы, 338

Родительский импринтинг. См. Импринтинг

Родительского конфликта теория, 181, 356

Рост, регуляция геномным импринтингом, 355

Ростовые сигналы, раковые заболевания и, 446

Рубинштейна-Тайби синдром, 432

Сайленсерные элементы, 75-77

Сайленсинг генов. См. Сайленсинг

Сайленсинг у инфузорий и источники 154

Сайленсинг у инфузорий и теломеры и 52

Сайленсинг у инфузорий и 139

Сайленсинг. См. также Компенсация дозы; Посттранскрипционный сайленсинг; RNAi; Транскрипционный сайленсинг генов (TGS); Индуцируемый вирусом сайленсинг генов; Х-инактивация

— PcG и trxG и, 55, 57, 223

— PRC1 и, 223 RNAi и, 36, 52-53, 139

— Х-инактивация как, 314

— Х-хромосом у C. elegans, 289, 296-298

— аккумуляция в Xi, 326

— белки кинетохорных доменов и, 110-111

— в центромерах дробянковых дрожжей, 108

— геномный импринтинг и, 353-365

— гетерохроматин и, 40, 88-90

— движение экспрессируемых генов и, 44

— зависимый от гомологии у инфузорий, 139

— избыточность и, 329

— исторические симпозиумы и, 17

— компенсация дозы и, 287-288

— ломкой Х-хромосомы синдром и, 436-437

— мейотический посредством неспаренной ДНК (MSUD), 122-123

— метилирование ДНК и, 340-344

— метилирование и, 51-52

— механизмы, 115-116, 177

— модификации гистонов и, 95-96

— наследование измененного

— расположения ресничек у, 27, 133-134

— неклеточно-автономный, 184

— паттерны в теломерах, 80

— посредством неспаренной ДНК во время мейоза, 282-283

— раковые заболевания, 452-458

— растения и, 53

— субнуклеарная релокализапия и, 395

— температура и, 90

— транскрипция неспаренной ДНК и, 282-283

— у S. pombe, 108

— формирование субкомпартментов и, 83

— хромосомные белки и, 90-93

— центромерные внешние повторы и, 111-112

— эпигенетика и, 31

Сателлитная ДНК, ICF синдром и, 434-435

Сверхчисленные половые гребешки (ESC), 215, 296-297

Сдержек и противовесов механизм, 329

Сегрегация

— CenH3 и, 252-253

— H2AZ и, 258

— ахиазматическая, 278-280

— в мейотическом процессе, 278-281

— гетерохроматиновое спаривание и, 270-281

— нормальная, 265

— результаты аномальной, 264

— у Drosophila, 279-281

— утрата гетерохроматина, 115, 156

Серотипы, 133

Сигналинг, лимфопоэз и, 400-403

Сигнатуры, модификации гистонов и, 46

Силвера-Рассела синдром, 428, 431

Синаптонемные комплексы, 277-278

Сканирования генома модель. См. scnRNA модель

Сканирования транскриптома модель, 147-148

Случайная Х-инактивация, 319-321

Сниженное метилирование ДНК 1 (DDM1), 161-162, 179, 348

События мозаичной экспрессии. См. Мозаицизм, обусловленный эффектом положения

Сокращение локуса, 395-396

Соленоидные модели организации хроматина, 43

Сомаклональная изменчивость, растения и, 172, 188

Соматическая гипермутация, метилирование и, 51

Соматические DMRs, геномный импринтинг и, 361

Соматические клетки, 27-28, 141-144, 405-409

Соматическое репрограммирование.

См. Репрограммирование

Соннеборн (Sonnebom, Т.М.), 131-132

Состояние покоя, репрограммирование и, 58-59

Сперматогенез

— Н2АХ и, 257

— IAP ретротранспозон в, 378

— Х-инактивация и, 319-320

— геномный импринтинг и, 354

— гетерохроматиновые сайты спаривания и, 278-279

— гиперконденсация во время, 298

— замещение гистонов и, 260

— эпигенетическая модификация во время, 376-377

Специфичных для мужского пола летальных (MSL) генов комплекс, 303-309

Спиротрихи, 138

Споруляция, 74

Старение, 56, 83-84, 362, 438

Стволовые клетки, 54-55, 225-226, 379-382. См. также Эмбриональные стволовые клетки «

Стебель-петля»-связывающийся белок (SLBP), 250

Стихотрихи, 137

Структурная наследственность. 133-134

Субероиланилид-гидроксамовая кислота (SAHA), 460

Субтрактивные методы, 451

Судьбы. См. Соматическое репрограммирование

Сумоилирование, 192, 202-203, 354

Сумчатые, 51, 276, 316-318, 328, 355-356

Супрессорные гены, раковые заболевания и, 449-450

Сцепленная с Х-хромосомой адренолейкодистрофия, 425

Сцепленная с Х-хромосомой задержка умственного развития, 434

Сцепленные с Х-хромосомой гены, возможные способы уравнивания для, 316-317. См. также Компенсация дозы

Талассемии, 421, 432, 434-436

Теломера-ассоциированные последовательности (TAS), 99, 112, 268

Теломеразы, 78, 268

Теломерный эффект положения, 72, 93, 269

Теломеры

— Drosophila и, 99

— siRNAs и, 53

— trans-взаимодействие, 81-82

— выпетливание, 80-81

— исторические симпозиумы и, 17

— контроль структуры и функции, 268-269

— репрессия и, 82

— сборка, 78

— функция, 44

— хромосомная наследственность и, 266

Температура, сайленсинг и, 90

Терапевтическое клонирование, 418-421

Терапия с использованием трансплантации ядер, 418-421

Терминальный цветок 2 (TFL2), 182

Тесты с иммунопреципитацией хроматина (ChIP), 17, 20, 48, 193, 197, 199, 201

Типы спаривания (МАТ). См. также Коньюгация

— N. crassa, 116

— RNAi и, 158

— S. pombe и, 108

— инфузории, 133, 143

— переключение, 36, 74-75

— эпигенетический контроль репрессии, 75-77

Титин, 242

Т-клеток развитие, 388

Токсины, Caedibacter, 133

Токсины, P. aurelia, 133

Толстой кишки рак, 451, 453-455

Тотипотентность, 54, 369, 412

Точные делеции, 137

Транзитивность, 184

Транс-активные siPHK (ta-siRNAs), 186

Трансгеном индуцируемый сайленсинг, 139-140

Трансдетерминация. 212

Транскрипционная интерференция, 364

Транскрипционная память. См. Клеточная память

Транскрипционного фактора (TF) размещение, 46

Транскрипционные факторы

— Rapl, 77-80

— SWI/SNF-комплексы как, 239-240

— trithorax (trxG) белки как, 243

— trxG белки как, 243

— варианты гистонов у инфузорий, 135

— интерференция метилирования ДНК с, 340-341

— лимфопоэз и, 389, 390-392

— модификации гистонов и, 192

— роль в эпигенетическом контроле. 390-392

Транскрипционный контроль, 257-258, 343

Транскрипционный сайленсинг генов (TGS). См. также ДНК и метилирование гистонов

— Alcohol dehydrogenase (Adh) трансгены и, 99

— PcG-комплексы и, 219-223 RNAi и, 112

— RNAi-опосредованный сайленсинг у растений и, 182-183

— Х-инактивация, 323-324

— гетерохроматин и, 52

— общий обзор, 153-154

Транскрипция

— Вс16 и Blimp 1 и, 398

— PRC1 и, 219

— SWI/SNF-комплексы и, 236-239

— trithorax (trxG) белки и, 242

— trxG белки и, 235-236

— аберрантная активация, 224-225

— ацетилирование и деацетилирование и, 193-195

— внутренний элиминируемый сегмент (IES) и, 53

— выравнивание генных продуктов и, 302, 305-306

— зависимая от метилирования репрессия, 343

— изменения в структуре хроматина и, 204-205

— изменения у с репрограммированием, 414-417

— метилирование ДНК и, 340

— механизм, 302

— модификации гистонов и, 40

— регуляция гистонами и ацетилированием, 193-195

— сайленсинг и, 52-53

— эухроматин и, 45

Транслокации, 327-328, 350-351, 447

Трансплантация ядер

— геномный импринтинг и, 352

— изменения, ассоциированные с, 414-417

— медицинские следствия, 418-421

— процедуры для, 406-409

— раковые заболевания и, 413-414

— соматическое репрограммирование и, 58-59

— фенотипы клонированных животных и, 409-414

— эпигенетическая память и, 417-418

Трансформирующая ДНК, 121 -122

Трихлоростатин A (TSA), 113, 115, 121, 325, 328-329

Трихогины, 116 тРНК, 109

Трофобласта защиты теория. 356

Трофэктодермы (ТЕ) слои, 371-372, 379-380

Т-хелперные клетки, 338, 343

Тэйтум и Бидл (Tatum, Beadle), 116

Убиквигин ЕЗ лигаза (UBE3A), 429, 454

Убиквитинирование

— Х-инактивация и, 324-325, 328

— общий обзор, 192, 202-203

— репарация ДНК, 267, 446

— сайты в гистоновых «хвостах», 41

Уилмса опухоли, 430. См. также Прадера-Вилли синдром

Упаковка, 248

Урацил-ДНК-гликозилазы, 343

Уремия, 438

Утрата гетерозиготности, 452

Утрата импринтинга (LOI), 60, 452

Утрата октамера, 204

Фактора Сборки Хроматина (CAF) комплекс, 83, 181, 250-251, 275, 378

Фактор-A специфичности расщепления-полиаденилирования (CPSF-A), 162

Факторы связывания, защита CpG-островков и, 339

Факультативный гетерохроматин, 40, 57-58, 323-325, 327

Фибробласты, 407, 411 Фолат, 435, 438

Фосфатазы (РРТазы), 42, 97

Фосфоинозитол 3-киназа-подобных киназ семейство, 255

Фосфорилирование, 40, 195-196, 255-257

Фотопериода путь, 216

Фотопериод-независимое раннее цветение (PIE), 181

Фрагментация. См. Фрагментация хромосом

Фрагментация хромосом, 138

Хиазматическая сегрегация, 278

Химеры, растения и, 172 «Храповик Меллера», 315

Хроматин. См. также «Молчащий» хроматин

— ICF синдром и, 434-435

— PcG и trxG и, 55-57

— Т-клеточные рецепторы (TCR) и 388

— trxG белки и, 236-242

— Х-инактивация и, 322-325

— Xist ген и, 322

— АТФ-зависимые комплексы ремоделинга и, 235

— болезни и, 426 в центромерах, 272-275

— веб-сайты с информацией о, 465

— влияние RNAi на структуру, 158-165

— влияние структуры на транскрипцию, 204-205

— ДНК vs., 40

— изменения при репрограммировании, 415

— история эпигенетики и, 14, 18, 34

— как матрица, 39-40

— клеточная память и, 63-65

— ломкой Х-хромосомы синдром и, 426, 436-437

— метилирование ДНК и, 339-340

— модификации гистонов, 49-50, 192

— молекулярные компоненты у растений, 177-182

— недостаточность по метилентетра-гидрофолатредуктазе и, 435

— общий обзор, 34, 38, 192 определение, 191

— организация, 39-44 плече-лопаточно-лицевая миопатия, 437

— раковые заболевания и, 447-448

— Ретта синдром и, 432-434

— Рубинштейна-Тайби синдром и, 432

— талассемии и, 435-436 функция, 34

— Шимке спондилоэпифизарная дисплазия и, 435

— эпимутации и, 437

— эухроматин vs. гетерохроматин и, 44-46

Хроматоидные тельца, 377

Хромодомены

— H2AZ и, 258

— H3K36 метилирование и, 197-198

— ORF «нацеливание» и, 195

— PcG и trxG и, 55, 218, 220

— компенсация дозы и, 304-305

Хромометилазы, 178

Хромосомных разрывов последовательности (CBS), 137-138

Хромосомы. См. также Сегрегация аномальная, 264

— изменения при репрограммировании, 415

— метилирование, 51

— метилирование ДНК, 343-344

— механизм наследования, 264-266

— «нацеливание» компенсации дозы», 307-309

— обзор организации, 35 организация, 314

— перестройки, 272

— полиплоидия и, 170

— политения, 35

— последовательности вздутий, 282

— разрывы хромосом и болезни, 434-435

— распределение trxG белков, 239

— родительская утрата, 281-282

— родительское происхождение и, 16

— стабильность, 344

— фрагментация у инфузории, 138-139

— эволюция Y-хромосомы, 315

— элементы, необходимые для наследования, 264-266

Цветение, яровизация и, 216-217

Центромерные внешние повторы, сайленсинг и, 111-112

Центромеры H3-варианты и, 252-254

— ахиазматическая сегрегация и, 278-280

— регуляция идентичности, 276

— состав у дробянковых дрожжей, 113-115

— структура, функция и воспроизведение. 275-276

— функция, 44

— хроматина состав в, 272-275

— хромосомная наследственность, 265

— эволюция, 276-277

— эукариотная структура и функция, 270-271

Цикл «разрыв-слияние-мостик», 268

Цитозин

— дезаминирование, 51, 388, 398

— метилирование и, 51, 177-178, 334-335

— раковые заболевания и, 448-449, 459

— Цитоплазматическая наследственность

— scnRNA модель и, 147

— менделевская наследственность vs., 133

— перестройки ресничек, 142-143

— серотипов, 133

— сканирования транскриптома модель и, 147-148

— следствия, 144

— у инфузорий, 132-133, 142-143

Цитоплазматические мостики. См. Плазмадесмы

Цитруллин, 202

Человеческие искусственные хромосомы (HACs), 271

Членистоногие, геномный импринтинг и, 350

Чужеродные последовательности, элиминация, 142-143

Шапероны, 83, 378

Шимке спондилоэпифизарная дисплазия и, 432, 435

«Шму» (Schmoos) [форма клеток у дрожжей], 73

«Шпилечная» РНК, 159

Эволюционно консервативные хромосомные сегменты (ECCS). 254. См. также Адаптивная эволюция

Экспрессия

— PcG-гена сверхэкспрессия и, 224

— ацетилтрансферазы гистонов (HATs) и, 29

— в В-клетках и плазматических клетках, 400-401

— геномный импринтинг и, 349-350

— импринтированных генов, 223-224

— клонирование и, 417

— контроль в лимфоцитах, 392

— локализация и, 20

— программы развития и, 377-379

— регуляция метилированием ДНК, 340-343

— регуляция Х-хромосом, 290

— эмбриональной эктодермы (Eed), 223

Экстраклеточный сигналинг, 390

Эксцизии. См. Внутренние

элиминируемые сегменты

Элементы контроля импринтов, 357-359

Элементы повторов, 81

Элонгация, PcG-сайленсинг и, 58

Эмбриогенез, 58, 322

Эмбриональные зародышевые клетки, плюрипотентные, 369

Эмбриональные стволовые клетки генерирование, 379-380

— использование в терапии, 418, 420

— метилирование de novo и, 335

— от ядерных пересадок (NT-ES), 418-421

— плюрипотентные, 369, 376, 379-382

— соматическое репрограммирование и, 58-59

— терапевтическое клонирование и, 418-421

Эмбриональный Цветок (EMF), 180, 216

Эмбрионы, 355-356, 406-407, 418

Эндонуклеазы, переключение типа спаривания и, 74-75

Энзимы, 18, 21, 29, 40, 46-48. См. также конкретные энзимы

Энхансеры

— zeste (E(Z)) семейство, 96, 179-180, 214, 224, 296-297

— аллельное исключение, 397

— мозаичности (E(var)), 90-92

— сайленсинг у C. elegans и, 296-297

Эпиаллели, 36, 177

Эпигенез, 369, 372

Эпигенетика, определение, 13, 27, 34, 38-39

Эпигенетическая память. См. Клеточная память

Эпигенетические импринты, определение, 298, 299

Эпигенетические методы терапии, для раковых заболеваний, 459-461

Эпигенетические состояния, определение, 38

Эпигенетический код, 38

Эпигенетический контроль, 62-64, 75-77

Эпигенетический ландшафт, развитие, 39

Эпигеномы, определение, 424

Эпимутации, болезни человека и, 437

Эписостояния, TSA-индуцированный сайленсинг и, 113

Эпифенотипы, 35

Эритроидные клетки, CMPs и, 390

Эссенциальный (Е) сайленсер, 77-78

Эстрогенный сигналинг, метилирование аргининов и, 201

Эухроматин

— H3K27 метилирование и, 200

— H3K4 метилирование и, 196-197

— H3K9 метилирование и, 198-200

— гетерохроматин vs., 44-46, 97, 100, 177

— «молчащий» хроматин и, 57

— определение, 34, 40, 71

Ядерная организация, общий обзор, 20-21

Ядерная эквивалентность, 405

Ядерный диморфизм, 36, 131, 135-136

Ядрышковое доминирование, 177

Яйцеклетки, 377, 407, 417-418

Яровизация (VRN), 180, 188, 214, 216-217