Эпигенетика

Брно-номенклатура для модификаций гистонов

^a Использование строчных букв для обозначения модификаций помогает отличать их как от аминокислот (идентифицируемых по их однобуквенным кодовым обозначениям), так и от гистонов (таких, например, как Н2А), для которых всегда используются прописные буквы.

^b Номенклатурное обозначение начинается (слева направо) с гистона, затем пишется остаток, затем — модификация. В тех случаях, где модифицированный остаток не известен или не важен, модификация должна следовать за гистоном, например: Н4ас и Н2Ваг1. Множественные модификации можно обозначать, просто расширяя список (например, H3K4me 3K9ac S10ph ...) по мере необходимости. Поскольку каждый отдельный модифицированный остаток начинается с прописной буквы, обозначающей аминокислоту, и поскольку сами модификации все обозначаются строчными буквами, нет необходимости в использовании запятых или точек, чтобы разделять отдельные модифицированные остатки в «слове», обозначающем комбинацию остатков; в этом случае остаток следует вставлять без добавлений (например, H3K9S10ph, чтобы указать H3, не модифицированный по Lys-9 и фосфорилированный по Ser-10).

^c Полиубиквитилированные гистоны обозначаются ubn.

^d В настоящее время гипотетично.

С изменениями и с любезного разрешения из: Turner В.М., Nat. Struct. Mol. Biol. 12: 110-112. (2005).