Помимо химии, наконец то срывается запрет на вскрытия. Вскрытие в медицинских целях впервые со времен Древней Греции возобновляется в конце XIII века. В это время итальянцы практиковали анатомические препарирования из научного интереса, и самое первое упоминание о вскрытии датируется 1286 годом. Диссекция впервые была введена в учебных заведениях Болонского университета для изучения и анатомии. XIV век стал свидетелем значительного распространения вскрытий трупов в Италии, и этим занимались не только медицинские факультеты, но и колледжи для врачей и хирургов. Конечно, немало в этом плане процессу поспособствовала и новая эпидемия чумы. Трупов стало много, и вопросов к ним тоже.
Наверное, в основе снятия религиозного и морального табу лежит решение, принятое в 1340 году папой Климентом VI, он предпринял революционную для того времени меру: санкционировал публичные вскрытия трупов жертв чумы в Монпелье, чтобы попытаться установить причину их болезни. Эта мера знаменует начало массовых официальных вскрытий тел умерших в медицинских целях. Кстати, в первых вскрытиях принимает участие и Ги де Шолиак, проливая свет в основном на анатомию, чем на причины возникновения чумы.
Чума уже была в Европе в раннем Средневековье (между 400 и 900 годами), она не уходила совсем, всегда оставаясь где-то поблизости, периодически терзая окраины и гуляя по империям, она терроризировала население, прочно войдя в списки средневековых фобий, и внезапно исчезла без объяснения причин в VIII веке. И вот после четырёхвекового отсутствия всю планету накрывает второй раунд – почти 400 лет новых эпидемий чумы, которые будут повторяться с 1348 по 1721 год с более или менее постоянной скоростью 3–4 эпидемии за столетие. Вновь появившись в Средней Азии в 1337 году, чума унесла жизни тринадцати миллионов человек, а после перенеслась в Китай. В 1347 году следуя по основным торговым путям, она уничтожила армию Золотой Орды, которая осадила генуэзцев в Каффе в Крыму. Оттуда эпидемия распространяется на Сицилию и в 1348 году достигла Франции и Испании; в 1349 году перекинулась на Германию, Центральную Европу, Англию, затем в Шотландию и Скандинавские страны в 1350 году.