История Бамако уходит своими корнями в более древние времена. Нынешний Бамако находится на территории исторической области — Страны Манде, колыбели империи Мали, и первые поселенцы обосновались здесь, видимо, в середине XIII в. Предполагают, что первые хижины появились у брода через Нигер, там, где сегодня располагается Педагогический институт.
Согласно устной традиции, эти хижины были построены охотником по имени Бамба, а селение, которое возникло на этом месте, стало называться «Бамба ко», т. е. «река Бамбы».
Существует и другое мнение, будто Бамба пришел на берег Джолибы (местное название реки Нигер) из соседнего государства Кон, поэтому жители ближних деревень стали называть это селение «Бамба-Кон». Это слово стало произноситься со временем как «Бамако». Некоторые считают, что основа этого слова — бама. На языке бамбара оно означает «крокодил». Несколько веков назад в болотистой низине водилось много крокодилов. Следовательно, «Бама ко» — «река крокодилов». В то же время ко значит «спина». Так что Бамако можно перевести еще и как «на спине крокодила».
В начале XX столетия Бамако насчитывал около шести тысяч жителей. Французы стали строить в городе большие здания из камня, добывавшегося у горы Кулуба, возвышающейся на северо-западе Бамако. В 1904 г. в Бамако пришла железная дорога. Город стал административным центром колонии Верхний Сенегал — Нигер, а в 1920 г. — столицей колонии Французский Судан.
В основном здесь жили торговцы и ремесленники. Кузнецы изготовляли оружие, сельскохозяйственный инвентарь. Далеко за пределами страны славились изделия ткачей Бамако. Прикрытые от солнца соломенной циновкой ткацкие станки можно и сегодня нередко встретить на улицах Бамако. Традиционным осталось и кожевенное производство.
В 30-е годы население Бамако приближалось к 20 тысячам жителей. Город состоял из коммерческого центра, заселенного европейцами, и окружавших его восьми африканских кварталов, застроенных домами из банка — так в Западной Африке называют строительный материал из глины, в которую добавляют солому или другие связывающие компоненты. Плоские крыши таких домов представляли собой террасы.
Город стал быстро расти в послевоенный период. Лейтенант-губернатор Лувю развил бурную деятельность и построил в Бамако много общественных зданий.
К концу 50-х годов нашего столетия население города достигло уже 100 тысяч человек. 31 декабря 1959 г. было завершено строительство нового, современного моста через Нигер, который в отличие от старого не затоплялся паводком и мог пропускать транспорт одновременно в обе стороны. Это помогло решить городу многие хозяйственные проблемы. Бамако перешагнул на правый берег.
Раскол Федерации Мали в 1960 г. вызвал переселение из Сенегала в Бамако, столицу Республики Мали, большого количества семей малийского происхождения, которые на не застроенных тогда пространствах западной части города образовали новый квартал Лафиабугу (на языке бамбара — «место освобождения»). В 60-е годы было возведено еще несколько кварталов, в том числе Бадалабугу, расположившийся на правом берегу Нигера.
Позднее строительство велось на востоке города — в квартале Корофина и на западе — в квартале Джикорони. Правительство взяло курс на застройку правого берега, и Бадалабугу окружили новые кварталы.